RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316412.9

PRAMEF20-201, Transcript of PRAME family member 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PRAMEF20, Length 1,597 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20-201ENST00000316412 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.47■■■■■ 4.07
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PRAMEF20-201ENST00000316412 ABCC9O60706 1549 aa34■■■■□ 3.03
PRAMEF20-201ENST00000316412 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.92■■■■□ 3.02
PRAMEF20-201ENST00000316412 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.51■■■□□ 2.95
PRAMEF20-201ENST00000316412 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.39■■■□□ 2.94
PRAMEF20-201ENST00000316412 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.3■■■□□ 2.92
PRAMEF20-201ENST00000316412 NACADO15069 1562 aa33.2■■■□□ 2.91
PRAMEF20-201ENST00000316412 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33■■■□□ 2.87
PRAMEF20-201ENST00000316412 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.56■■■□□ 2.8
PRAMEF20-201ENST00000316412 SCRIBQ14160 1630 aa32.55■■■□□ 2.8
PRAMEF20-201ENST00000316412 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.42■■■□□ 2.78
PRAMEF20-201ENST00000316412 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.06■■■□□ 2.72
PRAMEF20-201ENST00000316412 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.85■■■□□ 2.69
PRAMEF20-201ENST00000316412 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.46■■■□□ 2.63
PRAMEF20-201ENST00000316412 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.44■■■□□ 2.62
PRAMEF20-201ENST00000316412 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.28■■■□□ 2.6
PRAMEF20-201ENST00000316412 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.24■■■□□ 2.59
PRAMEF20-201ENST00000316412 SMARCA4P51532 1647 aa31.22■■■□□ 2.59
PRAMEF20-201ENST00000316412 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.2■■■□□ 2.58
PRAMEF20-201ENST00000316412 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.09■■■□□ 2.57
PRAMEF20-201ENST00000316412 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
PRAMEF20-201ENST00000316412 WIZO95785 1651 aa30.98■■■□□ 2.55
PRAMEF20-201ENST00000316412 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.9■■■□□ 2.54
PRAMEF20-201ENST00000316412 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.8■■■□□ 2.52
PRAMEF20-201ENST00000316412 SMARCA2P51531 1590 aa30.78■■■□□ 2.52
PRAMEF20-201ENST00000316412 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.74■■■□□ 2.51
PRAMEF20-201ENST00000316412 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.65■■■□□ 2.5
PRAMEF20-201ENST00000316412 NCAPD3P42695 1498 aa30.63■■■□□ 2.49
PRAMEF20-201ENST00000316412 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
PRAMEF20-201ENST00000316412 HMGXB3Q12766 1538 aa30.56■■■□□ 2.48
PRAMEF20-201ENST00000316412 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.3■■■□□ 2.44
PRAMEF20-201ENST00000316412 CFTRP13569 1480 aa29.81■■■□□ 2.36
PRAMEF20-201ENST00000316412 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.77■■■□□ 2.36
PRAMEF20-201ENST00000316412 PRDM2Q13029 1718 aa29.74■■■□□ 2.35
PRAMEF20-201ENST00000316412 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.67■■■□□ 2.34
PRAMEF20-201ENST00000316412 NESP48681 1621 aa29.66■■■□□ 2.34
PRAMEF20-201ENST00000316412 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.59■■■□□ 2.33
PRAMEF20-201ENST00000316412 ABCC8Q09428 1581 aa29.5■■■□□ 2.31
PRAMEF20-201ENST00000316412 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.44■■■□□ 2.3
PRAMEF20-201ENST00000316412 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.39■■■□□ 2.3
PRAMEF20-201ENST00000316412 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.36■■■□□ 2.29
PRAMEF20-201ENST00000316412 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.36■■■□□ 2.29
PRAMEF20-201ENST00000316412 ERCC6Q03468 1493 aa29.3■■■□□ 2.28
PRAMEF20-201ENST00000316412 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.3■■■□□ 2.28
PRAMEF20-201ENST00000316412 SYNJ1O43426 1573 aa29.29■■■□□ 2.28
PRAMEF20-201ENST00000316412 TRIM41Q8WV44 630 aa29.29■■■□□ 2.28
PRAMEF20-201ENST00000316412 CUX1P39880 1505 aa29.25■■■□□ 2.27
PRAMEF20-201ENST00000316412 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.24■■■□□ 2.27
PRAMEF20-201ENST00000316412 TOP2BQ02880 1626 aa29.23■■■□□ 2.27
PRAMEF20-201ENST00000316412 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.13■■■□□ 2.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 TOPBP1Q92547 1522 aa29.1■■■□□ 2.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.07■■■□□ 2.24
PRAMEF20-201ENST00000316412 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
PRAMEF20-201ENST00000316412 CUX2O14529 1486 aa28.99■■■□□ 2.23
PRAMEF20-201ENST00000316412 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.98■■■□□ 2.23
PRAMEF20-201ENST00000316412 WDR62O43379 1518 aa28.97■■■□□ 2.23
PRAMEF20-201ENST00000316412 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
PRAMEF20-201ENST00000316412 SOGA1O94964 1423 aa28.83■■■□□ 2.21
PRAMEF20-201ENST00000316412 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.79■■■□□ 2.2
PRAMEF20-201ENST00000316412 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.78■■■□□ 2.2
PRAMEF20-201ENST00000316412 WDR97A6NE52 1622 aa28.75■■■□□ 2.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.73■■■□□ 2.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 EEA1Q15075 1411 aa28.7■■■□□ 2.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
PRAMEF20-201ENST00000316412 KIF27Q86VH2 1401 aa28.65■■■□□ 2.18
PRAMEF20-201ENST00000316412 IFT140Q96RY7 1462 aa28.64■■■□□ 2.18
PRAMEF20-201ENST00000316412 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.57■■■□□ 2.16
PRAMEF20-201ENST00000316412 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.56■■■□□ 2.16
PRAMEF20-201ENST00000316412 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
PRAMEF20-201ENST00000316412 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.47■■■□□ 2.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 IGF1RP08069 1367 aa28.46■■■□□ 2.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.43■■■□□ 2.14
PRAMEF20-201ENST00000316412 PBRM1Q86U86 1689 aa28.42■■■□□ 2.14
PRAMEF20-201ENST00000316412 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
PRAMEF20-201ENST00000316412 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.41■■■□□ 2.14
PRAMEF20-201ENST00000316412 KIF21BO75037 1637 aa28.4■■■□□ 2.14
PRAMEF20-201ENST00000316412 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.4■■■□□ 2.14
PRAMEF20-201ENST00000316412 PRXQ9BXM0 1461 aa28.38■■■□□ 2.13
PRAMEF20-201ENST00000316412 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.38■■■□□ 2.13
PRAMEF20-201ENST00000316412 CUL7Q14999 1698 aa28.33■■■□□ 2.13
PRAMEF20-201ENST00000316412 GRIN2BQ13224 1484 aa28.33■■■□□ 2.13
PRAMEF20-201ENST00000316412 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.29■■■□□ 2.12
PRAMEF20-201ENST00000316412 GOLGA3Q08378 1498 aa28.28■■■□□ 2.12
PRAMEF20-201ENST00000316412 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.28■■■□□ 2.12
PRAMEF20-201ENST00000316412 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.26■■■□□ 2.11
PRAMEF20-201ENST00000316412 ADAMTS12P58397 1594 aa28.21■■■□□ 2.11
PRAMEF20-201ENST00000316412 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.18■■■□□ 2.1
PRAMEF20-201ENST00000316412 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.16■■■□□ 2.1
PRAMEF20-201ENST00000316412 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
PRAMEF20-201ENST00000316412 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.11■■■□□ 2.09
PRAMEF20-201ENST00000316412 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
PRAMEF20-201ENST00000316412 SYNJ2O15056 1496 aa28.04■■■□□ 2.08
PRAMEF20-201ENST00000316412 GRIN2AQ12879 1464 aa27.98■■■□□ 2.07
PRAMEF20-201ENST00000316412 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.98■■■□□ 2.07
PRAMEF20-201ENST00000316412 CHD1O14646 1710 aa27.92■■■□□ 2.06
PRAMEF20-201ENST00000316412 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
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