Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC49.53■■■■■ 5.52
NRXN1Q9ULB1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC48.57■■■■■ 5.37
NRXN1Q9ULB1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.24■■■■■ 5.31
NRXN1Q9ULB1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.95■■■■■ 5.27
NRXN1Q9ULB1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.9■■■■■ 5.26
NRXN1Q9ULB1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.79■■■■■ 5.24
NRXN1Q9ULB1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47.75■■■■■ 5.23
NRXN1Q9ULB1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC47.57■■■■■ 5.21
NRXN1Q9ULB1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.45■■■■■ 5.03
NRXN1Q9ULB1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC46.44■■■■■ 5.03
NRXN1Q9ULB1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.42■■■■■ 5.02
NRXN1Q9ULB1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC46.34■■■■■ 5.01
NRXN1Q9ULB1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC46.33■■■■■ 5.01
NRXN1Q9ULB1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC46.21■■■■■ 4.99
NRXN1Q9ULB1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.21■■■■■ 4.99
NRXN1Q9ULB1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC45.92■■■■■ 4.94
NRXN1Q9ULB1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.88■■■■■ 4.94
NRXN1Q9ULB1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
NRXN1Q9ULB1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.65■■■■■ 4.9
NRXN1Q9ULB1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
NRXN1Q9ULB1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC45.54■■■■■ 4.88
NRXN1Q9ULB1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.47■■■■■ 4.87
NRXN1Q9ULB1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.46■■■■■ 4.87
NRXN1Q9ULB1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
NRXN1Q9ULB1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
NRXN1Q9ULB1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
NRXN1Q9ULB1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
NRXN1Q9ULB1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC44.74■■■■■ 4.75
NRXN1Q9ULB1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC44.61■■■■■ 4.73
NRXN1Q9ULB1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
NRXN1Q9ULB1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC44.56■■■■■ 4.72
NRXN1Q9ULB1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.37■■■■■ 4.69
NRXN1Q9ULB1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.68
NRXN1Q9ULB1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
NRXN1Q9ULB1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
NRXN1Q9ULB1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.17■■■■■ 4.66
NRXN1Q9ULB1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC44.15■■■■■ 4.66
NRXN1Q9ULB1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC44.06■■■■■ 4.64
NRXN1Q9ULB1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC44.06■■■■■ 4.64
NRXN1Q9ULB1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
NRXN1Q9ULB1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC43.97■■■■■ 4.63
NRXN1Q9ULB1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC43.88■■■■■ 4.61
NRXN1Q9ULB1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
NRXN1Q9ULB1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
NRXN1Q9ULB1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC43.78■■■■■ 4.6
NRXN1Q9ULB1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
NRXN1Q9ULB1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC43.32■■■■■ 4.53
NRXN1Q9ULB1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
NRXN1Q9ULB1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
NRXN1Q9ULB1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
NRXN1Q9ULB1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
NRXN1Q9ULB1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC43.12■■■■■ 4.49
NRXN1Q9ULB1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
NRXN1Q9ULB1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.02■■■■■ 4.48
NRXN1Q9ULB1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.99■■■■■ 4.47
NRXN1Q9ULB1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.95■■■■■ 4.47
NRXN1Q9ULB1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC42.92■■■■■ 4.46
NRXN1Q9ULB1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC42.87■■■■■ 4.45
NRXN1Q9ULB1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC42.86■■■■■ 4.45
NRXN1Q9ULB1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
NRXN1Q9ULB1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.81■■■■■ 4.44
NRXN1Q9ULB1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC42.81■■■■■ 4.44
NRXN1Q9ULB1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
NRXN1Q9ULB1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
NRXN1Q9ULB1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
NRXN1Q9ULB1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
NRXN1Q9ULB1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42.66■■■■■ 4.42
NRXN1Q9ULB1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC42.6■■■■■ 4.41
NRXN1Q9ULB1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.59■■■■■ 4.41
NRXN1Q9ULB1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
NRXN1Q9ULB1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
NRXN1Q9ULB1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC42.45■■■■■ 4.39
NRXN1Q9ULB1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
NRXN1Q9ULB1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
NRXN1Q9ULB1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
NRXN1Q9ULB1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
NRXN1Q9ULB1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC42.4■■■■■ 4.38
NRXN1Q9ULB1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC42.38■■■■■ 4.38
NRXN1Q9ULB1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC42.36■■■■■ 4.37
NRXN1Q9ULB1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
NRXN1Q9ULB1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC42.26■■■■■ 4.36
NRXN1Q9ULB1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC42.23■■■■■ 4.35
NRXN1Q9ULB1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
NRXN1Q9ULB1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.14■■■■■ 4.34
NRXN1Q9ULB1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC42.14■■■■■ 4.34
NRXN1Q9ULB1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
NRXN1Q9ULB1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC42.12■■■■■ 4.33
NRXN1Q9ULB1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.09■■■■■ 4.33
NRXN1Q9ULB1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.08■■■■■ 4.33
NRXN1Q9ULB1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
NRXN1Q9ULB1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.03■■■■■ 4.32
NRXN1Q9ULB1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
NRXN1Q9ULB1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC42.01■■■■■ 4.32
NRXN1Q9ULB1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
NRXN1Q9ULB1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
NRXN1Q9ULB1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.31
NRXN1Q9ULB1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
NRXN1Q9ULB1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
NRXN1Q9ULB1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
NRXN1Q9ULB1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC41.85■■■■■ 4.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms