Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 NOP58-208ENST00000488403 871 ntTSL 214.56□□□□□ -0.081e-8■■□□□ 11.9
ILF3Q12906 NOP58-202ENST00000426814 655 ntTSL 214.42□□□□□ -0.11e-8■■□□□ 11.9
ILF3Q12906 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.191e-8■■□□□ 11.9
ILF3Q12906 SPG7-207ENST00000563218 654 ntTSL 513.24□□□□□ -0.291e-8■■□□□ 11.9
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ILF3Q12906 NOP58-205ENST00000472050 582 ntTSL 311.23□□□□□ -0.611e-8■■□□□ 11.9
ILF3Q12906 NOP58-204ENST00000467734 638 ntTSL 511.14□□□□□ -0.631e-8■■□□□ 11.9
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ILF3Q12906 CTBP1-216ENST00000514669 809 ntTSL 316.96■□□□□ 0.312e-7■■□□□ 11.9
ILF3Q12906 CTBP1-210ENST00000510739 774 ntTSL 315.88■□□□□ 0.132e-7■■□□□ 11.9
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ILF3Q12906 Z98749.2-203ENST00000407491 574 ntTSL 316.55■□□□□ 0.244e-6■■□□□ 11.9
ILF3Q12906 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.224e-6■■□□□ 11.9
ILF3Q12906 Z98749.2-204ENST00000443042 579 ntTSL 415.8■□□□□ 0.124e-6■■□□□ 11.9
ILF3Q12906 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.094e-6■■□□□ 11.9
ILF3Q12906 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.094e-6■■□□□ 11.9
ILF3Q12906 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.064e-6■■□□□ 11.9
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ILF3Q12906 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.52□□□□□ -2.014e-6■■□□□ 11.9
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ILF3Q12906 STIL-202ENST00000360380 5225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.622e-6■■□□□ 11.8
ILF3Q12906 STIL-209ENST00000447475 2984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)7.96□□□□□ -1.142e-6■■□□□ 11.8
ILF3Q12906 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.352e-6■■□□□ 11.8
ILF3Q12906 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.392e-6■■□□□ 11.8
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ILF3Q12906 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.063e-6■■□□□ 11.8
ILF3Q12906 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.371e-6■■□□□ 11.7
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ILF3Q12906 NPIPA1-201ENST00000328085 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.971e-11■■□□□ 11.7
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ILF3Q12906 SLC38A1-201ENST00000398637 8066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.563e-6■■□□□ 11.7
ILF3Q12906 KIAA1524-204ENST00000481530 2764 ntTSL 1 (best)11.42□□□□□ -0.583e-6■■□□□ 11.7
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ILF3Q12906 TMEM18-201ENST00000281017 2762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.63e-6■■□□□ 11.7
ILF3Q12906 SLC38A1-202ENST00000439706 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.613e-6■■□□□ 11.7
ILF3Q12906 TMEM18-202ENST00000355654 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.633e-6■■□□□ 11.7
ILF3Q12906 SRSF10-202ENST00000341154 2839 ntTSL 211□□□□□ -0.653e-6■■□□□ 11.7
ILF3Q12906 SRSF10-203ENST00000343255 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.693e-6■■□□□ 11.7
ILF3Q12906 SLC38A1-210ENST00000552197 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.73e-6■■□□□ 11.7
ILF3Q12906 SRSF10-214ENST00000492112 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.733e-6■■□□□ 11.7
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ILF3Q12906 AL390719.1-202ENST00000394517 397 ntTSL 59.61□□□□□ -0.873e-6■■□□□ 11.7
ILF3Q12906 AMOTL1-202ENST00000317829 8844 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.93e-6■■□□□ 11.7
ILF3Q12906 AMOTL1-203ENST00000433060 8970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.913e-6■■□□□ 11.7
ILF3Q12906 KIF2C-201ENST00000372217 2955 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.011e-6■■□□□ 11.7
ILF3Q12906 KIAA1524-201ENST00000295746 4075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.023e-6■■□□□ 11.7
ILF3Q12906 SRSF10-204ENST00000344989 3487 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.043e-6■■□□□ 11.7
ILF3Q12906 SRSF10-207ENST00000453840 1808 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.073e-6■■□□□ 11.7
ILF3Q12906 CHD4-208ENST00000540960 892 ntTSL 57.96□□□□□ -1.143e-6■■□□□ 11.7
ILF3Q12906 SRSF10-210ENST00000473858 778 ntTSL 27.85□□□□□ -1.153e-6■■□□□ 11.7
ILF3Q12906 SRSF10-215ENST00000495785 1390 ntTSL 57.21□□□□□ -1.253e-6■■□□□ 11.7
ILF3Q12906 KIAA1524-207ENST00000619684 2839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.33e-6■■□□□ 11.7
ILF3Q12906 SRSF10-213ENST00000485841 3957 ntTSL 25.99□□□□□ -1.453e-6■■□□□ 11.7
ILF3Q12906 CHD4-205ENST00000536301 107 ntTSL 35.2□□□□□ -1.583e-6■■□□□ 11.7
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