RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399336.8

NOMO3-202, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOMO3, Length 4,356 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-202ENST00000399336 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.22■■■□□ 2.91
NOMO3-202ENST00000399336 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.19■■■□□ 2.74
NOMO3-202ENST00000399336 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.37■■■□□ 2.61
NOMO3-202ENST00000399336 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.22■■■□□ 2.59
NOMO3-202ENST00000399336 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.9■■■□□ 2.38
NOMO3-202ENST00000399336 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.46■■■□□ 2.31
NOMO3-202ENST00000399336 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
NOMO3-202ENST00000399336 TRIM41Q8WV44 630 aa28.93■■■□□ 2.22
NOMO3-202ENST00000399336 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
NOMO3-202ENST00000399336 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.79■■■□□ 2.2
NOMO3-202ENST00000399336 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.63■■■□□ 2.17
NOMO3-202ENST00000399336 APLP2Q06481 763 aa28.44■■■□□ 2.14
NOMO3-202ENST00000399336 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
NOMO3-202ENST00000399336 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
NOMO3-202ENST00000399336 HRCP23327 699 aa28.36■■■□□ 2.13
NOMO3-202ENST00000399336 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
NOMO3-202ENST00000399336 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
NOMO3-202ENST00000399336 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
NOMO3-202ENST00000399336 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
NOMO3-202ENST00000399336 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
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NOMO3-202ENST00000399336 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
NOMO3-202ENST00000399336 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.68■■■□□ 2.02
NOMO3-202ENST00000399336 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
NOMO3-202ENST00000399336 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
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NOMO3-202ENST00000399336 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.17■■□□□ 1.94
NOMO3-202ENST00000399336 SCRIBQ14160 1630 aa27.09■■□□□ 1.93
NOMO3-202ENST00000399336 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.08■■□□□ 1.93
NOMO3-202ENST00000399336 MYT1Q01538 1121 aa27.08■■□□□ 1.93
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NOMO3-202ENST00000399336 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.87■■□□□ 1.89
NOMO3-202ENST00000399336 ERICH6Q7L0X2 663 aa26.74■■□□□ 1.87
NOMO3-202ENST00000399336 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
NOMO3-202ENST00000399336 NEFLP07196 543 aa26.68■■□□□ 1.86
NOMO3-202ENST00000399336 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
NOMO3-202ENST00000399336 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa26.56■■□□□ 1.84
NOMO3-202ENST00000399336 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
NOMO3-202ENST00000399336 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
NOMO3-202ENST00000399336 NEUROD1Q13562 356 aa26.46■■□□□ 1.83
NOMO3-202ENST00000399336 POLR3GLQ9BT43 218 aa26.41■■□□□ 1.82
NOMO3-202ENST00000399336 P3H3Q8IVL6 736 aa26.4■■□□□ 1.82
NOMO3-202ENST00000399336 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
NOMO3-202ENST00000399336 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.29■■□□□ 1.8
NOMO3-202ENST00000399336 TRIM52Q96A61 297 aa26.18■■□□□ 1.78
NOMO3-202ENST00000399336 BCANQ96GW7 911 aa26.1■■□□□ 1.77
NOMO3-202ENST00000399336 ARID3CA6NKF2 412 aa26.08■■□□□ 1.77
NOMO3-202ENST00000399336 CEP162Q5TB80 1403 aa26.07■■□□□ 1.76
NOMO3-202ENST00000399336 NACADO15069 1562 aa26.05■■□□□ 1.76
NOMO3-202ENST00000399336 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.05■■□□□ 1.76
NOMO3-202ENST00000399336 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
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NOMO3-202ENST00000399336 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.96■■□□□ 1.75
NOMO3-202ENST00000399336 ANP32CO43423 234 aa25.93■■□□□ 1.74
NOMO3-202ENST00000399336 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.93■■□□□ 1.74
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NOMO3-202ENST00000399336 MIER1Q8N108 512 aa25.9■■□□□ 1.74
NOMO3-202ENST00000399336 FBLN2P98095 1184 aa25.88■■□□□ 1.73
NOMO3-202ENST00000399336 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
NOMO3-202ENST00000399336 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.85■■□□□ 1.73
NOMO3-202ENST00000399336 SOGA1O94964 1423 aa25.85■■□□□ 1.73
NOMO3-202ENST00000399336 GOLGA3Q08378 1498 aa25.84■■□□□ 1.73
NOMO3-202ENST00000399336 EEA1Q15075 1411 aa25.83■■□□□ 1.73
NOMO3-202ENST00000399336 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
NOMO3-202ENST00000399336 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
NOMO3-202ENST00000399336 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
NOMO3-202ENST00000399336 ABCC8Q09428 1581 aa25.67■■□□□ 1.7
NOMO3-202ENST00000399336 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.66■■□□□ 1.7
NOMO3-202ENST00000399336 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
NOMO3-202ENST00000399336 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.64■■□□□ 1.69
NOMO3-202ENST00000399336 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
NOMO3-202ENST00000399336 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.61■■□□□ 1.69
NOMO3-202ENST00000399336 TONSLQ96HA7 1378 aa25.61■■□□□ 1.69
NOMO3-202ENST00000399336 WIZO95785 1651 aa25.55■■□□□ 1.68
NOMO3-202ENST00000399336 FKBP8Q14318 412 aa25.54■■□□□ 1.68
NOMO3-202ENST00000399336 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
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NOMO3-202ENST00000399336 KIF27Q86VH2 1401 aa25.45■■□□□ 1.66
NOMO3-202ENST00000399336 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.43■■□□□ 1.66
NOMO3-202ENST00000399336 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
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NOMO3-202ENST00000399336 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.37■■□□□ 1.65
NOMO3-202ENST00000399336 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
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NOMO3-202ENST00000399336 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
NOMO3-202ENST00000399336 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.28■■□□□ 1.64
NOMO3-202ENST00000399336 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.28■■□□□ 1.64
NOMO3-202ENST00000399336 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.25■■□□□ 1.63
NOMO3-202ENST00000399336 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
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NOMO3-202ENST00000399336 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
NOMO3-202ENST00000399336 CUX2O14529 1486 aa25.16■■□□□ 1.62
NOMO3-202ENST00000399336 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.15■■□□□ 1.62
NOMO3-202ENST00000399336 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
NOMO3-202ENST00000399336 MRS2Q9HD23 443 aa25.12■■□□□ 1.61
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