Protein–RNA interactions for Protein: P20849

COL9A1, Collagen alpha-1(IX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A1P20849 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL9A1P20849 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
COL9A1P20849 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL9A1P20849 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL9A1P20849 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL9A1P20849 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL9A1P20849 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL9A1P20849 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL9A1P20849 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL9A1P20849 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL9A1P20849 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL9A1P20849 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL9A1P20849 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL9A1P20849 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL9A1P20849 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL9A1P20849 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
COL9A1P20849 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL9A1P20849 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL9A1P20849 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL9A1P20849 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL9A1P20849 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL9A1P20849 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL9A1P20849 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
COL9A1P20849 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL9A1P20849 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL9A1P20849 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL9A1P20849 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL9A1P20849 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL9A1P20849 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL9A1P20849 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL9A1P20849 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL9A1P20849 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL9A1P20849 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL9A1P20849 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
COL9A1P20849 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COL9A1P20849 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
COL9A1P20849 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COL9A1P20849 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COL9A1P20849 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COL9A1P20849 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COL9A1P20849 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COL9A1P20849 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
COL9A1P20849 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
COL9A1P20849 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
COL9A1P20849 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
COL9A1P20849 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
COL9A1P20849 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL9A1P20849 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL9A1P20849 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL9A1P20849 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL9A1P20849 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL9A1P20849 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL9A1P20849 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL9A1P20849 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL9A1P20849 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL9A1P20849 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL9A1P20849 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
COL9A1P20849 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL9A1P20849 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL9A1P20849 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL9A1P20849 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL9A1P20849 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL9A1P20849 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
COL9A1P20849 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL9A1P20849 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL9A1P20849 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
COL9A1P20849 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
COL9A1P20849 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL9A1P20849 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL9A1P20849 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL9A1P20849 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL9A1P20849 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL9A1P20849 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL9A1P20849 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL9A1P20849 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
COL9A1P20849 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL9A1P20849 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COL9A1P20849 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COL9A1P20849 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
COL9A1P20849 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL9A1P20849 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL9A1P20849 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL9A1P20849 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL9A1P20849 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
COL9A1P20849 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL9A1P20849 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL9A1P20849 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL9A1P20849 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL9A1P20849 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL9A1P20849 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL9A1P20849 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL9A1P20849 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL9A1P20849 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL9A1P20849 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL9A1P20849 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL9A1P20849 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL9A1P20849 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL9A1P20849 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL9A1P20849 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL9A1P20849 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms