RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415537.1

HLA-C-204, Transcript of major histocompatibility complex, class I, C, humanhuman

Gene HLA-C, Length 782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-C-204ENST00000415537 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.64■■■■■ 7.46
HLA-C-204ENST00000415537 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa55.13■■■■■ 6.42
HLA-C-204ENST00000415537 ABCC9O60706 1549 aa54.62■■■■■ 6.33
HLA-C-204ENST00000415537 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.25■■■■■ 5.95
HLA-C-204ENST00000415537 NACADO15069 1562 aa52■■■■■ 5.91
HLA-C-204ENST00000415537 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.94■■■■■ 5.91
HLA-C-204ENST00000415537 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.41■■■■■ 5.82
HLA-C-204ENST00000415537 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.18■■■■■ 5.78
HLA-C-204ENST00000415537 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.07■■■■■ 5.77
HLA-C-204ENST00000415537 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.94■■■■■ 5.75
HLA-C-204ENST00000415537 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.94■■■■■ 5.75
HLA-C-204ENST00000415537 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.71■■■■■ 5.71
HLA-C-204ENST00000415537 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.62■■■■■ 5.69
HLA-C-204ENST00000415537 SCRIBQ14160 1630 aa50.27■■■■■ 5.64
HLA-C-204ENST00000415537 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.04■■■■■ 5.6
HLA-C-204ENST00000415537 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.38■■■■■ 5.5
HLA-C-204ENST00000415537 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.38■■■■■ 5.49
HLA-C-204ENST00000415537 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.15■■■■■ 5.46
HLA-C-204ENST00000415537 SMARCA4P51532 1647 aa47.99■■■■■ 5.27
HLA-C-204ENST00000415537 NCAPD3P42695 1498 aa47.96■■■■■ 5.27
HLA-C-204ENST00000415537 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.89■■■■■ 5.26
HLA-C-204ENST00000415537 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.85■■■■■ 5.25
HLA-C-204ENST00000415537 SMARCA2P51531 1590 aa47.83■■■■■ 5.25
HLA-C-204ENST00000415537 HMGXB3Q12766 1538 aa47.66■■■■■ 5.22
HLA-C-204ENST00000415537 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.5■■■■■ 5.19
HLA-C-204ENST00000415537 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.49■■■■■ 5.19
HLA-C-204ENST00000415537 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.49■■■■■ 5.19
HLA-C-204ENST00000415537 ERCC6Q03468 1493 aa47.18■■■■■ 5.14
HLA-C-204ENST00000415537 NESP48681 1621 aa47.04■■■■■ 5.12
HLA-C-204ENST00000415537 WIZO95785 1651 aa46.99■■■■■ 5.11
HLA-C-204ENST00000415537 CUX2O14529 1486 aa46.88■■■■■ 5.09
HLA-C-204ENST00000415537 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.85■■■■■ 5.09
HLA-C-204ENST00000415537 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.7■■■■■ 5.07
HLA-C-204ENST00000415537 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.57■■■■■ 5.05
HLA-C-204ENST00000415537 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.55■■■■■ 5.04
HLA-C-204ENST00000415537 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.51■■■■■ 5.04
HLA-C-204ENST00000415537 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.47■■■■■ 5.03
HLA-C-204ENST00000415537 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.41■■■■■ 5.02
HLA-C-204ENST00000415537 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.25■■■■■ 4.99
HLA-C-204ENST00000415537 CFTRP13569 1480 aa46.11■■■■■ 4.97
HLA-C-204ENST00000415537 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.11■■■■■ 4.97
HLA-C-204ENST00000415537 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.05■■■■■ 4.96
HLA-C-204ENST00000415537 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.03■■■■■ 4.96
HLA-C-204ENST00000415537 WDR62O43379 1518 aa45.96■■■■■ 4.95
HLA-C-204ENST00000415537 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.88■■■■■ 4.94
HLA-C-204ENST00000415537 PRDM2Q13029 1718 aa45.78■■■■■ 4.92
HLA-C-204ENST00000415537 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.58■■■■■ 4.89
HLA-C-204ENST00000415537 TOPBP1Q92547 1522 aa45.21■■■■■ 4.83
HLA-C-204ENST00000415537 ABCC8Q09428 1581 aa45.2■■■■■ 4.83
HLA-C-204ENST00000415537 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.11■■■■■ 4.81
HLA-C-204ENST00000415537 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.1■■■■■ 4.81
HLA-C-204ENST00000415537 IFT140Q96RY7 1462 aa45.1■■■■■ 4.81
HLA-C-204ENST00000415537 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.94■■■■■ 4.78
HLA-C-204ENST00000415537 OSCARQ8IYS5 282 aa44.87■■■■■ 4.77
HLA-C-204ENST00000415537 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.77■■■■■ 4.76
HLA-C-204ENST00000415537 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.75■■■■■ 4.75
HLA-C-204ENST00000415537 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.75■■■■■ 4.75
HLA-C-204ENST00000415537 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.62■■■■■ 4.736e-7■■■■■ 27.8
HLA-C-204ENST00000415537 SOGA1O94964 1423 aa44.61■■■■■ 4.73
HLA-C-204ENST00000415537 CUX1P39880 1505 aa44.6■■■■■ 4.73
HLA-C-204ENST00000415537 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.59■■■■■ 4.73
HLA-C-204ENST00000415537 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.57■■■■■ 4.73
HLA-C-204ENST00000415537 TRIM41Q8WV44 630 aa44.51■■■■■ 4.72
HLA-C-204ENST00000415537 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.43■■■■■ 4.7
HLA-C-204ENST00000415537 WDR97A6NE52 1622 aa44.38■■■■■ 4.69
HLA-C-204ENST00000415537 CHD1O14646 1710 aa44.36■■■■■ 4.69
HLA-C-204ENST00000415537 FBLN2P98095 1184 aa44.32■■■■■ 4.69
HLA-C-204ENST00000415537 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.19■■■■■ 4.66
HLA-C-204ENST00000415537 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.18■■■■■ 4.66
HLA-C-204ENST00000415537 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.18■■■■■ 4.66
HLA-C-204ENST00000415537 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.18■■■■■ 4.66
HLA-C-204ENST00000415537 GRIN2BQ13224 1484 aa44.15■■■■■ 4.66
HLA-C-204ENST00000415537 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.1■■■■■ 4.65
HLA-C-204ENST00000415537 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.09■■■■■ 4.65
HLA-C-204ENST00000415537 ARHGEF11O15085 1522 aa44.09■■■■■ 4.65
HLA-C-204ENST00000415537 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.08■■■■■ 4.65
HLA-C-204ENST00000415537 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.08■■■■■ 4.65
HLA-C-204ENST00000415537 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.06■■■■■ 4.64
HLA-C-204ENST00000415537 PBRM1Q86U86 1689 aa44.06■■■■■ 4.64
HLA-C-204ENST00000415537 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.06■■■■■ 4.64
HLA-C-204ENST00000415537 TOP2BQ02880 1626 aa44.05■■■■■ 4.64
HLA-C-204ENST00000415537 SYNJ1O43426 1573 aa43.99■■■■■ 4.63
HLA-C-204ENST00000415537 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.97■■■■■ 4.63
HLA-C-204ENST00000415537 SYNJ2O15056 1496 aa43.95■■■■■ 4.63
HLA-C-204ENST00000415537 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.78■■■■■ 4.6
HLA-C-204ENST00000415537 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.78■■■■■ 4.6
HLA-C-204ENST00000415537 ARAP1Q96P48 1450 aa43.66■■■■■ 4.58
HLA-C-204ENST00000415537 ADAMTS12P58397 1594 aa43.61■■■■■ 4.57
HLA-C-204ENST00000415537 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.58■■■■■ 4.57
HLA-C-204ENST00000415537 GRIN2AQ12879 1464 aa43.57■■■■■ 4.57
HLA-C-204ENST00000415537 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.53■■■■■ 4.56
HLA-C-204ENST00000415537 NUP160Q12769 1436 aa43.39■■■■■ 4.54
HLA-C-204ENST00000415537 CEP170Q5SW79 1584 aa43.38■■■■■ 4.54
HLA-C-204ENST00000415537 KIF27Q86VH2 1401 aa43.23■■■■■ 4.51
HLA-C-204ENST00000415537 TRHP20396 242 aaPredicted RBP43.18■■■■■ 4.5
HLA-C-204ENST00000415537 SHROOM2Q13796 1616 aa43.15■■■■■ 4.5
HLA-C-204ENST00000415537 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.14■■■■■ 4.5
HLA-C-204ENST00000415537 IGF1RP08069 1367 aa43.11■■■■■ 4.49
HLA-C-204ENST00000415537 CUL7Q14999 1698 aa43.07■■■■■ 4.49
HLA-C-204ENST00000415537 JPH4Q96JJ6 628 aa43.01■■■■■ 4.48
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