Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPY3

CD93, Complement component C1q receptor, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD93Q9NPY3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD93Q9NPY3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD93Q9NPY3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD93Q9NPY3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CD93Q9NPY3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD93Q9NPY3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD93Q9NPY3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD93Q9NPY3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD93Q9NPY3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD93Q9NPY3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD93Q9NPY3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD93Q9NPY3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD93Q9NPY3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD93Q9NPY3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD93Q9NPY3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD93Q9NPY3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD93Q9NPY3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD93Q9NPY3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD93Q9NPY3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD93Q9NPY3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CD93Q9NPY3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD93Q9NPY3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD93Q9NPY3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD93Q9NPY3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CD93Q9NPY3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD93Q9NPY3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD93Q9NPY3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD93Q9NPY3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD93Q9NPY3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD93Q9NPY3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CD93Q9NPY3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD93Q9NPY3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD93Q9NPY3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CD93Q9NPY3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CD93Q9NPY3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CD93Q9NPY3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD93Q9NPY3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD93Q9NPY3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD93Q9NPY3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD93Q9NPY3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD93Q9NPY3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD93Q9NPY3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD93Q9NPY3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD93Q9NPY3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CD93Q9NPY3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CD93Q9NPY3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CD93Q9NPY3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CD93Q9NPY3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD93Q9NPY3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD93Q9NPY3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD93Q9NPY3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD93Q9NPY3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD93Q9NPY3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD93Q9NPY3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD93Q9NPY3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD93Q9NPY3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD93Q9NPY3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD93Q9NPY3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CD93Q9NPY3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CD93Q9NPY3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CD93Q9NPY3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CD93Q9NPY3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CD93Q9NPY3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CD93Q9NPY3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CD93Q9NPY3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CD93Q9NPY3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CD93Q9NPY3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CD93Q9NPY3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CD93Q9NPY3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CD93Q9NPY3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CD93Q9NPY3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CD93Q9NPY3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD93Q9NPY3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD93Q9NPY3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD93Q9NPY3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD93Q9NPY3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD93Q9NPY3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD93Q9NPY3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD93Q9NPY3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD93Q9NPY3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD93Q9NPY3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD93Q9NPY3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD93Q9NPY3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD93Q9NPY3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CD93Q9NPY3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD93Q9NPY3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD93Q9NPY3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD93Q9NPY3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD93Q9NPY3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD93Q9NPY3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD93Q9NPY3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD93Q9NPY3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD93Q9NPY3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD93Q9NPY3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD93Q9NPY3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD93Q9NPY3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD93Q9NPY3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD93Q9NPY3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD93Q9NPY3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CD93Q9NPY3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms