Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB3

PPP1R9B, Neurabin-2, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R9BQ96SB3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPP1R9BQ96SB3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPP1R9BQ96SB3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPP1R9BQ96SB3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPP1R9BQ96SB3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PPP1R9BQ96SB3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPP1R9BQ96SB3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPP1R9BQ96SB3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPP1R9BQ96SB3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPP1R9BQ96SB3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PPP1R9BQ96SB3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPP1R9BQ96SB3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPP1R9BQ96SB3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PPP1R9BQ96SB3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPP1R9BQ96SB3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPP1R9BQ96SB3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPP1R9BQ96SB3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PPP1R9BQ96SB3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPP1R9BQ96SB3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PPP1R9BQ96SB3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPP1R9BQ96SB3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPP1R9BQ96SB3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPP1R9BQ96SB3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPP1R9BQ96SB3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPP1R9BQ96SB3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPP1R9BQ96SB3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPP1R9BQ96SB3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPP1R9BQ96SB3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPP1R9BQ96SB3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPP1R9BQ96SB3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPP1R9BQ96SB3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PPP1R9BQ96SB3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP1R9BQ96SB3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP1R9BQ96SB3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP1R9BQ96SB3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP1R9BQ96SB3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP1R9BQ96SB3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP1R9BQ96SB3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP1R9BQ96SB3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP1R9BQ96SB3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP1R9BQ96SB3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP1R9BQ96SB3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP1R9BQ96SB3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP1R9BQ96SB3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP1R9BQ96SB3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP1R9BQ96SB3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPP1R9BQ96SB3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPP1R9BQ96SB3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPP1R9BQ96SB3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPP1R9BQ96SB3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPP1R9BQ96SB3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP1R9BQ96SB3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP1R9BQ96SB3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP1R9BQ96SB3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP1R9BQ96SB3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP1R9BQ96SB3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP1R9BQ96SB3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP1R9BQ96SB3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP1R9BQ96SB3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP1R9BQ96SB3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPP1R9BQ96SB3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PPP1R9BQ96SB3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPP1R9BQ96SB3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPP1R9BQ96SB3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPP1R9BQ96SB3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPP1R9BQ96SB3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPP1R9BQ96SB3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPP1R9BQ96SB3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPP1R9BQ96SB3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPP1R9BQ96SB3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PPP1R9BQ96SB3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPP1R9BQ96SB3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPP1R9BQ96SB3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPP1R9BQ96SB3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PPP1R9BQ96SB3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PPP1R9BQ96SB3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PPP1R9BQ96SB3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PPP1R9BQ96SB3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PPP1R9BQ96SB3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PPP1R9BQ96SB3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPP1R9BQ96SB3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PPP1R9BQ96SB3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PPP1R9BQ96SB3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PPP1R9BQ96SB3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PPP1R9BQ96SB3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPP1R9BQ96SB3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PPP1R9BQ96SB3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPP1R9BQ96SB3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPP1R9BQ96SB3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PPP1R9BQ96SB3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PPP1R9BQ96SB3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PPP1R9BQ96SB3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PPP1R9BQ96SB3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPP1R9BQ96SB3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPP1R9BQ96SB3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPP1R9BQ96SB3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPP1R9BQ96SB3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPP1R9BQ96SB3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPP1R9BQ96SB3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPP1R9BQ96SB3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms