Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
APOA1P02647 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
APOA1P02647 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
APOA1P02647 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
APOA1P02647 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
APOA1P02647 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
APOA1P02647 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
APOA1P02647 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
APOA1P02647 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
APOA1P02647 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
APOA1P02647 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
APOA1P02647 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
APOA1P02647 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
APOA1P02647 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
APOA1P02647 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
APOA1P02647 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
APOA1P02647 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
APOA1P02647 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
APOA1P02647 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
APOA1P02647 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
APOA1P02647 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
APOA1P02647 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
APOA1P02647 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
APOA1P02647 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
APOA1P02647 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
APOA1P02647 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
APOA1P02647 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
APOA1P02647 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
APOA1P02647 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
APOA1P02647 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
APOA1P02647 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
APOA1P02647 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOA1P02647 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
APOA1P02647 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
APOA1P02647 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APOA1P02647 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
APOA1P02647 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
APOA1P02647 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
APOA1P02647 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
APOA1P02647 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOA1P02647 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
APOA1P02647 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
APOA1P02647 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
APOA1P02647 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
APOA1P02647 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
APOA1P02647 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
APOA1P02647 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
APOA1P02647 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
APOA1P02647 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
APOA1P02647 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
APOA1P02647 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
APOA1P02647 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
APOA1P02647 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
APOA1P02647 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
APOA1P02647 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
APOA1P02647 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
APOA1P02647 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
APOA1P02647 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
APOA1P02647 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APOA1P02647 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
APOA1P02647 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
APOA1P02647 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
APOA1P02647 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
APOA1P02647 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APOA1P02647 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
APOA1P02647 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOA1P02647 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
APOA1P02647 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
APOA1P02647 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APOA1P02647 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
APOA1P02647 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOA1P02647 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOA1P02647 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
APOA1P02647 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOA1P02647 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
APOA1P02647 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOA1P02647 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOA1P02647 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOA1P02647 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOA1P02647 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOA1P02647 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOA1P02647 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
APOA1P02647 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
APOA1P02647 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOA1P02647 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
APOA1P02647 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APOA1P02647 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
APOA1P02647 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
APOA1P02647 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
APOA1P02647 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOA1P02647 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOA1P02647 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOA1P02647 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOA1P02647 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOA1P02647 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOA1P02647 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOA1P02647 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOA1P02647 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOA1P02647 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOA1P02647 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms