Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOA1P02647 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOA1P02647 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOA1P02647 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOA1P02647 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOA1P02647 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOA1P02647 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOA1P02647 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOA1P02647 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOA1P02647 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA1P02647 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA1P02647 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA1P02647 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA1P02647 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA1P02647 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA1P02647 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA1P02647 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA1P02647 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA1P02647 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA1P02647 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOA1P02647 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOA1P02647 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOA1P02647 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOA1P02647 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOA1P02647 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOA1P02647 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOA1P02647 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOA1P02647 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOA1P02647 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOA1P02647 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOA1P02647 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOA1P02647 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOA1P02647 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOA1P02647 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
APOA1P02647 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOA1P02647 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOA1P02647 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOA1P02647 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOA1P02647 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOA1P02647 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
APOA1P02647 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
APOA1P02647 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
APOA1P02647 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA1P02647 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA1P02647 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA1P02647 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA1P02647 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA1P02647 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA1P02647 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOA1P02647 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOA1P02647 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOA1P02647 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOA1P02647 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOA1P02647 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOA1P02647 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOA1P02647 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOA1P02647 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOA1P02647 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOA1P02647 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOA1P02647 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOA1P02647 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOA1P02647 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOA1P02647 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOA1P02647 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
APOA1P02647 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOA1P02647 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOA1P02647 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOA1P02647 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOA1P02647 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOA1P02647 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOA1P02647 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOA1P02647 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOA1P02647 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOA1P02647 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOA1P02647 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOA1P02647 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOA1P02647 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOA1P02647 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOA1P02647 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOA1P02647 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
APOA1P02647 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOA1P02647 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOA1P02647 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOA1P02647 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOA1P02647 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOA1P02647 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOA1P02647 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOA1P02647 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOA1P02647 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOA1P02647 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOA1P02647 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOA1P02647 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOA1P02647 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOA1P02647 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOA1P02647 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOA1P02647 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOA1P02647 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOA1P02647 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOA1P02647 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOA1P02647 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms