Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms