Protein–RNA interactions for Protein: P0C091

FREM3, FRAS1-related extracellular matrix protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FREM3P0C091 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FREM3P0C091 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FREM3P0C091 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FREM3P0C091 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FREM3P0C091 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FREM3P0C091 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FREM3P0C091 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FREM3P0C091 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FREM3P0C091 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FREM3P0C091 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FREM3P0C091 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FREM3P0C091 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FREM3P0C091 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FREM3P0C091 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FREM3P0C091 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FREM3P0C091 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FREM3P0C091 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FREM3P0C091 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FREM3P0C091 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FREM3P0C091 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FREM3P0C091 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FREM3P0C091 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FREM3P0C091 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FREM3P0C091 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FREM3P0C091 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FREM3P0C091 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FREM3P0C091 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FREM3P0C091 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FREM3P0C091 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FREM3P0C091 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FREM3P0C091 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FREM3P0C091 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FREM3P0C091 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FREM3P0C091 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FREM3P0C091 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FREM3P0C091 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FREM3P0C091 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FREM3P0C091 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FREM3P0C091 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FREM3P0C091 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FREM3P0C091 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FREM3P0C091 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FREM3P0C091 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FREM3P0C091 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FREM3P0C091 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FREM3P0C091 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FREM3P0C091 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FREM3P0C091 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FREM3P0C091 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FREM3P0C091 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FREM3P0C091 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FREM3P0C091 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
FREM3P0C091 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FREM3P0C091 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
FREM3P0C091 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FREM3P0C091 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FREM3P0C091 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FREM3P0C091 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FREM3P0C091 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FREM3P0C091 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FREM3P0C091 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FREM3P0C091 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FREM3P0C091 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FREM3P0C091 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FREM3P0C091 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FREM3P0C091 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FREM3P0C091 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FREM3P0C091 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FREM3P0C091 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FREM3P0C091 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FREM3P0C091 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FREM3P0C091 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FREM3P0C091 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FREM3P0C091 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FREM3P0C091 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FREM3P0C091 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FREM3P0C091 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FREM3P0C091 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FREM3P0C091 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FREM3P0C091 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FREM3P0C091 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FREM3P0C091 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FREM3P0C091 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FREM3P0C091 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FREM3P0C091 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FREM3P0C091 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FREM3P0C091 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FREM3P0C091 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FREM3P0C091 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FREM3P0C091 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FREM3P0C091 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FREM3P0C091 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FREM3P0C091 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FREM3P0C091 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FREM3P0C091 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FREM3P0C091 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FREM3P0C091 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FREM3P0C091 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FREM3P0C091 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FREM3P0C091 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.3 ms