RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298173.7

GTF2A1-201, Transcript of general transcription factor IIA subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene GTF2A1, Length 1,677 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1-201ENST00000298173 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.1■■■■■ 6.73
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GTF2A1-201ENST00000298173 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.94■■■■■ 5.11
GTF2A1-201ENST00000298173 NACADO15069 1562 aa46.74■■■■■ 5.07
GTF2A1-201ENST00000298173 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.41■■■■■ 5.02
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GTF2A1-201ENST00000298173 SCRIBQ14160 1630 aa45.83■■■■■ 4.93
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GTF2A1-201ENST00000298173 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.06■■■■■ 4.8
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GTF2A1-201ENST00000298173 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.09■■■■■ 4.65
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GTF2A1-201ENST00000298173 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.06■■■■■ 4.64
GTF2A1-201ENST00000298173 SMARCA4P51532 1647 aa43.98■■■■■ 4.63
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GTF2A1-201ENST00000298173 WIZO95785 1651 aa43.66■■■■■ 4.58
GTF2A1-201ENST00000298173 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.54■■■■■ 4.56
GTF2A1-201ENST00000298173 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.4■■■■■ 4.54
GTF2A1-201ENST00000298173 SMARCA2P51531 1590 aa43.35■■■■■ 4.53
GTF2A1-201ENST00000298173 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.21■■■■■ 4.51
GTF2A1-201ENST00000298173 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.18■■■■■ 4.5
GTF2A1-201ENST00000298173 NCAPD3P42695 1498 aa43.16■■■■■ 4.5
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GTF2A1-201ENST00000298173 CFTRP13569 1480 aa42.04■■■■■ 4.32
GTF2A1-201ENST00000298173 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.03■■■■■ 4.32
GTF2A1-201ENST00000298173 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.98■■■■■ 4.31
GTF2A1-201ENST00000298173 PRDM2Q13029 1718 aa41.78■■■■■ 4.28
GTF2A1-201ENST00000298173 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.74■■■■■ 4.27
GTF2A1-201ENST00000298173 NESP48681 1621 aa41.71■■■■■ 4.27
GTF2A1-201ENST00000298173 ABCC8Q09428 1581 aa41.64■■■■■ 4.26
GTF2A1-201ENST00000298173 TRIM41Q8WV44 630 aa41.53■■■■■ 4.24
GTF2A1-201ENST00000298173 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.48■■■■■ 4.23
GTF2A1-201ENST00000298173 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.47■■■■■ 4.23
GTF2A1-201ENST00000298173 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.4■■■■■ 4.22
GTF2A1-201ENST00000298173 SYNJ1O43426 1573 aa41.32■■■■■ 4.21
GTF2A1-201ENST00000298173 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.24■■■■■ 4.19
GTF2A1-201ENST00000298173 TOP2BQ02880 1626 aa41.23■■■■■ 4.19
GTF2A1-201ENST00000298173 CUX1P39880 1505 aa41.23■■■■■ 4.19
GTF2A1-201ENST00000298173 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.23■■■■■ 4.19
GTF2A1-201ENST00000298173 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.21■■■■■ 4.19
GTF2A1-201ENST00000298173 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.02■■■■■ 4.16
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GTF2A1-201ENST00000298173 TOPBP1Q92547 1522 aa40.98■■■■■ 4.15
GTF2A1-201ENST00000298173 ERCC6Q03468 1493 aa40.89■■■■■ 4.14
GTF2A1-201ENST00000298173 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.89■■■■■ 4.14
GTF2A1-201ENST00000298173 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.83■■■■■ 4.13
GTF2A1-201ENST00000298173 SOGA1O94964 1423 aa40.79■■■■■ 4.12
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GTF2A1-201ENST00000298173 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.58■■■■■ 4.09
GTF2A1-201ENST00000298173 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.52■■■■■ 4.08
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GTF2A1-201ENST00000298173 KIF27Q86VH2 1401 aa40.48■■■■■ 4.07
GTF2A1-201ENST00000298173 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.47■■■■■ 4.07
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GTF2A1-201ENST00000298173 IFT140Q96RY7 1462 aa40.33■■■■■ 4.05
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GTF2A1-201ENST00000298173 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.22■■■■■ 4.03
GTF2A1-201ENST00000298173 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.14■■■■■ 4.02
GTF2A1-201ENST00000298173 KIF21BO75037 1637 aa40.13■■■■■ 4.02
GTF2A1-201ENST00000298173 PRXQ9BXM0 1461 aa40.12■■■■■ 4.01
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GTF2A1-201ENST00000298173 ADAMTS12P58397 1594 aa39.7■■■■□ 3.95
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GTF2A1-201ENST00000298173 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.64■■■■□ 3.94
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GTF2A1-201ENST00000298173 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.38■■■■□ 3.89
GTF2A1-201ENST00000298173 CLIP1P30622 1438 aa39.35■■■■□ 3.89
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