RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444523.1

CCDC117-204, Transcript of coiled-coil domain containing 117, humanhuman

TSL 4

Gene CCDC117, Length 463 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117-204ENST00000444523 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.93■■■■■ 7.34
CCDC117-204ENST00000444523 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54.57■■■■■ 6.33
CCDC117-204ENST00000444523 ABCC9O60706 1549 aa54.42■■■■■ 6.3
CCDC117-204ENST00000444523 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.82■■■■■ 5.89
CCDC117-204ENST00000444523 NACADO15069 1562 aa51.53■■■■■ 5.84
CCDC117-204ENST00000444523 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.23■■■■■ 5.79
CCDC117-204ENST00000444523 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.03■■■■■ 5.76
CCDC117-204ENST00000444523 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.89■■■■■ 5.74
CCDC117-204ENST00000444523 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.83■■■■■ 5.73
CCDC117-204ENST00000444523 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.71■■■■■ 5.71
CCDC117-204ENST00000444523 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.54■■■■■ 5.68
CCDC117-204ENST00000444523 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.47■■■■■ 5.67
CCDC117-204ENST00000444523 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.32■■■■■ 5.65
CCDC117-204ENST00000444523 SCRIBQ14160 1630 aa49.76■■■■■ 5.56
CCDC117-204ENST00000444523 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.61■■■■■ 5.53
CCDC117-204ENST00000444523 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.19■■■■■ 5.46
CCDC117-204ENST00000444523 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.11■■■■■ 5.45
CCDC117-204ENST00000444523 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.97■■■■■ 5.43
CCDC117-204ENST00000444523 NCAPD3P42695 1498 aa47.6■■■■■ 5.21
CCDC117-204ENST00000444523 SMARCA4P51532 1647 aa47.5■■■■■ 5.19
CCDC117-204ENST00000444523 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.5■■■■■ 5.19
CCDC117-204ENST00000444523 SMARCA2P51531 1590 aa47.3■■■■■ 5.16
CCDC117-204ENST00000444523 HMGXB3Q12766 1538 aa47.25■■■■■ 5.15
CCDC117-204ENST00000444523 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.23■■■■■ 5.15
CCDC117-204ENST00000444523 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.05■■■■■ 5.12
CCDC117-204ENST00000444523 MROH2BQ7Z745 1585 aa47■■■■■ 5.11
CCDC117-204ENST00000444523 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.98■■■■■ 5.11
CCDC117-204ENST00000444523 NESP48681 1621 aa46.87■■■■■ 5.09
CCDC117-204ENST00000444523 ERCC6Q03468 1493 aa46.86■■■■■ 5.09
CCDC117-204ENST00000444523 CUX2O14529 1486 aa46.76■■■■■ 5.08
CCDC117-204ENST00000444523 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.6■■■■■ 5.05
CCDC117-204ENST00000444523 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.46■■■■■ 5.03
CCDC117-204ENST00000444523 WIZO95785 1651 aa46.45■■■■■ 5.03
CCDC117-204ENST00000444523 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.34■■■■■ 5.01
CCDC117-204ENST00000444523 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.26■■■■■ 5
CCDC117-204ENST00000444523 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.14■■■■■ 4.98
CCDC117-204ENST00000444523 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.13■■■■■ 4.98
CCDC117-204ENST00000444523 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.07■■■■■ 4.97
CCDC117-204ENST00000444523 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.81■■■■■ 4.92
CCDC117-204ENST00000444523 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.78■■■■■ 4.92
CCDC117-204ENST00000444523 WDR62O43379 1518 aa45.7■■■■■ 4.91
CCDC117-204ENST00000444523 CFTRP13569 1480 aa45.68■■■■■ 4.9
CCDC117-204ENST00000444523 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.61■■■■■ 4.89
CCDC117-204ENST00000444523 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.61■■■■■ 4.89
CCDC117-204ENST00000444523 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.32■■■■■ 4.85
CCDC117-204ENST00000444523 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.3■■■■■ 4.84
CCDC117-204ENST00000444523 PRDM2Q13029 1718 aa45.26■■■■■ 4.84
CCDC117-204ENST00000444523 TOPBP1Q92547 1522 aa44.8■■■■■ 4.76
CCDC117-204ENST00000444523 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.71■■■■■ 4.75
CCDC117-204ENST00000444523 IFT140Q96RY7 1462 aa44.7■■■■■ 4.75
CCDC117-204ENST00000444523 OSCARQ8IYS5 282 aa44.64■■■■■ 4.74
CCDC117-204ENST00000444523 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.63■■■■■ 4.73
CCDC117-204ENST00000444523 ABCC8Q09428 1581 aa44.61■■■■■ 4.73
CCDC117-204ENST00000444523 TRIM41Q8WV44 630 aa44.56■■■■■ 4.72
CCDC117-204ENST00000444523 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.44■■■■■ 4.7
CCDC117-204ENST00000444523 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.43■■■■■ 4.7
CCDC117-204ENST00000444523 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.36■■■■■ 4.69
CCDC117-204ENST00000444523 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.3■■■■■ 4.686e-7■■■□□ 15.2
CCDC117-204ENST00000444523 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.22■■■■■ 4.67
CCDC117-204ENST00000444523 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.14■■■■■ 4.66
CCDC117-204ENST00000444523 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.14■■■■■ 4.66
CCDC117-204ENST00000444523 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.14■■■■■ 4.66
CCDC117-204ENST00000444523 CUX1P39880 1505 aa44.14■■■■■ 4.66
CCDC117-204ENST00000444523 CHD1O14646 1710 aa44.11■■■■■ 4.65
CCDC117-204ENST00000444523 SOGA1O94964 1423 aa44.11■■■■■ 4.65
CCDC117-204ENST00000444523 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.09■■■■■ 4.65
CCDC117-204ENST00000444523 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.07■■■■■ 4.65
CCDC117-204ENST00000444523 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.04■■■■■ 4.64
CCDC117-204ENST00000444523 ARHGEF11O15085 1522 aa43.99■■■■■ 4.63
CCDC117-204ENST00000444523 WDR97A6NE52 1622 aa43.88■■■■■ 4.62
CCDC117-204ENST00000444523 FBLN2P98095 1184 aa43.85■■■■■ 4.61
CCDC117-204ENST00000444523 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.83■■■■■ 4.61
CCDC117-204ENST00000444523 GRIN2BQ13224 1484 aa43.7■■■■■ 4.59
CCDC117-204ENST00000444523 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.68■■■■■ 4.58
CCDC117-204ENST00000444523 ARAP1Q96P48 1450 aa43.62■■■■■ 4.57
CCDC117-204ENST00000444523 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.61■■■■■ 4.57
CCDC117-204ENST00000444523 PBRM1Q86U86 1689 aa43.61■■■■■ 4.57
CCDC117-204ENST00000444523 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.6■■■■■ 4.57
CCDC117-204ENST00000444523 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.6■■■■■ 4.57
CCDC117-204ENST00000444523 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.58■■■■■ 4.57
CCDC117-204ENST00000444523 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.56■■■■■ 4.56
CCDC117-204ENST00000444523 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.55■■■■■ 4.56
CCDC117-204ENST00000444523 SYNJ2O15056 1496 aa43.54■■■■■ 4.56
CCDC117-204ENST00000444523 SYNJ1O43426 1573 aa43.49■■■■■ 4.55
CCDC117-204ENST00000444523 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.46■■■■■ 4.55
CCDC117-204ENST00000444523 TOP2BQ02880 1626 aa43.44■■■■■ 4.54
CCDC117-204ENST00000444523 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.39■■■■■ 4.54
CCDC117-204ENST00000444523 ADAMTS12P58397 1594 aa43.2■■■■■ 4.51
CCDC117-204ENST00000444523 GRIN2AQ12879 1464 aa43.17■■■■■ 4.5
CCDC117-204ENST00000444523 CEP170Q5SW79 1584 aa43.06■■■■■ 4.48
CCDC117-204ENST00000444523 NUP160Q12769 1436 aa43.05■■■■■ 4.48
CCDC117-204ENST00000444523 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.03■■■■■ 4.48
CCDC117-204ENST00000444523 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.03■■■■■ 4.48
CCDC117-204ENST00000444523 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43■■■■■ 4.47
CCDC117-204ENST00000444523 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.99■■■■■ 4.47
CCDC117-204ENST00000444523 SHROOM2Q13796 1616 aa42.86■■■■■ 4.45
CCDC117-204ENST00000444523 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.58■■■■■ 4.41
CCDC117-204ENST00000444523 IGF1RP08069 1367 aa42.58■■■■■ 4.41
CCDC117-204ENST00000444523 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.57■■■■■ 4.41
CCDC117-204ENST00000444523 JPH4Q96JJ6 628 aa42.56■■■■■ 4.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 322.4 ms