Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.63■■■■□ 3.78
PCDHA12Q9UN75 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
PCDHA12Q9UN75 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
PCDHA12Q9UN75 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
PCDHA12Q9UN75 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
PCDHA12Q9UN75 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
PCDHA12Q9UN75 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
PCDHA12Q9UN75 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
PCDHA12Q9UN75 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
PCDHA12Q9UN75 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
PCDHA12Q9UN75 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
PCDHA12Q9UN75 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
PCDHA12Q9UN75 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
PCDHA12Q9UN75 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PCDHA12Q9UN75 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
PCDHA12Q9UN75 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
PCDHA12Q9UN75 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
PCDHA12Q9UN75 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
PCDHA12Q9UN75 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
PCDHA12Q9UN75 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PCDHA12Q9UN75 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
PCDHA12Q9UN75 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
PCDHA12Q9UN75 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.09■■■■□ 3.21
PCDHA12Q9UN75 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PCDHA12Q9UN75 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PCDHA12Q9UN75 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PCDHA12Q9UN75 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PCDHA12Q9UN75 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PCDHA12Q9UN75 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
PCDHA12Q9UN75 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PCDHA12Q9UN75 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PCDHA12Q9UN75 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
PCDHA12Q9UN75 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PCDHA12Q9UN75 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PCDHA12Q9UN75 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PCDHA12Q9UN75 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PCDHA12Q9UN75 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PCDHA12Q9UN75 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PCDHA12Q9UN75 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PCDHA12Q9UN75 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PCDHA12Q9UN75 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PCDHA12Q9UN75 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PCDHA12Q9UN75 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PCDHA12Q9UN75 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
PCDHA12Q9UN75 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PCDHA12Q9UN75 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PCDHA12Q9UN75 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PCDHA12Q9UN75 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PCDHA12Q9UN75 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PCDHA12Q9UN75 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PCDHA12Q9UN75 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
PCDHA12Q9UN75 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PCDHA12Q9UN75 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PCDHA12Q9UN75 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PCDHA12Q9UN75 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PCDHA12Q9UN75 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PCDHA12Q9UN75 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PCDHA12Q9UN75 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PCDHA12Q9UN75 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PCDHA12Q9UN75 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PCDHA12Q9UN75 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PCDHA12Q9UN75 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PCDHA12Q9UN75 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.94
PCDHA12Q9UN75 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PCDHA12Q9UN75 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PCDHA12Q9UN75 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PCDHA12Q9UN75 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PCDHA12Q9UN75 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
PCDHA12Q9UN75 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PCDHA12Q9UN75 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PCDHA12Q9UN75 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PCDHA12Q9UN75 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PCDHA12Q9UN75 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PCDHA12Q9UN75 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PCDHA12Q9UN75 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PCDHA12Q9UN75 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
PCDHA12Q9UN75 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
PCDHA12Q9UN75 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PCDHA12Q9UN75 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PCDHA12Q9UN75 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PCDHA12Q9UN75 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PCDHA12Q9UN75 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PCDHA12Q9UN75 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PCDHA12Q9UN75 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PCDHA12Q9UN75 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
PCDHA12Q9UN75 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PCDHA12Q9UN75 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PCDHA12Q9UN75 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PCDHA12Q9UN75 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PCDHA12Q9UN75 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PCDHA12Q9UN75 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PCDHA12Q9UN75 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PCDHA12Q9UN75 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
PCDHA12Q9UN75 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PCDHA12Q9UN75 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
PCDHA12Q9UN75 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PCDHA12Q9UN75 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PCDHA12Q9UN75 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PCDHA12Q9UN75 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PCDHA12Q9UN75 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms