RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505370.1

MIB2-218, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, humanhuman

TSL 2

Gene MIB2, Length 809 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIB2-218ENST00000505370 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.42■■■■■ 7.1
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MIB2-218ENST00000505370 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.47■■■■■ 5.67
MIB2-218ENST00000505370 NACADO15069 1562 aa50.18■■■■■ 5.62
MIB2-218ENST00000505370 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.12■■■■■ 5.61
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MIB2-218ENST00000505370 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.36■■■■■ 5.492e-7■■■□□ 14.8
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MIB2-218ENST00000505370 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.3■■■■■ 5.48
MIB2-218ENST00000505370 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.04■■■■■ 5.44
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MIB2-218ENST00000505370 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.31■■■■■ 5.32
MIB2-218ENST00000505370 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.8■■■■■ 5.24
MIB2-218ENST00000505370 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.77■■■■■ 5.24
MIB2-218ENST00000505370 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.64■■■■■ 5.22
MIB2-218ENST00000505370 NCAPD3P42695 1498 aa46.32■■■■■ 5.01
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MIB2-218ENST00000505370 SMARCA2P51531 1590 aa46.13■■■■■ 4.98
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MIB2-218ENST00000505370 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.82■■■■■ 4.93
MIB2-218ENST00000505370 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.79■■■■■ 4.92
MIB2-218ENST00000505370 ERCC6Q03468 1493 aa45.69■■■■■ 4.91
MIB2-218ENST00000505370 NESP48681 1621 aa45.57■■■■■ 4.89
MIB2-218ENST00000505370 CUX2O14529 1486 aa45.43■■■■■ 4.86
MIB2-218ENST00000505370 WIZO95785 1651 aa45.28■■■■■ 4.84
MIB2-218ENST00000505370 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.24■■■■■ 4.83
MIB2-218ENST00000505370 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.06■■■■■ 4.8
MIB2-218ENST00000505370 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45■■■■■ 4.79
MIB2-218ENST00000505370 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.98■■■■■ 4.79
MIB2-218ENST00000505370 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.98■■■■■ 4.79
MIB2-218ENST00000505370 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.96■■■■■ 4.79
MIB2-218ENST00000505370 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.95■■■■■ 4.79
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MIB2-218ENST00000505370 CFTRP13569 1480 aa44.5■■■■■ 4.71
MIB2-218ENST00000505370 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.49■■■■■ 4.71
MIB2-218ENST00000505370 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.47■■■■■ 4.71
MIB2-218ENST00000505370 WDR62O43379 1518 aa44.46■■■■■ 4.71
MIB2-218ENST00000505370 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.22■■■■■ 4.67
MIB2-218ENST00000505370 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.09■■■■■ 4.65
MIB2-218ENST00000505370 PRDM2Q13029 1718 aa44.04■■■■■ 4.64
MIB2-218ENST00000505370 TOPBP1Q92547 1522 aa43.66■■■■■ 4.58
MIB2-218ENST00000505370 IFT140Q96RY7 1462 aa43.57■■■■■ 4.57
MIB2-218ENST00000505370 ABCC8Q09428 1581 aa43.54■■■■■ 4.56
MIB2-218ENST00000505370 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.52■■■■■ 4.56
MIB2-218ENST00000505370 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.51■■■■■ 4.56
MIB2-218ENST00000505370 OSCARQ8IYS5 282 aa43.43■■■■■ 4.54
MIB2-218ENST00000505370 TRIM41Q8WV44 630 aa43.32■■■■■ 4.53
MIB2-218ENST00000505370 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.31■■■■■ 4.52
MIB2-218ENST00000505370 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.27■■■■■ 4.52
MIB2-218ENST00000505370 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.24■■■■■ 4.51
MIB2-218ENST00000505370 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.22■■■■■ 4.51
MIB2-218ENST00000505370 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.15■■■■■ 4.52e-13■■■■□ 20.6
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MIB2-218ENST00000505370 SOGA1O94964 1423 aa43.05■■■■■ 4.48
MIB2-218ENST00000505370 CUX1P39880 1505 aa43.03■■■■■ 4.48
MIB2-218ENST00000505370 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.03■■■■■ 4.48
MIB2-218ENST00000505370 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.95■■■■■ 4.47
MIB2-218ENST00000505370 CHD1O14646 1710 aa42.87■■■■■ 4.45
MIB2-218ENST00000505370 FBLN2P98095 1184 aa42.85■■■■■ 4.45
MIB2-218ENST00000505370 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.85■■■■■ 4.45
MIB2-218ENST00000505370 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.85■■■■■ 4.45
MIB2-218ENST00000505370 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.85■■■■■ 4.45
MIB2-218ENST00000505370 WDR97A6NE52 1622 aa42.76■■■■■ 4.44
MIB2-218ENST00000505370 ARHGEF11O15085 1522 aa42.76■■■■■ 4.44
MIB2-218ENST00000505370 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.73■■■■■ 4.43
MIB2-218ENST00000505370 GRIN2BQ13224 1484 aa42.63■■■■■ 4.42
MIB2-218ENST00000505370 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.59■■■■■ 4.41
MIB2-218ENST00000505370 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.55■■■■■ 4.4
MIB2-218ENST00000505370 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.53■■■■■ 4.4
MIB2-218ENST00000505370 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.52■■■■■ 4.4
MIB2-218ENST00000505370 PBRM1Q86U86 1689 aa42.47■■■■■ 4.39
MIB2-218ENST00000505370 SYNJ2O15056 1496 aa42.45■■■■■ 4.39
MIB2-218ENST00000505370 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.44■■■■■ 4.38
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MIB2-218ENST00000505370 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.43■■■■■ 4.38
MIB2-218ENST00000505370 SYNJ1O43426 1573 aa42.39■■■■■ 4.38
MIB2-218ENST00000505370 TOP2BQ02880 1626 aa42.39■■■■■ 4.38
MIB2-218ENST00000505370 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.39■■■■■ 4.38
MIB2-218ENST00000505370 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.38■■■■■ 4.37
MIB2-218ENST00000505370 ARAP1Q96P48 1450 aa42.36■■■■■ 4.37
MIB2-218ENST00000505370 ADAMTS12P58397 1594 aa42.11■■■■■ 4.33
MIB2-218ENST00000505370 GRIN2AQ12879 1464 aa42.09■■■■■ 4.33
MIB2-218ENST00000505370 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42■■■■■ 4.31
MIB2-218ENST00000505370 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.99■■■■■ 4.31
MIB2-218ENST00000505370 CEP170Q5SW79 1584 aa41.93■■■■■ 4.3
MIB2-218ENST00000505370 NUP160Q12769 1436 aa41.92■■■■■ 4.3
MIB2-218ENST00000505370 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.9■■■■■ 4.3
MIB2-218ENST00000505370 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.79■■■■■ 4.28
MIB2-218ENST00000505370 SHROOM2Q13796 1616 aa41.68■■■■■ 4.26
MIB2-218ENST00000505370 KIF27Q86VH2 1401 aa41.61■■■■■ 4.25
MIB2-218ENST00000505370 IGF1RP08069 1367 aa41.54■■■■■ 4.24
MIB2-218ENST00000505370 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.52■■■■■ 4.24
MIB2-218ENST00000505370 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.51■■■■■ 4.24
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