Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D6

XRN2, 5'-3' exoribonuclease 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRN2Q9H0D6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.396e-8■■■■■ 40.6
XRN2Q9H0D6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.161e-8■■■■■ 40.6
XRN2Q9H0D6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.731e-8■■■■■ 40.6
XRN2Q9H0D6 NR5A1-203ENST00000455734 826 ntTSL 317.09■□□□□ 0.331e-6■■■■■ 40.5
XRN2Q9H0D6 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.258e-11■■■■■ 40.4
XRN2Q9H0D6 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.018e-11■■■■■ 40.4
XRN2Q9H0D6 RTEL1-TNFRSF6B-203ENST00000492259 4824 ntAPPRIS ALT2 TSL 514.95□□□□□ -0.028e-11■■■■■ 40.4
XRN2Q9H0D6 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.068e-11■■■■■ 40.4
XRN2Q9H0D6 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.098e-11■■■■■ 40.4
XRN2Q9H0D6 RTEL1-211ENST00000508582 4273 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.348e-11■■■■■ 40.4
XRN2Q9H0D6 DHRSX-203ENST00000430536 490 ntTSL 226.02■■□□□ 1.769e-7■■■■■ 40.3
XRN2Q9H0D6 DHRSX-202ENST00000412516 744 ntTSL 225.12■■□□□ 1.619e-7■■■■■ 40.3
XRN2Q9H0D6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.689e-7■■■■■ 40.3
XRN2Q9H0D6 DHRSX-204ENST00000441131 539 ntTSL 29.1□□□□□ -0.959e-7■■■■■ 40.3
XRN2Q9H0D6 DLC1-210ENST00000512044 3758 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.511e-7■■■■■ 40.2
XRN2Q9H0D6 DLC1-206ENST00000509922 455 ntTSL 411.88□□□□□ -0.511e-7■■■■■ 40.2
XRN2Q9H0D6 DLC1-204ENST00000503161 562 ntTSL 411.64□□□□□ -0.551e-7■■■■■ 40.2
XRN2Q9H0D6 DLC1-201ENST00000276297 7447 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.021e-7■■■■■ 40.2
XRN2Q9H0D6 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC7.21□□□□□ -1.262e-54■■■■■ 40.2
XRN2Q9H0D6 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC4.52□□□□□ -1.692e-54■■■■■ 40.2
XRN2Q9H0D6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.827e-7■■■■■ 40.1
XRN2Q9H0D6 SF1-221ENST00000633899 591 ntTSL 424.46■■□□□ 1.517e-7■■■■■ 40.1
XRN2Q9H0D6 SF1-212ENST00000463343 983 ntTSL 220.86■□□□□ 0.937e-7■■■■■ 40.1
XRN2Q9H0D6 SF1-207ENST00000413951 623 ntTSL 220.23■□□□□ 0.837e-7■■■■■ 40.1
XRN2Q9H0D6 SF1-215ENST00000482693 755 ntTSL 219.31■□□□□ 0.687e-7■■■■■ 40.1
XRN2Q9H0D6 MVD-216ENST00000568709 809 ntTSL 521.81■■□□□ 1.085e-7■■■■■ 40
XRN2Q9H0D6 MVD-206ENST00000563170 904 ntTSL 319.28■□□□□ 0.685e-7■■■■■ 40
XRN2Q9H0D6 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.411e-323■■■■■ 39.9
XRN2Q9H0D6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.112e-6■■■■■ 39.9
XRN2Q9H0D6 ADARB1-212ENST00000496664 5033 ntTSL 1 (best)22.01■■□□□ 1.112e-6■■■■■ 39.9
XRN2Q9H0D6 ADARB1-203ENST00000389861 5031 ntTSL 1 (best)22.01■■□□□ 1.112e-6■■■■■ 39.9
XRN2Q9H0D6 ADARB1-211ENST00000492414 4913 ntTSL 1 (best)21.06■□□□□ 0.962e-6■■■■■ 39.9
XRN2Q9H0D6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.52e-6■■■■■ 39.9
XRN2Q9H0D6 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 39.9
XRN2Q9H0D6 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.21e-323■■■■■ 39.9
XRN2Q9H0D6 PHF10-204ENST00000480008 4285 ntTSL 1 (best)16.16■□□□□ 0.181e-323■■■■■ 39.9
XRN2Q9H0D6 TSEN54-209ENST00000583454 733 ntTSL 329.69■■■□□ 2.346e-7■■■■■ 39.8
XRN2Q9H0D6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.656e-7■■■■■ 39.8
XRN2Q9H0D6 TSEN54-208ENST00000583173 798 ntTSL 524.9■■□□□ 1.586e-7■■■■■ 39.8
XRN2Q9H0D6 TSEN54-207ENST00000580013 568 ntTSL 424.9■■□□□ 1.586e-7■■■■■ 39.8
XRN2Q9H0D6 TSEN54-202ENST00000434205 627 ntTSL 519.44■□□□□ 0.76e-7■■■■■ 39.8
XRN2Q9H0D6 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.417e-7■■■■■ 39.8
XRN2Q9H0D6 UBE2K-207ENST00000513231 871 ntTSL 1 (best)28.53■■■□□ 2.161e-10■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 UBE2K-206ENST00000510934 589 ntTSL 224.77■■□□□ 1.561e-10■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.411e-10■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.821e-10■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.771e-10■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 UBE2K-202ENST00000438068 2262 ntTSL 218.76■□□□□ 0.591e-10■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 UBE2K-205ENST00000510719 566 ntTSL 310.13□□□□□ -0.791e-10■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 SEMA4C-203ENST00000449330 839 ntTSL 317.16■□□□□ 0.342e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 KMT5A-207ENST00000478781 725 ntTSL 533.8■■■■□ 35e-19■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 MZT2A-204ENST00000445782 980 ntTSL 232.17■■■□□ 2.745e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 ASL-209ENST00000493708 885 ntTSL 330.63■■■□□ 2.495e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 YAF2-213ENST00000548917 269 ntTSL 230.09■■■□□ 2.415e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 YAF2-211ENST00000547724 396 ntTSL 330.09■■■□□ 2.415e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 AMN-205ENST00000559507 435 ntTSL 329.84■■■□□ 2.375e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.275e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 PRKCZ-219ENST00000484419 519 ntTSL 228.55■■■□□ 2.165e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.125e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 AMN-207ENST00000559789 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 328.08■■■□□ 2.095e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.72■■■□□ 2.035e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 APOE-202ENST00000425718 923 ntTSL 1 (best)27.34■■□□□ 1.975e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.924e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 EBF4-208ENST00000491472 665 ntTSL 526.99■■□□□ 1.915e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 GTF2A1-201ENST00000298173 1677 ntTSL 226.97■■□□□ 1.915e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.755e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.75e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 APOE-204ENST00000446996 737 ntTSL 225.37■■□□□ 1.655e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.644e-13■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.644e-13■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.64e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.545e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.535e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 TCF25-208ENST00000563032 274 ntTSL 224.46■■□□□ 1.516e-6■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 SGPL1-204ENST00000486993 537 ntTSL 1 (best)24.39■■□□□ 1.495e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 RNH1-216ENST00000529368 727 ntTSL 224.17■■□□□ 1.465e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 TCF25-212ENST00000564652 860 ntTSL 324.14■■□□□ 1.456e-6■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 ELP5-211ENST00000573699 864 ntTSL 324.09■■□□□ 1.455e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 APOE-203ENST00000434152 864 ntTSL 224.05■■□□□ 1.445e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 SFXN5-214ENST00000482289 895 ntTSL 1 (best)23.88■■□□□ 1.415e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 ELP5-213ENST00000574841 510 ntTSL 223.68■■□□□ 1.385e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 CPLX2-207ENST00000514150 970 ntTSL 423.66■■□□□ 1.385e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 PPP1R12C-206ENST00000590268 830 ntTSL 223.61■■□□□ 1.375e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.364e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 SFMBT1-204ENST00000482396 850 ntTSL 223.37■■□□□ 1.335e-6■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 XXYLT1-203ENST00000418940 582 ntTSL 423.29■■□□□ 1.325e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.314e-6■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.275e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 EGFR-209ENST00000463948 561 ntTSL 322.94■■□□□ 1.264e-6■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 SECTM1-204ENST00000581864 787 ntTSL 322.6■■□□□ 1.215e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 YAF2-208ENST00000547254 571 ntTSL 522.52■■□□□ 1.25e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.195e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 ZNF331-212ENST00000509069 461 ntTSL 322.12■■□□□ 1.135e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.135e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.134e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 ELP5-215ENST00000576496 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)22.07■■□□□ 1.125e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 XXYLT1-211ENST00000494175 565 ntTSL 421.86■■□□□ 1.095e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 USP14-207ENST00000581983 503 ntTSL 321.61■■□□□ 1.055e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.025e-7■■■■■ 39.7
XRN2Q9H0D6 MZT2A-203ENST00000427024 679 ntTSL 321.1■□□□□ 0.975e-7■■■■■ 39.7
Retrieved 100 of 21,068 protein–RNA pairs in 70 ms