Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDGFRLQ15198 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDGFRLQ15198 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDGFRLQ15198 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDGFRLQ15198 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDGFRLQ15198 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDGFRLQ15198 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDGFRLQ15198 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDGFRLQ15198 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDGFRLQ15198 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDGFRLQ15198 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDGFRLQ15198 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PDGFRLQ15198 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDGFRLQ15198 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDGFRLQ15198 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDGFRLQ15198 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDGFRLQ15198 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDGFRLQ15198 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDGFRLQ15198 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDGFRLQ15198 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PDGFRLQ15198 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDGFRLQ15198 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDGFRLQ15198 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDGFRLQ15198 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDGFRLQ15198 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PDGFRLQ15198 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDGFRLQ15198 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDGFRLQ15198 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDGFRLQ15198 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDGFRLQ15198 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDGFRLQ15198 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDGFRLQ15198 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDGFRLQ15198 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDGFRLQ15198 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDGFRLQ15198 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDGFRLQ15198 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDGFRLQ15198 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PDGFRLQ15198 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDGFRLQ15198 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PDGFRLQ15198 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDGFRLQ15198 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDGFRLQ15198 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDGFRLQ15198 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDGFRLQ15198 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDGFRLQ15198 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDGFRLQ15198 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDGFRLQ15198 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDGFRLQ15198 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDGFRLQ15198 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDGFRLQ15198 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDGFRLQ15198 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDGFRLQ15198 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDGFRLQ15198 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDGFRLQ15198 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDGFRLQ15198 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDGFRLQ15198 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDGFRLQ15198 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDGFRLQ15198 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDGFRLQ15198 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDGFRLQ15198 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDGFRLQ15198 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDGFRLQ15198 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDGFRLQ15198 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PDGFRLQ15198 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDGFRLQ15198 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PDGFRLQ15198 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDGFRLQ15198 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDGFRLQ15198 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDGFRLQ15198 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDGFRLQ15198 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PDGFRLQ15198 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PDGFRLQ15198 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDGFRLQ15198 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDGFRLQ15198 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDGFRLQ15198 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDGFRLQ15198 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDGFRLQ15198 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDGFRLQ15198 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PDGFRLQ15198 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDGFRLQ15198 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDGFRLQ15198 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDGFRLQ15198 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDGFRLQ15198 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDGFRLQ15198 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDGFRLQ15198 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDGFRLQ15198 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDGFRLQ15198 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDGFRLQ15198 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDGFRLQ15198 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDGFRLQ15198 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDGFRLQ15198 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDGFRLQ15198 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDGFRLQ15198 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDGFRLQ15198 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDGFRLQ15198 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDGFRLQ15198 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDGFRLQ15198 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDGFRLQ15198 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDGFRLQ15198 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDGFRLQ15198 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
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