RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478781.6

KMT5A-207, Transcript of lysine methyltransferase 5A, humanhuman

TSL 5

Gene KMT5A, Length 725 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KMT5A-207ENST00000478781 NISCHQ9Y2I1 1504 aa69.92■■■■■ 8.78
KMT5A-207ENST00000478781 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa62.39■■■■■ 7.58
KMT5A-207ENST00000478781 ABCC9O60706 1549 aa61.42■■■■■ 7.42
KMT5A-207ENST00000478781 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa58.97■■■■■ 7.03
KMT5A-207ENST00000478781 NACADO15069 1562 aa58.79■■■■■ 7
KMT5A-207ENST00000478781 DCAF8L2P0C7V8 631 aa58.65■■■■■ 6.98
KMT5A-207ENST00000478781 MYO15BQ96JP2 1530 aa58.31■■■■■ 6.92
KMT5A-207ENST00000478781 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP58.14■■■■■ 6.9
KMT5A-207ENST00000478781 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa57.87■■■■■ 6.85
KMT5A-207ENST00000478781 UNC13AQ9UPW8 1703 aa57.51■■■■■ 6.8
KMT5A-207ENST00000478781 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP57.31■■■■■ 6.76
KMT5A-207ENST00000478781 BICRAQ9NZM4 1560 aa57.09■■■■■ 6.73
KMT5A-207ENST00000478781 SCRIBQ14160 1630 aa56.84■■■■■ 6.69
KMT5A-207ENST00000478781 DNAJC5BQ9UF47 199 aa56.71■■■■■ 6.67
KMT5A-207ENST00000478781 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa56.6■■■■■ 6.65
KMT5A-207ENST00000478781 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP55.67■■■■■ 6.5
KMT5A-207ENST00000478781 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa55.54■■■■■ 6.48
KMT5A-207ENST00000478781 CECR2Q9BXF3 1484 aa55.27■■■■■ 6.44
KMT5A-207ENST00000478781 SMARCA4P51532 1647 aa54.34■■■■■ 6.29
KMT5A-207ENST00000478781 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP54.26■■■■■ 6.28
KMT5A-207ENST00000478781 NCAPD3P42695 1498 aa54.22■■■■■ 6.27
KMT5A-207ENST00000478781 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa54.16■■■■■ 6.26
KMT5A-207ENST00000478781 SMARCA2P51531 1590 aa54.14■■■■■ 6.26
KMT5A-207ENST00000478781 HMGXB3Q12766 1538 aa53.93■■■■■ 6.22
KMT5A-207ENST00000478781 MROH2BQ7Z745 1585 aa53.83■■■■■ 6.21
KMT5A-207ENST00000478781 PEG3Q9GZU2 1588 aa53.83■■■■■ 6.21
KMT5A-207ENST00000478781 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP53.73■■■■■ 6.19
KMT5A-207ENST00000478781 WIZO95785 1651 aa53.23■■■■■ 6.11
KMT5A-207ENST00000478781 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP53.08■■■■■ 6.09
KMT5A-207ENST00000478781 ERCC6Q03468 1493 aa53.06■■■■■ 6.08
KMT5A-207ENST00000478781 NESP48681 1621 aa52.99■■■■■ 6.07
KMT5A-207ENST00000478781 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa52.89■■■■■ 6.06
KMT5A-207ENST00000478781 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP52.69■■■■■ 6.03
KMT5A-207ENST00000478781 CUX2O14529 1486 aa52.65■■■■■ 6.02
KMT5A-207ENST00000478781 CADPSQ9ULU8 1353 aa52.64■■■■■ 6.02
KMT5A-207ENST00000478781 PDS5BQ9NTI5 1447 aa52.58■■■■■ 6.01
KMT5A-207ENST00000478781 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa52.36■■■■■ 5.97
KMT5A-207ENST00000478781 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP52.3■■■■■ 5.96
KMT5A-207ENST00000478781 CFTRP13569 1480 aa52.21■■■■■ 5.95
KMT5A-207ENST00000478781 CCDC88BA6NC98 1476 aa52.05■■■■■ 5.92
KMT5A-207ENST00000478781 MRC2Q9UBG0 1479 aa52.02■■■■■ 5.92
KMT5A-207ENST00000478781 FANCD2Q9BXW9 1451 aa52.01■■■■■ 5.92
KMT5A-207ENST00000478781 CEP164Q9UPV0 1460 aa52.01■■■■■ 5.92
KMT5A-207ENST00000478781 WDR62O43379 1518 aa51.84■■■■■ 5.89
KMT5A-207ENST00000478781 PRDM2Q13029 1718 aa51.78■■■■■ 5.88
KMT5A-207ENST00000478781 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa51.53■■■■■ 5.84
KMT5A-207ENST00000478781 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP51.48■■■■■ 5.83
KMT5A-207ENST00000478781 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP51.44■■■■■ 5.83
KMT5A-207ENST00000478781 ABCC8Q09428 1581 aa51.19■■■■■ 5.78
KMT5A-207ENST00000478781 TOPBP1Q92547 1522 aa51.12■■■■■ 5.77
KMT5A-207ENST00000478781 DNMBPQ6XZF7 1577 aa51.04■■■■■ 5.76
KMT5A-207ENST00000478781 IFT140Q96RY7 1462 aa50.96■■■■■ 5.75
KMT5A-207ENST00000478781 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP50.67■■■■■ 5.7
KMT5A-207ENST00000478781 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP50.65■■■■■ 5.7
KMT5A-207ENST00000478781 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP50.58■■■■■ 5.69
KMT5A-207ENST00000478781 CUX1P39880 1505 aa50.54■■■■■ 5.68
KMT5A-207ENST00000478781 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP50.48■■■■■ 5.67
KMT5A-207ENST00000478781 SOGA1O94964 1423 aa50.47■■■■■ 5.67
KMT5A-207ENST00000478781 FGD5Q6ZNL6 1462 aa50.46■■■■■ 5.67
KMT5A-207ENST00000478781 OSCARQ8IYS5 282 aa50.42■■■■■ 5.66
KMT5A-207ENST00000478781 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa50.41■■■■■ 5.66
KMT5A-207ENST00000478781 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP50.36■■■■■ 5.651e-7■■■□□ 19.2
KMT5A-207ENST00000478781 WDR97A6NE52 1622 aa50.25■■■■■ 5.63
KMT5A-207ENST00000478781 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP50.21■■■■■ 5.63
KMT5A-207ENST00000478781 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP50.11■■■■■ 5.61
KMT5A-207ENST00000478781 TOP2BQ02880 1626 aa50.03■■■■■ 5.6
KMT5A-207ENST00000478781 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa50.02■■■■■ 5.6
KMT5A-207ENST00000478781 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa49.98■■■■■ 5.59
KMT5A-207ENST00000478781 GRIN2BQ13224 1484 aa49.95■■■■■ 5.59
KMT5A-207ENST00000478781 SYNJ1O43426 1573 aa49.94■■■■■ 5.59
KMT5A-207ENST00000478781 CHD1O14646 1710 aa49.92■■■■■ 5.58
KMT5A-207ENST00000478781 FBLN2P98095 1184 aa49.92■■■■■ 5.58
KMT5A-207ENST00000478781 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa49.89■■■■■ 5.58
KMT5A-207ENST00000478781 GAPVD1Q14C86 1478 aa49.88■■■■■ 5.58
KMT5A-207ENST00000478781 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP49.88■■■■■ 5.57
KMT5A-207ENST00000478781 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa49.78■■■■■ 5.56
KMT5A-207ENST00000478781 PBRM1Q86U86 1689 aa49.77■■■■■ 5.56
KMT5A-207ENST00000478781 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP49.74■■■■■ 5.55
KMT5A-207ENST00000478781 SYNJ2O15056 1496 aa49.67■■■■■ 5.54
KMT5A-207ENST00000478781 TRIM41Q8WV44 630 aa49.64■■■■■ 5.54
KMT5A-207ENST00000478781 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa49.56■■■■■ 5.52
KMT5A-207ENST00000478781 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa49.56■■■■■ 5.52
KMT5A-207ENST00000478781 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa49.56■■■■■ 5.52
KMT5A-207ENST00000478781 ARHGEF11O15085 1522 aa49.53■■■■■ 5.52
KMT5A-207ENST00000478781 ERICH3Q5RHP9 1530 aa49.39■■■■■ 5.5
KMT5A-207ENST00000478781 CLASP1Q7Z460 1538 aa49.39■■■■■ 5.5
KMT5A-207ENST00000478781 ADAMTS12P58397 1594 aa49.35■■■■■ 5.49
KMT5A-207ENST00000478781 FHAD1B1AJZ9 1412 aa49.31■■■■■ 5.48
KMT5A-207ENST00000478781 GRIN2AQ12879 1464 aa49.28■■■■■ 5.48
KMT5A-207ENST00000478781 KIF27Q86VH2 1401 aa49.14■■■■■ 5.46
KMT5A-207ENST00000478781 CYB5RLQ6IPT4 315 aa49.13■■■■■ 5.46
KMT5A-207ENST00000478781 NUP160Q12769 1436 aa49.08■■■■■ 5.45
KMT5A-207ENST00000478781 ARAP1Q96P48 1450 aa49.07■■■■■ 5.45
KMT5A-207ENST00000478781 CEP170Q5SW79 1584 aa49.01■■■■■ 5.44
KMT5A-207ENST00000478781 IGF1RP08069 1367 aa48.94■■■■■ 5.43
KMT5A-207ENST00000478781 CUL7Q14999 1698 aa48.87■■■■■ 5.41
KMT5A-207ENST00000478781 SHROOM2Q13796 1616 aa48.73■■■■■ 5.39
KMT5A-207ENST00000478781 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa48.67■■■■■ 5.38
KMT5A-207ENST00000478781 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa48.63■■■■■ 5.37
KMT5A-207ENST00000478781 JPH4Q96JJ6 628 aa48.61■■■■■ 5.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 133 ms