Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
HDLBPQ00341 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
HDLBPQ00341 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
HDLBPQ00341 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HDLBPQ00341 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HDLBPQ00341 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HDLBPQ00341 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HDLBPQ00341 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
HDLBPQ00341 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
HDLBPQ00341 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HDLBPQ00341 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HDLBPQ00341 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HDLBPQ00341 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HDLBPQ00341 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HDLBPQ00341 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
HDLBPQ00341 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HDLBPQ00341 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HDLBPQ00341 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HDLBPQ00341 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HDLBPQ00341 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HDLBPQ00341 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HDLBPQ00341 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HDLBPQ00341 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HDLBPQ00341 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HDLBPQ00341 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HDLBPQ00341 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HDLBPQ00341 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HDLBPQ00341 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HDLBPQ00341 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HDLBPQ00341 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HDLBPQ00341 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
HDLBPQ00341 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
HDLBPQ00341 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
HDLBPQ00341 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HDLBPQ00341 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HDLBPQ00341 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HDLBPQ00341 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HDLBPQ00341 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HDLBPQ00341 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HDLBPQ00341 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HDLBPQ00341 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HDLBPQ00341 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HDLBPQ00341 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HDLBPQ00341 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HDLBPQ00341 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HDLBPQ00341 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HDLBPQ00341 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HDLBPQ00341 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
HDLBPQ00341 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
HDLBPQ00341 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HDLBPQ00341 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HDLBPQ00341 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HDLBPQ00341 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HDLBPQ00341 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HDLBPQ00341 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HDLBPQ00341 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HDLBPQ00341 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HDLBPQ00341 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HDLBPQ00341 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HDLBPQ00341 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HDLBPQ00341 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
HDLBPQ00341 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HDLBPQ00341 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HDLBPQ00341 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
HDLBPQ00341 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HDLBPQ00341 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HDLBPQ00341 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HDLBPQ00341 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
HDLBPQ00341 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HDLBPQ00341 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HDLBPQ00341 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HDLBPQ00341 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HDLBPQ00341 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HDLBPQ00341 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HDLBPQ00341 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HDLBPQ00341 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HDLBPQ00341 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HDLBPQ00341 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HDLBPQ00341 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HDLBPQ00341 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HDLBPQ00341 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HDLBPQ00341 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HDLBPQ00341 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HDLBPQ00341 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
HDLBPQ00341 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
HDLBPQ00341 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HDLBPQ00341 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HDLBPQ00341 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
HDLBPQ00341 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HDLBPQ00341 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HDLBPQ00341 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HDLBPQ00341 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HDLBPQ00341 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HDLBPQ00341 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HDLBPQ00341 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HDLBPQ00341 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
HDLBPQ00341 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HDLBPQ00341 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HDLBPQ00341 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HDLBPQ00341 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms