RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491472.2

EBF4-208, Transcript of early B cell factor 4, humanhuman

TSL 5

Gene EBF4, Length 665 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4-208ENST00000491472 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.84■■■■■ 6.53
EBF4-208ENST00000491472 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.92■■■■■ 5.58
EBF4-208ENST00000491472 ABCC9O60706 1549 aa49.16■■■■■ 5.46
EBF4-208ENST00000491472 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.2■■■■■ 5.15
EBF4-208ENST00000491472 NACADO15069 1562 aa47.05■■■■■ 5.12
EBF4-208ENST00000491472 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.79■■■■■ 5.08
EBF4-208ENST00000491472 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.66■■■■■ 5.06
EBF4-208ENST00000491472 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.4■■■■■ 5.02
EBF4-208ENST00000491472 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.26■■■■■ 5
EBF4-208ENST00000491472 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.04■■■■■ 4.96
EBF4-208ENST00000491472 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.84■■■■■ 4.93
EBF4-208ENST00000491472 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.71■■■■■ 4.91
EBF4-208ENST00000491472 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.52■■■■■ 4.88
EBF4-208ENST00000491472 SCRIBQ14160 1630 aa45.37■■■■■ 4.85
EBF4-208ENST00000491472 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.35■■■■■ 4.85
EBF4-208ENST00000491472 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.56■■■■■ 4.72
EBF4-208ENST00000491472 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.49■■■■■ 4.71
EBF4-208ENST00000491472 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.28■■■■■ 4.68
EBF4-208ENST00000491472 SMARCA4P51532 1647 aa43.42■■■■■ 4.54
EBF4-208ENST00000491472 NCAPD3P42695 1498 aa43.4■■■■■ 4.54
EBF4-208ENST00000491472 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.34■■■■■ 4.53
EBF4-208ENST00000491472 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.31■■■■■ 4.52
EBF4-208ENST00000491472 SMARCA2P51531 1590 aa43.29■■■■■ 4.52
EBF4-208ENST00000491472 HMGXB3Q12766 1538 aa43.14■■■■■ 4.5
EBF4-208ENST00000491472 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.06■■■■■ 4.48
EBF4-208ENST00000491472 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.97■■■■■ 4.47
EBF4-208ENST00000491472 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.94■■■■■ 4.46
EBF4-208ENST00000491472 WIZO95785 1651 aa42.47■■■■■ 4.39
EBF4-208ENST00000491472 ERCC6Q03468 1493 aa42.47■■■■■ 4.39
EBF4-208ENST00000491472 NESP48681 1621 aa42.38■■■■■ 4.37
EBF4-208ENST00000491472 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.34■■■■■ 4.37
EBF4-208ENST00000491472 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.34■■■■■ 4.37
EBF4-208ENST00000491472 CUX2O14529 1486 aa42.24■■■■■ 4.35
EBF4-208ENST00000491472 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.1■■■■■ 4.33
EBF4-208ENST00000491472 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.09■■■■■ 4.33
EBF4-208ENST00000491472 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.05■■■■■ 4.32
EBF4-208ENST00000491472 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.91■■■■■ 4.3
EBF4-208ENST00000491472 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.89■■■■■ 4.3
EBF4-208ENST00000491472 CFTRP13569 1480 aa41.74■■■■■ 4.27
EBF4-208ENST00000491472 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.63■■■■■ 4.25
EBF4-208ENST00000491472 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.59■■■■■ 4.25
EBF4-208ENST00000491472 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.58■■■■■ 4.25
EBF4-208ENST00000491472 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.54■■■■■ 4.24
EBF4-208ENST00000491472 WDR62O43379 1518 aa41.5■■■■■ 4.23
EBF4-208ENST00000491472 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.49■■■■■ 4.23
EBF4-208ENST00000491472 PRDM2Q13029 1718 aa41.41■■■■■ 4.22
EBF4-208ENST00000491472 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.17■■■■■ 4.18
EBF4-208ENST00000491472 ABCC8Q09428 1581 aa40.95■■■■■ 4.15
EBF4-208ENST00000491472 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.86■■■■■ 4.13
EBF4-208ENST00000491472 TOPBP1Q92547 1522 aa40.86■■■■■ 4.13
EBF4-208ENST00000491472 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.8■■■■■ 4.12
EBF4-208ENST00000491472 IFT140Q96RY7 1462 aa40.76■■■■■ 4.12
EBF4-208ENST00000491472 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.52■■■■■ 4.08
EBF4-208ENST00000491472 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.47■■■■■ 4.07
EBF4-208ENST00000491472 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.45■■■■■ 4.07
EBF4-208ENST00000491472 OSCARQ8IYS5 282 aa40.42■■■■■ 4.06
EBF4-208ENST00000491472 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.38■■■■■ 4.05
EBF4-208ENST00000491472 CUX1P39880 1505 aa40.35■■■■■ 4.05
EBF4-208ENST00000491472 SOGA1O94964 1423 aa40.33■■■■■ 4.05
EBF4-208ENST00000491472 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.3■■■■■ 4.04
EBF4-208ENST00000491472 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.26■■■■■ 4.04
EBF4-208ENST00000491472 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.26■■■■■ 4.03
EBF4-208ENST00000491472 WDR97A6NE52 1622 aa40.21■■■■■ 4.03
EBF4-208ENST00000491472 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.11■■■■■ 4.01
EBF4-208ENST00000491472 CHD1O14646 1710 aa39.96■■■■□ 3.99
EBF4-208ENST00000491472 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.95■■■■□ 3.99
EBF4-208ENST00000491472 GRIN2BQ13224 1484 aa39.94■■■■□ 3.98
EBF4-208ENST00000491472 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.93■■■■□ 3.98
EBF4-208ENST00000491472 TOP2BQ02880 1626 aa39.93■■■■□ 3.98
EBF4-208ENST00000491472 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.92■■■■□ 3.98
EBF4-208ENST00000491472 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.89■■■■□ 3.98
EBF4-208ENST00000491472 FBLN2P98095 1184 aa39.89■■■■□ 3.98
EBF4-208ENST00000491472 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.88■■■■□ 3.97
EBF4-208ENST00000491472 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.86■■■■□ 3.97
EBF4-208ENST00000491472 TRIM41Q8WV44 630 aa39.83■■■■□ 3.97
EBF4-208ENST00000491472 SYNJ1O43426 1573 aa39.82■■■■□ 3.97
EBF4-208ENST00000491472 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.79■■■■□ 3.96
EBF4-208ENST00000491472 PBRM1Q86U86 1689 aa39.77■■■■□ 3.96
EBF4-208ENST00000491472 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.76■■■■□ 3.96
EBF4-208ENST00000491472 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.74■■■■□ 3.95
EBF4-208ENST00000491472 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.74■■■■□ 3.95
EBF4-208ENST00000491472 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.74■■■■□ 3.95
EBF4-208ENST00000491472 SYNJ2O15056 1496 aa39.73■■■■□ 3.95
EBF4-208ENST00000491472 ARHGEF11O15085 1522 aa39.7■■■■□ 3.95
EBF4-208ENST00000491472 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.54■■■■□ 3.92
EBF4-208ENST00000491472 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.47■■■■□ 3.91
EBF4-208ENST00000491472 ADAMTS12P58397 1594 aa39.42■■■■□ 3.9
EBF4-208ENST00000491472 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.4■■■■□ 3.9
EBF4-208ENST00000491472 GRIN2AQ12879 1464 aa39.39■■■■□ 3.9
EBF4-208ENST00000491472 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.35■■■■□ 3.89
EBF4-208ENST00000491472 ARAP1Q96P48 1450 aa39.31■■■■□ 3.88
EBF4-208ENST00000491472 NUP160Q12769 1436 aa39.24■■■■□ 3.87
EBF4-208ENST00000491472 KIF27Q86VH2 1401 aa39.19■■■■□ 3.86
EBF4-208ENST00000491472 CEP170Q5SW79 1584 aa39.17■■■■□ 3.86
EBF4-208ENST00000491472 IGF1RP08069 1367 aa39.06■■■■□ 3.84
EBF4-208ENST00000491472 CUL7Q14999 1698 aa39.02■■■■□ 3.84
EBF4-208ENST00000491472 SHROOM2Q13796 1616 aa39.01■■■■□ 3.84
EBF4-208ENST00000491472 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.87■■■■□ 3.81
EBF4-208ENST00000491472 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.86■■■■□ 3.81
EBF4-208ENST00000491472 JPH4Q96JJ6 628 aa38.86■■■■□ 3.81
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