Protein–RNA interactions for Protein: Q9H707

ZNF552, Zinc finger protein 552, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF552Q9H707 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF552Q9H707 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF552Q9H707 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF552Q9H707 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF552Q9H707 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF552Q9H707 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF552Q9H707 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF552Q9H707 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF552Q9H707 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF552Q9H707 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF552Q9H707 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF552Q9H707 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF552Q9H707 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF552Q9H707 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF552Q9H707 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF552Q9H707 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF552Q9H707 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF552Q9H707 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF552Q9H707 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF552Q9H707 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF552Q9H707 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF552Q9H707 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF552Q9H707 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF552Q9H707 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF552Q9H707 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF552Q9H707 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF552Q9H707 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF552Q9H707 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF552Q9H707 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF552Q9H707 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF552Q9H707 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF552Q9H707 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF552Q9H707 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF552Q9H707 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF552Q9H707 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF552Q9H707 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF552Q9H707 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF552Q9H707 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF552Q9H707 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF552Q9H707 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF552Q9H707 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF552Q9H707 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF552Q9H707 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF552Q9H707 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF552Q9H707 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF552Q9H707 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF552Q9H707 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF552Q9H707 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF552Q9H707 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF552Q9H707 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF552Q9H707 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF552Q9H707 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF552Q9H707 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF552Q9H707 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF552Q9H707 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF552Q9H707 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF552Q9H707 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF552Q9H707 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF552Q9H707 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF552Q9H707 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF552Q9H707 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF552Q9H707 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF552Q9H707 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF552Q9H707 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF552Q9H707 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF552Q9H707 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF552Q9H707 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF552Q9H707 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF552Q9H707 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF552Q9H707 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF552Q9H707 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF552Q9H707 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF552Q9H707 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF552Q9H707 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF552Q9H707 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF552Q9H707 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF552Q9H707 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF552Q9H707 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF552Q9H707 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF552Q9H707 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF552Q9H707 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF552Q9H707 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF552Q9H707 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF552Q9H707 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF552Q9H707 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF552Q9H707 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF552Q9H707 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF552Q9H707 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF552Q9H707 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF552Q9H707 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF552Q9H707 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF552Q9H707 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF552Q9H707 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF552Q9H707 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF552Q9H707 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF552Q9H707 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF552Q9H707 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF552Q9H707 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF552Q9H707 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF552Q9H707 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms