Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 GRN-221ENST00000593167 763 ntTSL 523.11■■□□□ 1.293e-7■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.223e-7■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.113e-7■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.783e-7■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.553e-7■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 SLC13A3-203ENST00000372121 848 ntTSL 518.04■□□□□ 0.483e-7■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 SLC13A3-206ENST00000420568 1256 ntTSL 518.04■□□□□ 0.483e-7■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.353e-7■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 GRN-219ENST00000592323 550 ntTSL 417.05■□□□□ 0.323e-7■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 GRN-220ENST00000592783 541 ntTSL 416.98■□□□□ 0.313e-7■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 GRN-212ENST00000588170 588 ntTSL 216.64■□□□□ 0.253e-7■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 GRN-218ENST00000591740 585 ntTSL 416.64■□□□□ 0.253e-7■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 GRN-211ENST00000588143 546 ntTSL 316.6■□□□□ 0.253e-7■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 GRN-209ENST00000587518 526 ntTSL 416.53■□□□□ 0.243e-7■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 GRN-208ENST00000587387 614 ntTSL 416.48■□□□□ 0.233e-7■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 GRN-210ENST00000587958 560 ntTSL 216.48■□□□□ 0.233e-7■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 SLC13A3-209ENST00000468915 1597 ntTSL 516.28■□□□□ 0.23e-7■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.123e-7■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 GRN-206ENST00000586782 843 ntTSL 515.44■□□□□ 0.063e-7■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 GRN-213ENST00000588237 558 ntTSL 514.71□□□□□ -0.053e-7■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 GPX3-208ENST00000521722 464 ntTSL 314.66□□□□□ -0.063e-7■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 IGFBP3-206ENST00000448817 571 ntTSL 413.76□□□□□ -0.213e-7■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 SLC13A3-211ENST00000495082 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.393e-7■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 SLC13A3-201ENST00000279027 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.493e-7■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 SLC13A3-210ENST00000472148 3283 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.83e-7■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 SLC13A3-202ENST00000290317 3994 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.13e-7■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.83e-7■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.093e-9■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.893e-9■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.033e-9■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 UBA52-214ENST00000599595 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.123e-9■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 UBA52-213ENST00000599551 707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.313e-9■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 UBA52-207ENST00000596273 764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.523e-9■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 UBA52-202ENST00000442744 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.63e-9■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 UBA52-205ENST00000595683 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.73e-9■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 UBA52-201ENST00000430157 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.723e-9■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 UBA52-203ENST00000594527 357 ntTSL 37.04□□□□□ -1.283e-9■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.293e-9■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 UBA52-206ENST00000596272 508 ntTSL 26.11□□□□□ -1.433e-9■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 ALDOA-223ENST00000567555 554 ntTSL 1 (best)17.47■□□□□ 0.396e-27■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 ALDOA-216ENST00000566012 553 ntTSL 515.14■□□□□ 0.016e-27■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.572e-12■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 SMARCC1-208ENST00000492896 568 ntTSL 49.81□□□□□ -0.842e-12■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 SMARCC1-202ENST00000425518 3827 ntTSL 27.53□□□□□ -1.22e-12■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.253e-12■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 PEBP1-202ENST00000542939 708 ntTSL 316.43■□□□□ 0.223e-12■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 03e-12■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.477e-11■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 CPSF6-201ENST00000266679 2229 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.287e-11■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.257e-11■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.937e-11■□□□□ 8.4
PCBP1Q15365 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.391e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 HMBS-215ENST00000542822 936 ntTSL 521.8■■□□□ 1.081e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 HMBS-212ENST00000542044 1544 ntTSL 521.45■■□□□ 1.021e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.021e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.971e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 HMBS-226ENST00000640813 1283 ntTSL 520.83■□□□□ 0.931e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.91e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 SQSTM1-204ENST00000453046 572 ntTSL 419.96■□□□□ 0.791e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 SQSTM1-209ENST00000504627 602 ntTSL 519.96■□□□□ 0.791e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 SQSTM1-212ENST00000508284 578 ntTSL 419.96■□□□□ 0.791e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 HMBS-223ENST00000545901 581 ntTSL 1 (best)19.26■□□□□ 0.671e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.621e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 HMBS-207ENST00000536185 441 ntTSL 317.76■□□□□ 0.431e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 HMBS-222ENST00000545621 1282 ntTSL 1 (best)17.76■□□□□ 0.431e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 HMBS-225ENST00000546302 707 ntTSL 517.76■□□□□ 0.431e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.421e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 HMBS-208ENST00000536813 507 ntTSL 317.28■□□□□ 0.361e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.21e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 SQSTM1-205ENST00000464493 532 ntTSL 416.06■□□□□ 0.161e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 PRCC-202ENST00000454659 1084 ntTSL 315.79■□□□□ 0.121e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 DDX39B-206ENST00000419338 928 ntTSL 515.71■□□□□ 0.111e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.061e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 HMBS-224ENST00000546226 2112 ntTSL 215.44■□□□□ 0.061e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 HMBS-218ENST00000543821 562 ntTSL 414.15□□□□□ -0.141e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 HMBS-202ENST00000392841 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.181e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 PRR13-202ENST00000429243 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.21e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 SQSTM1-207ENST00000481335 562 ntTSL 413.59□□□□□ -0.231e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.241e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 HMBS-205ENST00000535253 755 ntTSL 413.5□□□□□ -0.251e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 HMBS-211ENST00000539986 1155 ntTSL 313.5□□□□□ -0.251e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 DDX39B-204ENST00000418897 583 ntTSL 313.2□□□□□ -0.31e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 DDX39B-213ENST00000456976 720 ntTSL 513.2□□□□□ -0.31e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 DDX39B-208ENST00000428098 817 ntTSL 313.19□□□□□ -0.31e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 DDX39B-212ENST00000456662 932 ntTSL 513.19□□□□□ -0.31e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 SQSTM1-203ENST00000422245 628 ntTSL 412.9□□□□□ -0.341e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 DDX39B-205ENST00000419020 583 ntTSL 312.87□□□□□ -0.351e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 DDX39B-209ENST00000428450 633 ntTSL 412.81□□□□□ -0.361e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 SPEN-205ENST00000487496 543 ntTSL 1 (best)12.73□□□□□ -0.371e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 ATP6V1G2-DDX39B-203ENST00000480131 552 ntAPPRIS P1 TSL 412.4□□□□□ -0.421e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 PRCC-207ENST00000526188 634 ntTSL 212.35□□□□□ -0.431e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 PRR13-208ENST00000549740 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.491e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 HMBS-217ENST00000543543 1796 ntTSL 511.92□□□□□ -0.51e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 NUP214-226ENST00000531600 1775 ntTSL 211.81□□□□□ -0.521e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 DDX39B-211ENST00000449757 591 ntTSL 311.44□□□□□ -0.581e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 PRR13-201ENST00000379786 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.61e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 NUP214-220ENST00000529286 493 ntTSL 310.77□□□□□ -0.691e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 PRR13-210ENST00000551003 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.771e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 NUP214-204ENST00000453861 3208 ntTSL 59.9□□□□□ -0.821e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 HMBS-206ENST00000535793 832 ntTSL 59.73□□□□□ -0.851e-6■□□□□ 8.3
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