Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCDHA12Q9UN75 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCDHA12Q9UN75 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCDHA12Q9UN75 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCDHA12Q9UN75 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCDHA12Q9UN75 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCDHA12Q9UN75 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCDHA12Q9UN75 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCDHA12Q9UN75 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCDHA12Q9UN75 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCDHA12Q9UN75 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCDHA12Q9UN75 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCDHA12Q9UN75 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCDHA12Q9UN75 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDHA12Q9UN75 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDHA12Q9UN75 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCDHA12Q9UN75 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCDHA12Q9UN75 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCDHA12Q9UN75 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PCDHA12Q9UN75 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCDHA12Q9UN75 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCDHA12Q9UN75 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PCDHA12Q9UN75 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PCDHA12Q9UN75 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PCDHA12Q9UN75 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PCDHA12Q9UN75 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHA12Q9UN75 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHA12Q9UN75 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHA12Q9UN75 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHA12Q9UN75 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHA12Q9UN75 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDHA12Q9UN75 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDHA12Q9UN75 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDHA12Q9UN75 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDHA12Q9UN75 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDHA12Q9UN75 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDHA12Q9UN75 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHA12Q9UN75 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHA12Q9UN75 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHA12Q9UN75 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHA12Q9UN75 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHA12Q9UN75 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHA12Q9UN75 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHA12Q9UN75 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHA12Q9UN75 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHA12Q9UN75 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHA12Q9UN75 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHA12Q9UN75 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCDHA12Q9UN75 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCDHA12Q9UN75 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCDHA12Q9UN75 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCDHA12Q9UN75 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCDHA12Q9UN75 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PCDHA12Q9UN75 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHA12Q9UN75 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHA12Q9UN75 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHA12Q9UN75 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHA12Q9UN75 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHA12Q9UN75 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHA12Q9UN75 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHA12Q9UN75 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHA12Q9UN75 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHA12Q9UN75 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHA12Q9UN75 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHA12Q9UN75 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHA12Q9UN75 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHA12Q9UN75 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHA12Q9UN75 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHA12Q9UN75 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHA12Q9UN75 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHA12Q9UN75 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHA12Q9UN75 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHA12Q9UN75 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHA12Q9UN75 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHA12Q9UN75 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHA12Q9UN75 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHA12Q9UN75 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHA12Q9UN75 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHA12Q9UN75 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHA12Q9UN75 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHA12Q9UN75 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCDHA12Q9UN75 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCDHA12Q9UN75 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCDHA12Q9UN75 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCDHA12Q9UN75 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHA12Q9UN75 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHA12Q9UN75 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHA12Q9UN75 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHA12Q9UN75 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHA12Q9UN75 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHA12Q9UN75 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHA12Q9UN75 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHA12Q9UN75 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHA12Q9UN75 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHA12Q9UN75 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PCDHA12Q9UN75 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PCDHA12Q9UN75 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
PCDHA12Q9UN75 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PCDHA12Q9UN75 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHA12Q9UN75 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms