Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3BGRP55822 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3BGRP55822 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3BGRP55822 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3BGRP55822 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3BGRP55822 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3BGRP55822 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3BGRP55822 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3BGRP55822 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3BGRP55822 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3BGRP55822 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3BGRP55822 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3BGRP55822 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SH3BGRP55822 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3BGRP55822 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3BGRP55822 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3BGRP55822 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3BGRP55822 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3BGRP55822 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3BGRP55822 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3BGRP55822 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3BGRP55822 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3BGRP55822 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3BGRP55822 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3BGRP55822 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3BGRP55822 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3BGRP55822 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3BGRP55822 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3BGRP55822 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3BGRP55822 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3BGRP55822 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3BGRP55822 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3BGRP55822 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3BGRP55822 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3BGRP55822 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3BGRP55822 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3BGRP55822 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3BGRP55822 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3BGRP55822 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3BGRP55822 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3BGRP55822 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3BGRP55822 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3BGRP55822 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3BGRP55822 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3BGRP55822 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SH3BGRP55822 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3BGRP55822 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3BGRP55822 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3BGRP55822 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3BGRP55822 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3BGRP55822 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3BGRP55822 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3BGRP55822 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SH3BGRP55822 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH3BGRP55822 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH3BGRP55822 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SH3BGRP55822 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH3BGRP55822 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH3BGRP55822 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SH3BGRP55822 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SH3BGRP55822 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH3BGRP55822 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH3BGRP55822 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3BGRP55822 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3BGRP55822 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3BGRP55822 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3BGRP55822 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3BGRP55822 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3BGRP55822 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3BGRP55822 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3BGRP55822 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3BGRP55822 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3BGRP55822 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3BGRP55822 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3BGRP55822 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3BGRP55822 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3BGRP55822 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3BGRP55822 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3BGRP55822 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3BGRP55822 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3BGRP55822 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3BGRP55822 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3BGRP55822 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3BGRP55822 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3BGRP55822 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3BGRP55822 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3BGRP55822 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3BGRP55822 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3BGRP55822 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3BGRP55822 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3BGRP55822 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3BGRP55822 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3BGRP55822 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3BGRP55822 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3BGRP55822 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3BGRP55822 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3BGRP55822 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3BGRP55822 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3BGRP55822 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3BGRP55822 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162 ms