Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM175Q9BSA9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM175Q9BSA9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM175Q9BSA9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM175Q9BSA9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM175Q9BSA9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM175Q9BSA9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM175Q9BSA9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM175Q9BSA9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM175Q9BSA9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM175Q9BSA9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM175Q9BSA9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM175Q9BSA9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM175Q9BSA9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM175Q9BSA9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM175Q9BSA9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEM175Q9BSA9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEM175Q9BSA9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEM175Q9BSA9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEM175Q9BSA9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM175Q9BSA9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM175Q9BSA9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM175Q9BSA9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM175Q9BSA9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM175Q9BSA9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM175Q9BSA9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM175Q9BSA9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM175Q9BSA9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM175Q9BSA9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM175Q9BSA9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM175Q9BSA9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM175Q9BSA9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM175Q9BSA9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM175Q9BSA9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM175Q9BSA9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM175Q9BSA9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM175Q9BSA9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM175Q9BSA9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM175Q9BSA9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM175Q9BSA9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM175Q9BSA9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM175Q9BSA9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TMEM175Q9BSA9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMEM175Q9BSA9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMEM175Q9BSA9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TMEM175Q9BSA9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM175Q9BSA9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM175Q9BSA9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM175Q9BSA9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM175Q9BSA9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM175Q9BSA9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM175Q9BSA9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM175Q9BSA9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM175Q9BSA9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM175Q9BSA9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM175Q9BSA9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM175Q9BSA9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM175Q9BSA9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM175Q9BSA9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM175Q9BSA9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM175Q9BSA9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM175Q9BSA9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM175Q9BSA9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM175Q9BSA9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM175Q9BSA9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM175Q9BSA9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM175Q9BSA9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM175Q9BSA9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM175Q9BSA9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM175Q9BSA9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM175Q9BSA9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM175Q9BSA9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM175Q9BSA9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM175Q9BSA9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM175Q9BSA9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM175Q9BSA9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM175Q9BSA9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM175Q9BSA9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM175Q9BSA9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM175Q9BSA9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM175Q9BSA9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM175Q9BSA9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM175Q9BSA9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM175Q9BSA9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM175Q9BSA9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM175Q9BSA9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM175Q9BSA9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM175Q9BSA9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM175Q9BSA9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM175Q9BSA9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM175Q9BSA9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM175Q9BSA9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM175Q9BSA9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM175Q9BSA9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM175Q9BSA9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM175Q9BSA9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM175Q9BSA9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM175Q9BSA9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM175Q9BSA9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM175Q9BSA9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms