Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 SLC35B1-204ENST00000502406 1477 ntTSL 215.75■□□□□ 0.112e-9■■■■■ 149.8
UTP3Q9NQZ2 SLC35B1-205ENST00000503334 943 ntTSL 313.82□□□□□ -0.22e-9■■■■■ 149.8
UTP3Q9NQZ2 SLC35B1-206ENST00000504260 2424 ntTSL 213.48□□□□□ -0.252e-9■■■■■ 149.8
UTP3Q9NQZ2 CREBBP-202ENST00000382070 7598 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.088e-7■■■■■ 149.8
UTP3Q9NQZ2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.943e-7■■■■■ 149.7
UTP3Q9NQZ2 TCHP-206ENST00000544838 2077 ntTSL 222.46■■□□□ 1.197e-9■■■■■ 149.7
UTP3Q9NQZ2 DBN1-207ENST00000477391 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 318.61■□□□□ 0.571e-9■■■■■ 149.7
UTP3Q9NQZ2 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.314e-8■■■■■ 149.7
UTP3Q9NQZ2 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.157e-9■■■■■ 149.7
UTP3Q9NQZ2 RCL1-206ENST00000442869 1644 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.284e-8■■■■■ 149.7
UTP3Q9NQZ2 TCHP-202ENST00000405876 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.347e-9■■■■■ 149.7
UTP3Q9NQZ2 TCHP-201ENST00000312777 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.57e-9■■■■■ 149.7
UTP3Q9NQZ2 PTK2-250ENST00000523746 574 ntTSL 48.32□□□□□ -1.082e-10■■■■■ 149.7
UTP3Q9NQZ2 RCL1-209ENST00000473230 441 ntTSL 37.49□□□□□ -1.214e-8■■■■■ 149.7
UTP3Q9NQZ2 CCDC9-204ENST00000599398 834 ntTSL 324.11■■□□□ 1.452e-9■■■■■ 149.6
UTP3Q9NQZ2 CCDC9-202ENST00000595659 356 ntTSL 318.15■□□□□ 0.52e-9■■■■■ 149.6
UTP3Q9NQZ2 CCDC9-203ENST00000596938 457 ntTSL 311.15□□□□□ -0.622e-9■■■■■ 149.6
UTP3Q9NQZ2 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.351e-6■■■■■ 149.6
UTP3Q9NQZ2 CDC42BPA-203ENST00000366766 10610 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.189e-7■■■■■ 149.5
UTP3Q9NQZ2 CDC42BPA-205ENST00000366769 10855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.259e-7■■■■■ 149.5
UTP3Q9NQZ2 CDC42BPA-202ENST00000366764 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.289e-7■■■■■ 149.5
UTP3Q9NQZ2 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.239e-7■■■■■ 149.5
UTP3Q9NQZ2 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.439e-7■■■■■ 149.5
UTP3Q9NQZ2 BSG-210ENST00000576925 611 ntTSL 217.96■□□□□ 0.471e-6■■■■■ 149.5
UTP3Q9NQZ2 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.096e-7■■■■■ 149.5
UTP3Q9NQZ2 ERAP1-202ENST00000443439 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.986e-7■■■■■ 149.5
UTP3Q9NQZ2 NECAB3-220ENST00000606699 1022 ntTSL 219.54■□□□□ 0.729e-8■■■■■ 149.4
UTP3Q9NQZ2 NECAB3-214ENST00000493590 625 ntTSL 517.56■□□□□ 0.49e-8■■■■■ 149.4
UTP3Q9NQZ2 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.639e-7■■■■■ 149.4
UTP3Q9NQZ2 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.379e-7■■■■■ 149.4
UTP3Q9NQZ2 CARS-206ENST00000465240 658 ntTSL 213.26□□□□□ -0.299e-7■■■■■ 149.4
UTP3Q9NQZ2 RCC1L-204ENST00000616051 1610 ntTSL 229.74■■■□□ 2.353e-7■■■■■ 149.3
UTP3Q9NQZ2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.193e-7■■■■■ 149.3
UTP3Q9NQZ2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.163e-7■■■■■ 149.3
UTP3Q9NQZ2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.983e-7■■■■■ 149.3
UTP3Q9NQZ2 RCC1L-203ENST00000615250 592 ntTSL 414.81□□□□□ -0.043e-7■■■■■ 149.3
UTP3Q9NQZ2 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.252e-6■■■■■ 149.2
UTP3Q9NQZ2 FDXR-208ENST00000578473 2482 ntTSL 1 (best)22.86■■□□□ 1.254e-7■■■■■ 149.2
UTP3Q9NQZ2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.174e-7■■■■■ 149.2
UTP3Q9NQZ2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.114e-7■■■■■ 149.2
UTP3Q9NQZ2 FDXR-206ENST00000577509 1912 ntTSL 221.84■■□□□ 1.094e-7■■■■■ 149.2
UTP3Q9NQZ2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.094e-7■■■■■ 149.2
UTP3Q9NQZ2 FDXR-218ENST00000583881 1561 ntTSL 221.83■■□□□ 1.094e-7■■■■■ 149.2
UTP3Q9NQZ2 FDXR-209ENST00000579482 2157 ntTSL 220.64■□□□□ 0.894e-7■■■■■ 149.2
UTP3Q9NQZ2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.794e-7■■■■■ 149.2
UTP3Q9NQZ2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.784e-7■■■■■ 149.2
UTP3Q9NQZ2 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.724e-7■■■■■ 149.2
UTP3Q9NQZ2 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.684e-7■■■■■ 149.2
UTP3Q9NQZ2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.644e-7■■■■■ 149.2
UTP3Q9NQZ2 KIF2A-209ENST00000512541 549 ntTSL 418.6■□□□□ 0.572e-8■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 KIF2A-204ENST00000504883 783 ntTSL 29.94□□□□□ -0.822e-8■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 KIF2A-210ENST00000514082 874 ntTSL 1 (best)9.76□□□□□ -0.852e-8■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 KDM4B-212ENST00000624683 5076 nt16.63■□□□□ 0.254e-8■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.183e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CCDC117-206ENST00000453543 1026 ntTSL 232.04■■■□□ 2.722e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.722e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CARS2-218ENST00000539269 795 ntTSL 331.97■■■□□ 2.712e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.46■■■□□ 2.472e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.462e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 HLA-C-207ENST00000484378 862 nt30.12■■■□□ 2.412e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 TESK1-205ENST00000498522 2226 ntTSL 1 (best)29.09■■■□□ 2.252e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.252e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 E2F4-206ENST00000565849 639 ntTSL 328.75■■■□□ 2.199e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.142e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 RPS6KA1-210ENST00000525525 543 ntTSL 528.38■■■□□ 2.132e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 RPS6KA1-212ENST00000526040 500 ntTSL 528.38■■■□□ 2.132e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.12e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.042e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ARHGEF3-208ENST00000477440 587 ntTSL 327.15■■□□□ 1.942e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PORCN-210ENST00000486272 567 ntTSL 427.12■■□□□ 1.932e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.932e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 DENND1B-207ENST00000468589 2141 ntTSL 1 (best)27.05■■□□□ 1.921e-27■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 E2F4-213ENST00000569573 849 ntTSL 327.03■■□□□ 1.929e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.862e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SNAPC3-203ENST00000421710 730 ntTSL 526.64■■□□□ 1.862e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 HMGN1-217ENST00000489072 1014 ntTSL 326.62■■□□□ 1.854e-17■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 DPP9-222ENST00000601173 682 ntTSL 326.61■■□□□ 1.852e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 HLA-C-204ENST00000415537 782 nt26.53■■□□□ 1.842e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CDC42EP4-205ENST00000580315 1022 ntTSL 226.43■■□□□ 1.822e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 REEP5-201ENST00000261482 683 ntTSL 526.32■■□□□ 1.82e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 NUMBL-208ENST00000599594 393 ntTSL 526.13■■□□□ 1.772e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ZNF212-202ENST00000462724 860 ntTSL 526.07■■□□□ 1.762e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PXK-207ENST00000468776 1653 ntTSL 1 (best)26.06■■□□□ 1.762e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.742e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PRELID1-207ENST00000510797 712 ntTSL 325.87■■□□□ 1.732e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 C7orf31-205ENST00000444434 519 ntTSL 425.81■■□□□ 1.722e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SOCS2-209ENST00000549887 984 ntTSL 325.78■■□□□ 1.724e-17■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.724e-17■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CCDC117-204ENST00000444523 463 ntTSL 425.72■■□□□ 1.712e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.79e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 HLA-C-209ENST00000495835 1073 nt25.61■■□□□ 1.692e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SIGIRR-221ENST00000534145 701 ntTSL 225.58■■□□□ 1.692e-22■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 GATD1-210ENST00000529362 578 ntTSL 325.41■■□□□ 1.662e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 MIB2-218ENST00000505370 809 ntTSL 225.41■■□□□ 1.664e-17■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PRPSAP2-210ENST00000455992 908 ntTSL 525.38■■□□□ 1.652e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.649e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.622e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.622e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.612e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.62e-6■■■■■ 149.1
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 1535.3 ms