Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
FYCO1Q9BQS8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
FYCO1Q9BQS8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
FYCO1Q9BQS8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
FYCO1Q9BQS8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC38.78■■■■□ 3.8
FYCO1Q9BQS8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
FYCO1Q9BQS8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
FYCO1Q9BQS8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
FYCO1Q9BQS8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
FYCO1Q9BQS8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
FYCO1Q9BQS8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.8
FYCO1Q9BQS8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
FYCO1Q9BQS8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
FYCO1Q9BQS8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
FYCO1Q9BQS8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC38.75■■■■□ 3.79
FYCO1Q9BQS8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
FYCO1Q9BQS8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
FYCO1Q9BQS8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
FYCO1Q9BQS8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
FYCO1Q9BQS8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
FYCO1Q9BQS8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
FYCO1Q9BQS8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
FYCO1Q9BQS8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.73■■■■□ 3.79
FYCO1Q9BQS8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
FYCO1Q9BQS8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
FYCO1Q9BQS8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
FYCO1Q9BQS8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC38.72■■■■□ 3.79
FYCO1Q9BQS8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
FYCO1Q9BQS8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
FYCO1Q9BQS8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
FYCO1Q9BQS8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
FYCO1Q9BQS8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
FYCO1Q9BQS8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
FYCO1Q9BQS8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC38.69■■■■□ 3.78
FYCO1Q9BQS8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
FYCO1Q9BQS8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC38.68■■■■□ 3.78
FYCO1Q9BQS8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
FYCO1Q9BQS8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
FYCO1Q9BQS8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
FYCO1Q9BQS8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
FYCO1Q9BQS8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
FYCO1Q9BQS8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC38.66■■■■□ 3.78
FYCO1Q9BQS8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
FYCO1Q9BQS8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
FYCO1Q9BQS8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
FYCO1Q9BQS8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
FYCO1Q9BQS8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
FYCO1Q9BQS8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
FYCO1Q9BQS8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC38.63■■■■□ 3.77
FYCO1Q9BQS8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
FYCO1Q9BQS8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
FYCO1Q9BQS8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
FYCO1Q9BQS8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
FYCO1Q9BQS8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
FYCO1Q9BQS8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
FYCO1Q9BQS8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
FYCO1Q9BQS8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC38.61■■■■□ 3.77
FYCO1Q9BQS8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
FYCO1Q9BQS8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
FYCO1Q9BQS8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
FYCO1Q9BQS8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
FYCO1Q9BQS8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
FYCO1Q9BQS8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
FYCO1Q9BQS8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
FYCO1Q9BQS8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
FYCO1Q9BQS8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
FYCO1Q9BQS8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
FYCO1Q9BQS8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
FYCO1Q9BQS8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
FYCO1Q9BQS8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
FYCO1Q9BQS8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
FYCO1Q9BQS8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
FYCO1Q9BQS8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
FYCO1Q9BQS8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
FYCO1Q9BQS8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
FYCO1Q9BQS8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
FYCO1Q9BQS8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.55■■■■□ 3.76
FYCO1Q9BQS8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
FYCO1Q9BQS8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
FYCO1Q9BQS8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
FYCO1Q9BQS8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
FYCO1Q9BQS8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
FYCO1Q9BQS8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
FYCO1Q9BQS8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC38.54■■■■□ 3.76
FYCO1Q9BQS8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
FYCO1Q9BQS8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
FYCO1Q9BQS8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
FYCO1Q9BQS8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
FYCO1Q9BQS8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
FYCO1Q9BQS8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
FYCO1Q9BQS8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC38.52■■■■□ 3.76
FYCO1Q9BQS8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
FYCO1Q9BQS8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
FYCO1Q9BQS8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
FYCO1Q9BQS8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
FYCO1Q9BQS8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
FYCO1Q9BQS8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC38.51■■■■□ 3.76
FYCO1Q9BQS8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
FYCO1Q9BQS8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
FYCO1Q9BQS8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.5 ms