Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms