Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SF3B2Q13435 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SF3B2Q13435 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
SF3B2Q13435 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SF3B2Q13435 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
SF3B2Q13435 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SF3B2Q13435 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SF3B2Q13435 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
SF3B2Q13435 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SF3B2Q13435 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SF3B2Q13435 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
SF3B2Q13435 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
SF3B2Q13435 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SF3B2Q13435 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SF3B2Q13435 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SF3B2Q13435 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SF3B2Q13435 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SF3B2Q13435 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SF3B2Q13435 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SF3B2Q13435 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SF3B2Q13435 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SF3B2Q13435 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SF3B2Q13435 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SF3B2Q13435 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SF3B2Q13435 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SF3B2Q13435 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SF3B2Q13435 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SF3B2Q13435 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SF3B2Q13435 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SF3B2Q13435 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SF3B2Q13435 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SF3B2Q13435 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SF3B2Q13435 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SF3B2Q13435 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SF3B2Q13435 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
SF3B2Q13435 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SF3B2Q13435 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
SF3B2Q13435 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
SF3B2Q13435 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
SF3B2Q13435 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
SF3B2Q13435 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.79
SF3B2Q13435 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SF3B2Q13435 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SF3B2Q13435 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SF3B2Q13435 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SF3B2Q13435 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SF3B2Q13435 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SF3B2Q13435 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SF3B2Q13435 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SF3B2Q13435 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SF3B2Q13435 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SF3B2Q13435 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SF3B2Q13435 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SF3B2Q13435 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SF3B2Q13435 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SF3B2Q13435 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SF3B2Q13435 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SF3B2Q13435 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SF3B2Q13435 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SF3B2Q13435 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SF3B2Q13435 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
SF3B2Q13435 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
SF3B2Q13435 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SF3B2Q13435 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SF3B2Q13435 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SF3B2Q13435 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SF3B2Q13435 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SF3B2Q13435 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SF3B2Q13435 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SF3B2Q13435 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
SF3B2Q13435 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SF3B2Q13435 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SF3B2Q13435 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SF3B2Q13435 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SF3B2Q13435 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SF3B2Q13435 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SF3B2Q13435 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SF3B2Q13435 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SF3B2Q13435 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SF3B2Q13435 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SF3B2Q13435 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SF3B2Q13435 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
SF3B2Q13435 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SF3B2Q13435 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
SF3B2Q13435 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SF3B2Q13435 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SF3B2Q13435 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SF3B2Q13435 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SF3B2Q13435 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SF3B2Q13435 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SF3B2Q13435 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SF3B2Q13435 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
SF3B2Q13435 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
SF3B2Q13435 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SF3B2Q13435 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SF3B2Q13435 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SF3B2Q13435 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SF3B2Q13435 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SF3B2Q13435 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SF3B2Q13435 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
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