RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000456943.6

GMDS-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GMDS-AS1, Length 2,308 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.65■■■■□ 3.78
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.63■■■□□ 2.97
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.54■■■□□ 2.8
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.98■■■□□ 2.71
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.8■■■□□ 2.68
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.72■■■□□ 2.67
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.49■■■□□ 2.63
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ABCC9O60706 1549 aa31.43■■■□□ 2.62
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NACADO15069 1562 aa31.22■■■□□ 2.59
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SCRIBQ14160 1630 aa30.93■■■□□ 2.54
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.89■■■□□ 2.54
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.68■■■□□ 2.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.27■■■□□ 2.44
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.96■■■□□ 2.39
GMDS-AS1-201ENST00000456943 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.88■■■□□ 2.37
GMDS-AS1-201ENST00000456943 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.85■■■□□ 2.37
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SMARCA4P51532 1647 aa29.68■■■□□ 2.34
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.67■■■□□ 2.34
GMDS-AS1-201ENST00000456943 WIZO95785 1651 aa29.65■■■□□ 2.34
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.51■■■□□ 2.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.29■■■□□ 2.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SMARCA2P51531 1590 aa29.12■■■□□ 2.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.07■■■□□ 2.24
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.03■■■□□ 2.24
GMDS-AS1-201ENST00000456943 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
GMDS-AS1-201ENST00000456943 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TRIM41Q8WV44 630 aa28.85■■■□□ 2.21
GMDS-AS1-201ENST00000456943 HMGXB3Q12766 1538 aa28.8■■■□□ 2.2
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NCAPD3P42695 1498 aa28.76■■■□□ 2.2
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ABCC8Q09428 1581 aa28.54■■■□□ 2.16
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.48■■■□□ 2.15
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.37■■■□□ 2.13
GMDS-AS1-201ENST00000456943 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.34■■■□□ 2.13
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CFTRP13569 1480 aa28.22■■■□□ 2.11
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PRDM2Q13029 1718 aa28.21■■■□□ 2.11
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SYNJ1O43426 1573 aa28.2■■■□□ 2.11
GMDS-AS1-201ENST00000456943 EEA1Q15075 1411 aa28.15■■■□□ 2.1
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TOP2BQ02880 1626 aa28.09■■■□□ 2.09
GMDS-AS1-201ENST00000456943 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.08■■■□□ 2.08
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.05■■■□□ 2.08
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SOGA1O94964 1423 aa28.04■■■□□ 2.08
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CUX1P39880 1505 aa27.9■■■□□ 2.06
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.89■■■□□ 2.06
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.89■■■□□ 2.06
GMDS-AS1-201ENST00000456943 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.87■■■□□ 2.05
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.79■■■□□ 2.04
GMDS-AS1-201ENST00000456943 GOLGA3Q08378 1498 aa27.76■■■□□ 2.04
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.76■■■□□ 2.04
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KIF21BO75037 1637 aa27.76■■■□□ 2.03
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.73■■■□□ 2.03
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.7■■■□□ 2.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NESP48681 1621 aa27.68■■■□□ 2.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KIF27Q86VH2 1401 aa27.61■■■□□ 2.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.6■■■□□ 2.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CEP162Q5TB80 1403 aa27.58■■■□□ 2.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.56■■■□□ 2
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.55■■■□□ 2
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.52■■■□□ 2
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.5■■□□□ 1.99
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TOPBP1Q92547 1522 aa27.5■■□□□ 1.99
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.48■■□□□ 1.99
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PRXQ9BXM0 1461 aa27.47■■□□□ 1.99
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.45■■□□□ 1.99
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CUX2O14529 1486 aa27.45■■□□□ 1.99
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.42■■□□□ 1.98
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
GMDS-AS1-201ENST00000456943 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
GMDS-AS1-201ENST00000456943 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.34■■□□□ 1.97
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CLIP1P30622 1438 aa27.3■■□□□ 1.96
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.27■■□□□ 1.96
GMDS-AS1-201ENST00000456943 IGF1RP08069 1367 aa27.27■■□□□ 1.96
GMDS-AS1-201ENST00000456943 WDR97A6NE52 1622 aa27.25■■□□□ 1.95
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.18■■□□□ 1.94
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.17■■□□□ 1.94
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CUL7Q14999 1698 aa27.15■■□□□ 1.94
GMDS-AS1-201ENST00000456943 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.11■■□□□ 1.93
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.11■■□□□ 1.93
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
GMDS-AS1-201ENST00000456943 WDR62O43379 1518 aa27.02■■□□□ 1.92
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
GMDS-AS1-201ENST00000456943 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.01■■□□□ 1.92
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ERCC6Q03468 1493 aa26.98■■□□□ 1.91
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ARAP1Q96P48 1450 aa26.97■■□□□ 1.91
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
GMDS-AS1-201ENST00000456943 HRCP23327 699 aa26.94■■□□□ 1.9
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.91■■□□□ 1.9
GMDS-AS1-201ENST00000456943 APLP2Q06481 763 aa26.9■■□□□ 1.9
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.9■■□□□ 1.9
GMDS-AS1-201ENST00000456943 IFT140Q96RY7 1462 aa26.9■■□□□ 1.9
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PBRM1Q86U86 1689 aa26.9■■□□□ 1.9
GMDS-AS1-201ENST00000456943 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
GMDS-AS1-201ENST00000456943 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms