Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.151e-6■■■■■ 154.5
UTP3Q9NQZ2 FRMD8-209ENST00000533782 677 ntTSL 524.78■■□□□ 1.564e-6■■■■■ 154.5
UTP3Q9NQZ2 FRMD8-205ENST00000526201 568 ntTSL 524.57■■□□□ 1.524e-6■■■■■ 154.5
UTP3Q9NQZ2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.464e-6■■■■■ 154.5
UTP3Q9NQZ2 TXNRD2-213ENST00000487165 2020 ntTSL 1 (best)18.79■□□□□ 0.67e-11■■■■■ 154.5
UTP3Q9NQZ2 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.587e-11■■■■■ 154.5
UTP3Q9NQZ2 TXNRD2-207ENST00000462843 810 ntTSL 317.71■□□□□ 0.437e-11■■■■■ 154.5
UTP3Q9NQZ2 TXNRD2-219ENST00000634471 748 ntTSL 317.71■□□□□ 0.437e-11■■■■■ 154.5
UTP3Q9NQZ2 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.423e-6■■■■■ 154.5
UTP3Q9NQZ2 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.423e-6■■■■■ 154.5
UTP3Q9NQZ2 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.174e-6■■■■■ 154.5
UTP3Q9NQZ2 IPO13-206ENST00000489773 501 ntTSL 315.34■□□□□ 0.053e-6■■■■■ 154.5
UTP3Q9NQZ2 TXNRD2-216ENST00000495655 2700 ntTSL 215.11■□□□□ 0.017e-11■■■■■ 154.5
UTP3Q9NQZ2 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.014e-6■■■■■ 154.5
UTP3Q9NQZ2 PIK3CD-202ENST00000377346 5203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.033e-6■■■■■ 154.5
UTP3Q9NQZ2 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.047e-11■■■■■ 154.5
UTP3Q9NQZ2 IPO13-202ENST00000372343 3894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.393e-6■■■■■ 154.5
UTP3Q9NQZ2 DNAJC7-223ENST00000591787 566 ntTSL 411.11□□□□□ -0.637e-11■■■■■ 154.5
UTP3Q9NQZ2 DNAJC7-218ENST00000590348 832 ntTSL 59.65□□□□□ -0.867e-11■■■■■ 154.5
UTP3Q9NQZ2 DNAJC7-215ENST00000589773 678 ntTSL 39.51□□□□□ -0.897e-11■■■■■ 154.5
UTP3Q9NQZ2 MAD1L1-219ENST00000481633 548 ntTSL 215.36■□□□□ 0.052e-6■■■■■ 154.4
UTP3Q9NQZ2 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.65e-9■■■■■ 154.1
UTP3Q9NQZ2 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.465e-9■■■■■ 154.1
UTP3Q9NQZ2 HDAC5-204ENST00000586802 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.435e-9■■■■■ 154.1
UTP3Q9NQZ2 RECQL5-204ENST00000423245 3576 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.151e-7■■■■■ 154.1
UTP3Q9NQZ2 RECQL5-201ENST00000317905 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.271e-7■■■■■ 154.1
UTP3Q9NQZ2 FANCL-203ENST00000403295 1576 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.062e-6■■■■■ 154.1
UTP3Q9NQZ2 FANCL-201ENST00000233741 1683 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.12e-6■■■■■ 154.1
UTP3Q9NQZ2 FANCL-202ENST00000402135 1698 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.15□□□□□ -1.12e-6■■■■■ 154.1
UTP3Q9NQZ2 MON2-212ENST00000552115 3760 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.222e-6■■■■■ 154.1
UTP3Q9NQZ2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.841e-6■■■■■ 154
UTP3Q9NQZ2 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.481e-6■■■■■ 154
UTP3Q9NQZ2 LIN54-201ENST00000340417 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.021e-6■■■■■ 154
UTP3Q9NQZ2 LIN54-210ENST00000510877 4507 ntTSL 1 (best)13.76□□□□□ -0.211e-6■■■■■ 154
UTP3Q9NQZ2 LIN54-206ENST00000506560 2757 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.271e-6■■■■■ 154
UTP3Q9NQZ2 LIN54-207ENST00000508171 2684 ntTSL 1 (best)11.86□□□□□ -0.511e-6■■■■■ 154
UTP3Q9NQZ2 LIN54-202ENST00000442461 4254 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.561e-6■■■■■ 154
UTP3Q9NQZ2 LIN54-203ENST00000446851 4083 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.591e-6■■■■■ 154
UTP3Q9NQZ2 RAB3GAP1-201ENST00000264158 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.642e-6■■■■■ 154
UTP3Q9NQZ2 RAB3GAP1-203ENST00000442034 4185 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.82e-6■■■■■ 154
UTP3Q9NQZ2 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.312e-6■■■■■ 154
UTP3Q9NQZ2 RAB3GAP1-204ENST00000487003 3506 ntTSL 55.99□□□□□ -1.452e-6■■■■■ 154
UTP3Q9NQZ2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.783e-10■■■■■ 153.8
UTP3Q9NQZ2 ERC1-224ENST00000592048 1275 ntTSL 528.51■■■□□ 2.153e-10■■■■■ 153.8
UTP3Q9NQZ2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.133e-10■■■■■ 153.8
UTP3Q9NQZ2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.123e-10■■■■■ 153.8
UTP3Q9NQZ2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.033e-10■■■■■ 153.8
UTP3Q9NQZ2 BEGAIN-204ENST00000554140 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 527.25■■□□□ 1.953e-10■■■■■ 153.8
UTP3Q9NQZ2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.883e-10■■■■■ 153.8
UTP3Q9NQZ2 PARL-205ENST00000421484 1347 ntTSL 526.76■■□□□ 1.873e-10■■■■■ 153.8
UTP3Q9NQZ2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.873e-10■■■■■ 153.8
UTP3Q9NQZ2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.813e-10■■■■■ 153.8
UTP3Q9NQZ2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.733e-10■■■■■ 153.8
UTP3Q9NQZ2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.713e-10■■■■■ 153.8
UTP3Q9NQZ2 ANKS3-207ENST00000586605 968 ntTSL 525.74■■□□□ 1.713e-10■■■■■ 153.8
UTP3Q9NQZ2 ANKS3-226ENST00000592698 1128 ntTSL 525.74■■□□□ 1.713e-10■■■■■ 153.8
UTP3Q9NQZ2 PARL-213ENST00000639900 1545 ntTSL 525.47■■□□□ 1.673e-10■■■■■ 153.8
UTP3Q9NQZ2 ANKS3-206ENST00000586166 672 ntTSL 325.33■■□□□ 1.653e-10■■■■■ 153.8
UTP3Q9NQZ2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.583e-10■■■■■ 153.8
UTP3Q9NQZ2 ANKS3-217ENST00000590730 2198 ntTSL 224.83■■□□□ 1.573e-10■■■■■ 153.8
UTP3Q9NQZ2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.573e-10■■■■■ 153.8
UTP3Q9NQZ2 SORBS3-215ENST00000522721 601 ntTSL 424.72■■□□□ 1.553e-10■■■■■ 153.8
UTP3Q9NQZ2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.543e-10■■■■■ 153.8
UTP3Q9NQZ2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.533e-10■■■■■ 153.8
UTP3Q9NQZ2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.533e-10■■■■■ 153.8
UTP3Q9NQZ2 GPRC5B-204ENST00000562469 818 ntTSL 424.63■■□□□ 1.533e-10■■■■■ 153.8
UTP3Q9NQZ2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.523e-10■■■■■ 153.8
UTP3Q9NQZ2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.483e-10■■■■■ 153.8
UTP3Q9NQZ2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.423e-10■■■■■ 153.8
UTP3Q9NQZ2 TAF1B-206ENST00000469895 681 ntTSL 323.73■■□□□ 1.393e-10■■■■■ 153.8
UTP3Q9NQZ2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.383e-10■■■■■ 153.8
UTP3Q9NQZ2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.373e-10■■■■■ 153.8
UTP3Q9NQZ2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.363e-10■■■■■ 153.8
UTP3Q9NQZ2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.363e-10■■■■■ 153.8
UTP3Q9NQZ2 ANKS3-225ENST00000592421 1146 ntTSL 323.52■■□□□ 1.363e-10■■■■■ 153.8
UTP3Q9NQZ2 ECHDC3-205ENST00000496136 1767 ntTSL 1 (best)23.47■■□□□ 1.353e-10■■■■■ 153.8
UTP3Q9NQZ2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.353e-10■■■■■ 153.8
UTP3Q9NQZ2 GAS2L1-202ENST00000416823 745 ntTSL 423.35■■□□□ 1.333e-10■■■■■ 153.8
UTP3Q9NQZ2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.293e-10■■■■■ 153.8
UTP3Q9NQZ2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.273e-10■■■■■ 153.8
UTP3Q9NQZ2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.253e-10■■■■■ 153.8
UTP3Q9NQZ2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.233e-10■■■■■ 153.8
UTP3Q9NQZ2 SORBS3-202ENST00000517500 1228 ntTSL 222.53■■□□□ 1.23e-10■■■■■ 153.8
UTP3Q9NQZ2 SPHK1-206ENST00000590379 588 ntTSL 322.45■■□□□ 1.183e-10■■■■■ 153.8
UTP3Q9NQZ2 SPHK1-208ENST00000591651 541 ntTSL 422.36■■□□□ 1.173e-10■■■■■ 153.8
UTP3Q9NQZ2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.173e-10■■■■■ 153.8
UTP3Q9NQZ2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.153e-10■■■■■ 153.8
UTP3Q9NQZ2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.143e-10■■■■■ 153.8
UTP3Q9NQZ2 SORBS3-203ENST00000517535 3067 ntTSL 222■■□□□ 1.113e-10■■■■■ 153.8
UTP3Q9NQZ2 SNX11-207ENST00000580875 704 ntTSL 221.94■■□□□ 1.13e-10■■■■■ 153.8
UTP3Q9NQZ2 GAS2L1-204ENST00000487341 550 ntTSL 421.91■■□□□ 1.13e-10■■■■■ 153.8
UTP3Q9NQZ2 SORBS3-218ENST00000523740 983 ntTSL 321.87■■□□□ 1.093e-10■■■■■ 153.8
UTP3Q9NQZ2 SNX11-209ENST00000581705 1426 ntTSL 221.85■■□□□ 1.093e-10■■■■■ 153.8
UTP3Q9NQZ2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.083e-10■■■■■ 153.8
UTP3Q9NQZ2 SYT16-206ENST00000636133 740 ntTSL 521.7■■□□□ 1.063e-10■■■■■ 153.8
UTP3Q9NQZ2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.053e-10■■■■■ 153.8
UTP3Q9NQZ2 TNRC18-208ENST00000455076 577 ntTSL 221.62■■□□□ 1.053e-10■■■■■ 153.8
UTP3Q9NQZ2 PARL-211ENST00000638817 1534 ntTSL 521.5■■□□□ 1.033e-10■■■■■ 153.8
UTP3Q9NQZ2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.033e-10■■■■■ 153.8
UTP3Q9NQZ2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.023e-10■■■■■ 153.8
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