RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293230.9

CYGB-201, Transcript of cytoglobin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CYGB, Length 2,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYGB-201ENST00000293230 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.77■■■■■ 4.28
CYGB-201ENST00000293230 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.25■■■■□ 3.39
CYGB-201ENST00000293230 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.27■■■■□ 3.24
CYGB-201ENST00000293230 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.01■■■■□ 3.2
CYGB-201ENST00000293230 ABCC9O60706 1549 aa34.79■■■■□ 3.16
CYGB-201ENST00000293230 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.47■■■■□ 3.11
CYGB-201ENST00000293230 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.37■■■■□ 3.09
CYGB-201ENST00000293230 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.05■■■■□ 3.04
CYGB-201ENST00000293230 NACADO15069 1562 aa33.85■■■■□ 3.01
CYGB-201ENST00000293230 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.84■■■■□ 3.01
CYGB-201ENST00000293230 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.71■■■□□ 2.99
CYGB-201ENST00000293230 SCRIBQ14160 1630 aa33.4■■■□□ 2.94
CYGB-201ENST00000293230 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.12■■■□□ 2.89
CYGB-201ENST00000293230 CHIC1Q5VXU3 224 aa32.95■■■□□ 2.87
CYGB-201ENST00000293230 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.81■■■□□ 2.84
CYGB-201ENST00000293230 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.72■■■□□ 2.83
CYGB-201ENST00000293230 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.72■■■□□ 2.83
CYGB-201ENST00000293230 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.56■■■□□ 2.8
CYGB-201ENST00000293230 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.42■■■□□ 2.78
CYGB-201ENST00000293230 WIZO95785 1651 aa32.23■■■□□ 2.75
CYGB-201ENST00000293230 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.14■■■□□ 2.74
CYGB-201ENST00000293230 SMARCA4P51532 1647 aa31.95■■■□□ 2.7
CYGB-201ENST00000293230 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa31.88■■■□□ 2.69
CYGB-201ENST00000293230 TRIM41Q8WV44 630 aa31.81■■■□□ 2.68
CYGB-201ENST00000293230 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.79■■■□□ 2.68
CYGB-201ENST00000293230 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.76■■■□□ 2.67
CYGB-201ENST00000293230 SMARCA2P51531 1590 aa31.56■■■□□ 2.64
CYGB-201ENST00000293230 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.55■■■□□ 2.64
CYGB-201ENST00000293230 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.46■■■□□ 2.63
CYGB-201ENST00000293230 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.46■■■□□ 2.63
CYGB-201ENST00000293230 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP31.46■■■□□ 2.63
CYGB-201ENST00000293230 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.45■■■□□ 2.63
CYGB-201ENST00000293230 PCGF6Q9BYE7 350 aa31.29■■■□□ 2.6
CYGB-201ENST00000293230 ABCC8Q09428 1581 aa31.29■■■□□ 2.6
CYGB-201ENST00000293230 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.27■■■□□ 2.6
CYGB-201ENST00000293230 NCAPD3P42695 1498 aa31.23■■■□□ 2.59
CYGB-201ENST00000293230 HMGXB3Q12766 1538 aa31.17■■■□□ 2.58
CYGB-201ENST00000293230 EHMT2Q96KQ7 1210 aa31.13■■■□□ 2.57
CYGB-201ENST00000293230 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.12■■■□□ 2.57
CYGB-201ENST00000293230 HRCP23327 699 aa30.99■■■□□ 2.55
CYGB-201ENST00000293230 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP30.89■■■□□ 2.54
CYGB-201ENST00000293230 SOGA1O94964 1423 aa30.85■■■□□ 2.53
CYGB-201ENST00000293230 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.82■■■□□ 2.53
CYGB-201ENST00000293230 SYNJ1O43426 1573 aa30.75■■■□□ 2.51
CYGB-201ENST00000293230 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.74■■■□□ 2.51
CYGB-201ENST00000293230 EEA1Q15075 1411 aa30.67■■■□□ 2.5
CYGB-201ENST00000293230 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP30.66■■■□□ 2.5
CYGB-201ENST00000293230 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.59■■■□□ 2.49
CYGB-201ENST00000293230 CEP162Q5TB80 1403 aa30.48■■■□□ 2.47
CYGB-201ENST00000293230 TNIKQ9UKE5 1360 aa30.47■■■□□ 2.47
CYGB-201ENST00000293230 TOP2BQ02880 1626 aa30.44■■■□□ 2.46
CYGB-201ENST00000293230 CFTRP13569 1480 aa30.42■■■□□ 2.46
CYGB-201ENST00000293230 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.42■■■□□ 2.46
CYGB-201ENST00000293230 GOLGA3Q08378 1498 aa30.41■■■□□ 2.46
CYGB-201ENST00000293230 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP30.41■■■□□ 2.46
CYGB-201ENST00000293230 NESP48681 1621 aa30.4■■■□□ 2.46
CYGB-201ENST00000293230 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.37■■■□□ 2.45
CYGB-201ENST00000293230 UBTFP17480 764 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
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CYGB-201ENST00000293230 PRDM2Q13029 1718 aa30.32■■■□□ 2.44
CYGB-201ENST00000293230 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.31■■■□□ 2.44
CYGB-201ENST00000293230 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.29■■■□□ 2.44
CYGB-201ENST00000293230 CUX1P39880 1505 aa30.23■■■□□ 2.43
CYGB-201ENST00000293230 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.16■■■□□ 2.42
CYGB-201ENST00000293230 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.11■■■□□ 2.41
CYGB-201ENST00000293230 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.06■■■□□ 2.4
CYGB-201ENST00000293230 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.05■■■□□ 2.4
CYGB-201ENST00000293230 CLIP1P30622 1438 aa30.01■■■□□ 2.39
CYGB-201ENST00000293230 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.39
CYGB-201ENST00000293230 PRXQ9BXM0 1461 aa29.97■■■□□ 2.39
CYGB-201ENST00000293230 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.38
CYGB-201ENST00000293230 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.94■■■□□ 2.38
CYGB-201ENST00000293230 MYT1Q01538 1121 aa29.93■■■□□ 2.38
CYGB-201ENST00000293230 KIF27Q86VH2 1401 aa29.91■■■□□ 2.38
CYGB-201ENST00000293230 ERCC6Q03468 1493 aa29.87■■■□□ 2.37
CYGB-201ENST00000293230 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.84■■■□□ 2.37
CYGB-201ENST00000293230 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
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CYGB-201ENST00000293230 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.74■■■□□ 2.35
CYGB-201ENST00000293230 TOPBP1Q92547 1522 aa29.73■■■□□ 2.35
CYGB-201ENST00000293230 CUX2O14529 1486 aa29.73■■■□□ 2.35
CYGB-201ENST00000293230 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
CYGB-201ENST00000293230 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.71■■■□□ 2.35
CYGB-201ENST00000293230 ARAP1Q96P48 1450 aa29.65■■■□□ 2.34
CYGB-201ENST00000293230 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.33
CYGB-201ENST00000293230 IGF1RP08069 1367 aa29.63■■■□□ 2.33
CYGB-201ENST00000293230 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP29.59■■■□□ 2.33
CYGB-201ENST00000293230 WDR62O43379 1518 aa29.58■■■□□ 2.33
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CYGB-201ENST00000293230 APLP2Q06481 763 aa29.53■■■□□ 2.32
CYGB-201ENST00000293230 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.48■■■□□ 2.31
CYGB-201ENST00000293230 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.48■■■□□ 2.31
CYGB-201ENST00000293230 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.47■■■□□ 2.31
CYGB-201ENST00000293230 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.43■■■□□ 2.3
CYGB-201ENST00000293230 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
CYGB-201ENST00000293230 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
CYGB-201ENST00000293230 WDR97A6NE52 1622 aa29.32■■■□□ 2.28
CYGB-201ENST00000293230 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
CYGB-201ENST00000293230 IFT140Q96RY7 1462 aa29.25■■■□□ 2.27
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