Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
NRXN1Q9ULB1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
NRXN1Q9ULB1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
NRXN1Q9ULB1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
NRXN1Q9ULB1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NRXN1Q9ULB1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NRXN1Q9ULB1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
NRXN1Q9ULB1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NRXN1Q9ULB1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NRXN1Q9ULB1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
NRXN1Q9ULB1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NRXN1Q9ULB1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NRXN1Q9ULB1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NRXN1Q9ULB1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
NRXN1Q9ULB1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
NRXN1Q9ULB1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
NRXN1Q9ULB1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
NRXN1Q9ULB1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
NRXN1Q9ULB1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
NRXN1Q9ULB1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
NRXN1Q9ULB1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
NRXN1Q9ULB1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
NRXN1Q9ULB1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
NRXN1Q9ULB1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
NRXN1Q9ULB1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
NRXN1Q9ULB1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
NRXN1Q9ULB1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
NRXN1Q9ULB1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
NRXN1Q9ULB1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
NRXN1Q9ULB1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
NRXN1Q9ULB1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
NRXN1Q9ULB1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NRXN1Q9ULB1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NRXN1Q9ULB1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
NRXN1Q9ULB1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
NRXN1Q9ULB1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
NRXN1Q9ULB1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
NRXN1Q9ULB1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
NRXN1Q9ULB1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC35.07■■■■□ 3.2
NRXN1Q9ULB1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
NRXN1Q9ULB1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
NRXN1Q9ULB1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
NRXN1Q9ULB1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
NRXN1Q9ULB1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
NRXN1Q9ULB1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
NRXN1Q9ULB1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
NRXN1Q9ULB1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
NRXN1Q9ULB1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
NRXN1Q9ULB1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NRXN1Q9ULB1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
NRXN1Q9ULB1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
NRXN1Q9ULB1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
NRXN1Q9ULB1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NRXN1Q9ULB1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NRXN1Q9ULB1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NRXN1Q9ULB1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
NRXN1Q9ULB1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
NRXN1Q9ULB1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NRXN1Q9ULB1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NRXN1Q9ULB1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NRXN1Q9ULB1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NRXN1Q9ULB1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
NRXN1Q9ULB1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
NRXN1Q9ULB1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
NRXN1Q9ULB1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
NRXN1Q9ULB1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.19
NRXN1Q9ULB1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
NRXN1Q9ULB1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
NRXN1Q9ULB1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
NRXN1Q9ULB1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NRXN1Q9ULB1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NRXN1Q9ULB1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
NRXN1Q9ULB1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
NRXN1Q9ULB1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NRXN1Q9ULB1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NRXN1Q9ULB1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NRXN1Q9ULB1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
NRXN1Q9ULB1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NRXN1Q9ULB1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NRXN1Q9ULB1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NRXN1Q9ULB1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
NRXN1Q9ULB1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
NRXN1Q9ULB1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
NRXN1Q9ULB1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NRXN1Q9ULB1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NRXN1Q9ULB1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NRXN1Q9ULB1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NRXN1Q9ULB1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
NRXN1Q9ULB1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
NRXN1Q9ULB1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NRXN1Q9ULB1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
NRXN1Q9ULB1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NRXN1Q9ULB1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
NRXN1Q9ULB1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NRXN1Q9ULB1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
NRXN1Q9ULB1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
NRXN1Q9ULB1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NRXN1Q9ULB1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NRXN1Q9ULB1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NRXN1Q9ULB1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms