Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MLH1P40692 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MLH1P40692 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MLH1P40692 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MLH1P40692 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MLH1P40692 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MLH1P40692 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MLH1P40692 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MLH1P40692 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MLH1P40692 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MLH1P40692 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MLH1P40692 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
MLH1P40692 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MLH1P40692 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
MLH1P40692 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MLH1P40692 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MLH1P40692 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MLH1P40692 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MLH1P40692 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MLH1P40692 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MLH1P40692 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MLH1P40692 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
MLH1P40692 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MLH1P40692 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MLH1P40692 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MLH1P40692 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MLH1P40692 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MLH1P40692 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MLH1P40692 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MLH1P40692 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MLH1P40692 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MLH1P40692 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MLH1P40692 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MLH1P40692 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MLH1P40692 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MLH1P40692 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MLH1P40692 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MLH1P40692 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MLH1P40692 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MLH1P40692 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MLH1P40692 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MLH1P40692 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MLH1P40692 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
MLH1P40692 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MLH1P40692 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MLH1P40692 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MLH1P40692 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MLH1P40692 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MLH1P40692 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MLH1P40692 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MLH1P40692 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MLH1P40692 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MLH1P40692 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MLH1P40692 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MLH1P40692 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MLH1P40692 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MLH1P40692 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MLH1P40692 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MLH1P40692 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MLH1P40692 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
MLH1P40692 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
MLH1P40692 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MLH1P40692 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MLH1P40692 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MLH1P40692 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MLH1P40692 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MLH1P40692 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MLH1P40692 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MLH1P40692 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MLH1P40692 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
MLH1P40692 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MLH1P40692 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MLH1P40692 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MLH1P40692 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MLH1P40692 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MLH1P40692 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MLH1P40692 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MLH1P40692 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MLH1P40692 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MLH1P40692 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MLH1P40692 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MLH1P40692 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MLH1P40692 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MLH1P40692 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
MLH1P40692 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MLH1P40692 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MLH1P40692 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MLH1P40692 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MLH1P40692 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MLH1P40692 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MLH1P40692 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MLH1P40692 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
MLH1P40692 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MLH1P40692 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
MLH1P40692 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MLH1P40692 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
MLH1P40692 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MLH1P40692 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MLH1P40692 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MLH1P40692 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.5 ms