RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484419.1

PRKCZ-219, Transcript of protein kinase C zeta, humanhuman

TSL 2

Gene PRKCZ, Length 519 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZ-219ENST00000484419 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.57■■■■■ 7.13
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PRKCZ-219ENST00000484419 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.69■■■■■ 5.55
PRKCZ-219ENST00000484419 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.68■■■■■ 5.54
PRKCZ-219ENST00000484419 NACADO15069 1562 aa49.45■■■■■ 5.51
PRKCZ-219ENST00000484419 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.39■■■■■ 5.5
PRKCZ-219ENST00000484419 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.35■■■■■ 5.49
PRKCZ-219ENST00000484419 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.33■■■■■ 5.49
PRKCZ-219ENST00000484419 SCRIBQ14160 1630 aa48.01■■■■■ 5.28
PRKCZ-219ENST00000484419 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.98■■■■■ 5.27
PRKCZ-219ENST00000484419 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.9■■■■■ 5.26
PRKCZ-219ENST00000484419 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.77■■■■■ 5.24
PRKCZ-219ENST00000484419 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.44■■■■■ 5.18
PRKCZ-219ENST00000484419 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.49■■■■■ 5.03
PRKCZ-219ENST00000484419 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.48■■■■■ 5.03
PRKCZ-219ENST00000484419 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.33■■■■■ 5.01
PRKCZ-219ENST00000484419 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.15■■■■■ 4.98
PRKCZ-219ENST00000484419 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.12■■■■■ 4.97
PRKCZ-219ENST00000484419 SMARCA4P51532 1647 aa46.02■■■■■ 4.96
PRKCZ-219ENST00000484419 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.88■■■■■ 4.93
PRKCZ-219ENST00000484419 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.75■■■■■ 4.91
PRKCZ-219ENST00000484419 NCAPD3P42695 1498 aa45.7■■■■■ 4.91
PRKCZ-219ENST00000484419 SMARCA2P51531 1590 aa45.69■■■■■ 4.9
PRKCZ-219ENST00000484419 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.63■■■■■ 4.9
PRKCZ-219ENST00000484419 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.62■■■■■ 4.89
PRKCZ-219ENST00000484419 HMGXB3Q12766 1538 aa45.41■■■■■ 4.86
PRKCZ-219ENST00000484419 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.37■■■■■ 4.85
PRKCZ-219ENST00000484419 WIZO95785 1651 aa45.32■■■■■ 4.85
PRKCZ-219ENST00000484419 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.95■■■■■ 4.79
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PRKCZ-219ENST00000484419 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.49■■■■■ 4.71
PRKCZ-219ENST00000484419 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.42■■■■■ 4.7
PRKCZ-219ENST00000484419 NESP48681 1621 aa44.3■■■■■ 4.68
PRKCZ-219ENST00000484419 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.3■■■■■ 4.68
PRKCZ-219ENST00000484419 CFTRP13569 1480 aa44.21■■■■■ 4.67
PRKCZ-219ENST00000484419 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.11■■■■■ 4.65
PRKCZ-219ENST00000484419 ERCC6Q03468 1493 aa43.99■■■■■ 4.63
PRKCZ-219ENST00000484419 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.82■■■■■ 4.6
PRKCZ-219ENST00000484419 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.7■■■■■ 4.59
PRKCZ-219ENST00000484419 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.65■■■■■ 4.58
PRKCZ-219ENST00000484419 PRDM2Q13029 1718 aa43.62■■■■■ 4.57
PRKCZ-219ENST00000484419 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.53■■■■■ 4.56
PRKCZ-219ENST00000484419 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.43■■■■■ 4.54
PRKCZ-219ENST00000484419 CUX2O14529 1486 aa43.36■■■■■ 4.53
PRKCZ-219ENST00000484419 WDR62O43379 1518 aa43.32■■■■■ 4.53
PRKCZ-219ENST00000484419 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.3■■■■■ 4.52
PRKCZ-219ENST00000484419 ABCC8Q09428 1581 aa43.29■■■■■ 4.52
PRKCZ-219ENST00000484419 TOPBP1Q92547 1522 aa43.15■■■■■ 4.5
PRKCZ-219ENST00000484419 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.12■■■■■ 4.49
PRKCZ-219ENST00000484419 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43■■■■■ 4.47
PRKCZ-219ENST00000484419 CUX1P39880 1505 aa42.99■■■■■ 4.47
PRKCZ-219ENST00000484419 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.82■■■■■ 4.45
PRKCZ-219ENST00000484419 IFT140Q96RY7 1462 aa42.81■■■■■ 4.44
PRKCZ-219ENST00000484419 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.79■■■■■ 4.44
PRKCZ-219ENST00000484419 TOP2BQ02880 1626 aa42.76■■■■■ 4.44
PRKCZ-219ENST00000484419 SOGA1O94964 1423 aa42.75■■■■■ 4.43
PRKCZ-219ENST00000484419 SYNJ1O43426 1573 aa42.73■■■■■ 4.43
PRKCZ-219ENST00000484419 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.69■■■■■ 4.42
PRKCZ-219ENST00000484419 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.64■■■■■ 4.42
PRKCZ-219ENST00000484419 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.58■■■■■ 4.41
PRKCZ-219ENST00000484419 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.49■■■■■ 4.39
PRKCZ-219ENST00000484419 TRIM41Q8WV44 630 aa42.47■■■■■ 4.39
PRKCZ-219ENST00000484419 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.45■■■■■ 4.39
PRKCZ-219ENST00000484419 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.42■■■■■ 4.38
PRKCZ-219ENST00000484419 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.39■■■■■ 4.38
PRKCZ-219ENST00000484419 WDR97A6NE52 1622 aa42.33■■■■■ 4.37
PRKCZ-219ENST00000484419 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.27■■■■■ 4.36
PRKCZ-219ENST00000484419 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.26■■■■■ 4.36
PRKCZ-219ENST00000484419 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.22■■■■■ 4.35
PRKCZ-219ENST00000484419 GRIN2BQ13224 1484 aa42.15■■■■■ 4.34
PRKCZ-219ENST00000484419 KIF27Q86VH2 1401 aa42.11■■■■■ 4.33
PRKCZ-219ENST00000484419 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.1■■■■■ 4.33
PRKCZ-219ENST00000484419 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.97■■■■■ 4.31
PRKCZ-219ENST00000484419 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.95■■■■■ 4.31
PRKCZ-219ENST00000484419 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.94■■■■■ 4.3
PRKCZ-219ENST00000484419 IGF1RP08069 1367 aa41.9■■■■■ 4.3
PRKCZ-219ENST00000484419 PBRM1Q86U86 1689 aa41.87■■■■■ 4.29
PRKCZ-219ENST00000484419 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.86■■■■■ 4.29
PRKCZ-219ENST00000484419 FBLN2P98095 1184 aa41.84■■■■■ 4.29
PRKCZ-219ENST00000484419 SYNJ2O15056 1496 aa41.8■■■■■ 4.28
PRKCZ-219ENST00000484419 OSCARQ8IYS5 282 aa41.8■■■■■ 4.28
PRKCZ-219ENST00000484419 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.78■■■■■ 4.28
PRKCZ-219ENST00000484419 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.78■■■■■ 4.28
PRKCZ-219ENST00000484419 EEA1Q15075 1411 aa41.67■■■■■ 4.26
PRKCZ-219ENST00000484419 ADAMTS12P58397 1594 aa41.66■■■■■ 4.26
PRKCZ-219ENST00000484419 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.65■■■■■ 4.26
PRKCZ-219ENST00000484419 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.61■■■■■ 4.25
PRKCZ-219ENST00000484419 GRIN2AQ12879 1464 aa41.57■■■■■ 4.25
PRKCZ-219ENST00000484419 CUL7Q14999 1698 aa41.57■■■■■ 4.25
PRKCZ-219ENST00000484419 CHD1O14646 1710 aa41.55■■■■■ 4.24
PRKCZ-219ENST00000484419 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.52■■■■■ 4.24
PRKCZ-219ENST00000484419 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.48■■■■■ 4.23
PRKCZ-219ENST00000484419 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.41■■■■■ 4.22
PRKCZ-219ENST00000484419 PRXQ9BXM0 1461 aa41.4■■■■■ 4.22
PRKCZ-219ENST00000484419 NUP160Q12769 1436 aa41.39■■■■■ 4.22
PRKCZ-219ENST00000484419 CEP170Q5SW79 1584 aa41.25■■■■■ 4.19
PRKCZ-219ENST00000484419 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.24■■■■■ 4.19
PRKCZ-219ENST00000484419 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.17■■■■■ 4.18
PRKCZ-219ENST00000484419 JPH4Q96JJ6 628 aa41.11■■■■■ 4.17
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