Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP36Q9P275 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP36Q9P275 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP36Q9P275 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP36Q9P275 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP36Q9P275 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP36Q9P275 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
USP36Q9P275 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP36Q9P275 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP36Q9P275 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP36Q9P275 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP36Q9P275 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP36Q9P275 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP36Q9P275 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP36Q9P275 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP36Q9P275 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP36Q9P275 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP36Q9P275 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP36Q9P275 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP36Q9P275 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP36Q9P275 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP36Q9P275 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP36Q9P275 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP36Q9P275 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP36Q9P275 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP36Q9P275 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP36Q9P275 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP36Q9P275 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP36Q9P275 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP36Q9P275 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP36Q9P275 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP36Q9P275 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP36Q9P275 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP36Q9P275 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP36Q9P275 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP36Q9P275 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP36Q9P275 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP36Q9P275 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP36Q9P275 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP36Q9P275 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP36Q9P275 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP36Q9P275 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP36Q9P275 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
USP36Q9P275 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP36Q9P275 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
USP36Q9P275 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP36Q9P275 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP36Q9P275 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP36Q9P275 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
USP36Q9P275 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP36Q9P275 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP36Q9P275 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP36Q9P275 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP36Q9P275 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP36Q9P275 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP36Q9P275 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP36Q9P275 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP36Q9P275 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP36Q9P275 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP36Q9P275 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP36Q9P275 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP36Q9P275 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
USP36Q9P275 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP36Q9P275 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP36Q9P275 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP36Q9P275 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP36Q9P275 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
USP36Q9P275 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP36Q9P275 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP36Q9P275 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP36Q9P275 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP36Q9P275 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP36Q9P275 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP36Q9P275 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP36Q9P275 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP36Q9P275 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP36Q9P275 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
USP36Q9P275 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP36Q9P275 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP36Q9P275 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP36Q9P275 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP36Q9P275 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP36Q9P275 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP36Q9P275 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP36Q9P275 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP36Q9P275 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP36Q9P275 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP36Q9P275 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP36Q9P275 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP36Q9P275 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP36Q9P275 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP36Q9P275 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP36Q9P275 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP36Q9P275 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP36Q9P275 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP36Q9P275 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP36Q9P275 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP36Q9P275 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP36Q9P275 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP36Q9P275 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms