RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569573.1

E2F4-213, Transcript of E2F transcription factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene E2F4, Length 849 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4-213ENST00000569573 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64.08■■■■■ 7.85
E2F4-213ENST00000569573 ABCC9O60706 1549 aa57.76■■■■■ 6.84
E2F4-213ENST00000569573 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa57.57■■■■■ 6.81
E2F4-213ENST00000569573 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.92■■■■■ 6.38
E2F4-213ENST00000569573 NACADO15069 1562 aa54.48■■■■■ 6.31
E2F4-213ENST00000569573 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.35■■■■■ 6.29
E2F4-213ENST00000569573 DNAJC5BQ9UF47 199 aa54.2■■■■■ 6.27
E2F4-213ENST00000569573 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.77■■■■■ 6.2
E2F4-213ENST00000569573 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.64■■■■■ 6.18
E2F4-213ENST00000569573 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.56■■■■■ 6.17
E2F4-213ENST00000569573 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.2■■■■■ 6.11
E2F4-213ENST00000569573 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.07■■■■■ 6.09
E2F4-213ENST00000569573 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.91■■■■■ 6.06
E2F4-213ENST00000569573 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.56■■■■■ 6.01
E2F4-213ENST00000569573 SCRIBQ14160 1630 aa52.5■■■■■ 5.99
E2F4-213ENST00000569573 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa52.14■■■■■ 5.94
E2F4-213ENST00000569573 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.05■■■■■ 5.92
E2F4-213ENST00000569573 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.99■■■■■ 5.91
E2F4-213ENST00000569573 NCAPD3P42695 1498 aa50.27■■■■■ 5.64
E2F4-213ENST00000569573 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.11■■■■■ 5.61
E2F4-213ENST00000569573 SMARCA4P51532 1647 aa50.03■■■■■ 5.6
E2F4-213ENST00000569573 SMARCA2P51531 1590 aa50.01■■■■■ 5.6
E2F4-213ENST00000569573 ERCC6Q03468 1493 aa49.96■■■■■ 5.59
E2F4-213ENST00000569573 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa49.93■■■■■ 5.58
E2F4-213ENST00000569573 HMGXB3Q12766 1538 aa49.9■■■■■ 5.58
E2F4-213ENST00000569573 CUX2O14529 1486 aa49.83■■■■■ 5.57
E2F4-213ENST00000569573 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.8■■■■■ 5.56
E2F4-213ENST00000569573 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.69■■■■■ 5.54
E2F4-213ENST00000569573 NESP48681 1621 aa49.53■■■■■ 5.52
E2F4-213ENST00000569573 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.5■■■■■ 5.52
E2F4-213ENST00000569573 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.37■■■■■ 5.49
E2F4-213ENST00000569573 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.19■■■■■ 5.47
E2F4-213ENST00000569573 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP49.03■■■■■ 5.44
E2F4-213ENST00000569573 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.97■■■■■ 5.43
E2F4-213ENST00000569573 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.89■■■■■ 5.42
E2F4-213ENST00000569573 WIZO95785 1651 aa48.78■■■■■ 5.4
E2F4-213ENST00000569573 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.78■■■■■ 5.4
E2F4-213ENST00000569573 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.53■■■■■ 5.36
E2F4-213ENST00000569573 WDR62O43379 1518 aa48.37■■■■■ 5.33
E2F4-213ENST00000569573 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.33■■■■■ 5.33
E2F4-213ENST00000569573 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.32■■■■■ 5.33
E2F4-213ENST00000569573 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.24■■■■■ 5.31
E2F4-213ENST00000569573 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.18■■■■■ 5.3
E2F4-213ENST00000569573 CFTRP13569 1480 aa48.16■■■■■ 5.3
E2F4-213ENST00000569573 TRIM41Q8WV44 630 aa47.82■■■■■ 5.25
E2F4-213ENST00000569573 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.81■■■■■ 5.24
E2F4-213ENST00000569573 PRDM2Q13029 1718 aa47.67■■■■■ 5.22
E2F4-213ENST00000569573 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.63■■■■■ 5.22
E2F4-213ENST00000569573 OSCARQ8IYS5 282 aa47.59■■■■■ 5.21
E2F4-213ENST00000569573 IFT140Q96RY7 1462 aa47.35■■■■■ 5.17
E2F4-213ENST00000569573 TOPBP1Q92547 1522 aa47.29■■■■■ 5.16
E2F4-213ENST00000569573 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.24■■■■■ 5.15
E2F4-213ENST00000569573 ABCC8Q09428 1581 aa47.23■■■■■ 5.15
E2F4-213ENST00000569573 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.11■■■■■ 5.13
E2F4-213ENST00000569573 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.99■■■■■ 5.11
E2F4-213ENST00000569573 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa46.9■■■■■ 5.1
E2F4-213ENST00000569573 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.9■■■■■ 5.1
E2F4-213ENST00000569573 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.9■■■■■ 5.1
E2F4-213ENST00000569573 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.83■■■■■ 5.09
E2F4-213ENST00000569573 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.83■■■■■ 5.092e-7■■■■■ 28.9
E2F4-213ENST00000569573 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.79■■■■■ 5.08
E2F4-213ENST00000569573 ARHGEF11O15085 1522 aa46.76■■■■■ 5.08
E2F4-213ENST00000569573 FBLN2P98095 1184 aa46.69■■■■■ 5.06
E2F4-213ENST00000569573 CHD1O14646 1710 aa46.66■■■■■ 5.06
E2F4-213ENST00000569573 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.63■■■■■ 5.06
E2F4-213ENST00000569573 SOGA1O94964 1423 aa46.62■■■■■ 5.05
E2F4-213ENST00000569573 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.55■■■■■ 5.04
E2F4-213ENST00000569573 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.51■■■■■ 5.04
E2F4-213ENST00000569573 CYB5RLQ6IPT4 315 aa46.49■■■■■ 5.03
E2F4-213ENST00000569573 CUX1P39880 1505 aa46.4■■■■■ 5.02
E2F4-213ENST00000569573 WDR97A6NE52 1622 aa46.39■■■■■ 5.02
E2F4-213ENST00000569573 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.37■■■■■ 5.01
E2F4-213ENST00000569573 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.29■■■■■ 5
E2F4-213ENST00000569573 ARAP1Q96P48 1450 aa46.26■■■■■ 5
E2F4-213ENST00000569573 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.24■■■■■ 4.99
E2F4-213ENST00000569573 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.23■■■■■ 4.99
E2F4-213ENST00000569573 GRIN2BQ13224 1484 aa46.23■■■■■ 4.99
E2F4-213ENST00000569573 SYNJ1O43426 1573 aa46.15■■■■■ 4.98
E2F4-213ENST00000569573 TRHP20396 242 aaPredicted RBP46.1■■■■■ 4.97
E2F4-213ENST00000569573 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.09■■■■■ 4.97
E2F4-213ENST00000569573 SYNJ2O15056 1496 aa46.08■■■■■ 4.97
E2F4-213ENST00000569573 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.05■■■■■ 4.96
E2F4-213ENST00000569573 PBRM1Q86U86 1689 aa46.01■■■■■ 4.96
E2F4-213ENST00000569573 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.95■■■■■ 4.95
E2F4-213ENST00000569573 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.87■■■■■ 4.93
E2F4-213ENST00000569573 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.8■■■■■ 4.92
E2F4-213ENST00000569573 TOP2BQ02880 1626 aa45.64■■■■■ 4.9
E2F4-213ENST00000569573 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.63■■■■■ 4.89
E2F4-213ENST00000569573 GRIN2AQ12879 1464 aa45.62■■■■■ 4.89
E2F4-213ENST00000569573 ADAMTS12P58397 1594 aa45.56■■■■■ 4.88
E2F4-213ENST00000569573 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.46■■■■■ 4.87
E2F4-213ENST00000569573 NUP160Q12769 1436 aa45.43■■■■■ 4.86
E2F4-213ENST00000569573 CEP170Q5SW79 1584 aa45.43■■■■■ 4.86
E2F4-213ENST00000569573 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.38■■■■■ 4.86
E2F4-213ENST00000569573 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45.36■■■■■ 4.85
E2F4-213ENST00000569573 SHROOM2Q13796 1616 aa45.23■■■■■ 4.83
E2F4-213ENST00000569573 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP45.08■■■■■ 4.81
E2F4-213ENST00000569573 JPH4Q96JJ6 628 aa45.04■■■■■ 4.8
E2F4-213ENST00000569573 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.91■■■■■ 4.78
E2F4-213ENST00000569573 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP44.89■■■■■ 4.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 422.3 ms