RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533782.5

FRMD8-209, Transcript of FERM domain containing 8, humanhuman

TSL 5

Gene FRMD8, Length 677 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD8-209ENST00000533782 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.56■■■■■ 7.13
FRMD8-209ENST00000533782 ABCC9O60706 1549 aa54.03■■■■■ 6.24
FRMD8-209ENST00000533782 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.62■■■■■ 6.17
FRMD8-209ENST00000533782 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.23■■■■■ 5.79
FRMD8-209ENST00000533782 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.07■■■■■ 5.77
FRMD8-209ENST00000533782 NACADO15069 1562 aa50.78■■■■■ 5.72
FRMD8-209ENST00000533782 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.46■■■■■ 5.67
FRMD8-209ENST00000533782 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.24■■■■■ 5.63
FRMD8-209ENST00000533782 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.14■■■■■ 5.62
FRMD8-209ENST00000533782 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.93■■■■■ 5.58
FRMD8-209ENST00000533782 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.79■■■■■ 5.56
FRMD8-209ENST00000533782 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.26■■■■■ 5.48
FRMD8-209ENST00000533782 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.15■■■■■ 5.46
FRMD8-209ENST00000533782 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49■■■■■ 5.44
FRMD8-209ENST00000533782 SCRIBQ14160 1630 aa48.84■■■■■ 5.41
FRMD8-209ENST00000533782 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.8■■■■■ 5.4
FRMD8-209ENST00000533782 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.7■■■■■ 5.39
FRMD8-209ENST00000533782 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.58■■■■■ 5.37
FRMD8-209ENST00000533782 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.17■■■■■ 5.14
FRMD8-209ENST00000533782 NCAPD3P42695 1498 aa46.89■■■■■ 5.1
FRMD8-209ENST00000533782 CUX2O14529 1486 aa46.7■■■■■ 5.07
FRMD8-209ENST00000533782 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.7■■■■■ 5.07
FRMD8-209ENST00000533782 ERCC6Q03468 1493 aa46.64■■■■■ 5.06
FRMD8-209ENST00000533782 SMARCA4P51532 1647 aa46.55■■■■■ 5.04
FRMD8-209ENST00000533782 SMARCA2P51531 1590 aa46.52■■■■■ 5.04
FRMD8-209ENST00000533782 HMGXB3Q12766 1538 aa46.49■■■■■ 5.03
FRMD8-209ENST00000533782 NESP48681 1621 aa46.31■■■■■ 5
FRMD8-209ENST00000533782 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.24■■■■■ 4.99
FRMD8-209ENST00000533782 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.21■■■■■ 4.99
FRMD8-209ENST00000533782 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.09■■■■■ 4.97
FRMD8-209ENST00000533782 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.91■■■■■ 4.94
FRMD8-209ENST00000533782 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.9■■■■■ 4.94
FRMD8-209ENST00000533782 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.89■■■■■ 4.94
FRMD8-209ENST00000533782 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.71■■■■■ 4.91
FRMD8-209ENST00000533782 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.63■■■■■ 4.9
FRMD8-209ENST00000533782 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.45■■■■■ 4.87
FRMD8-209ENST00000533782 WIZO95785 1651 aa45.34■■■■■ 4.85
FRMD8-209ENST00000533782 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.27■■■■■ 4.84
FRMD8-209ENST00000533782 WDR62O43379 1518 aa45.18■■■■■ 4.82
FRMD8-209ENST00000533782 CEP164Q9UPV0 1460 aa45■■■■■ 4.79
FRMD8-209ENST00000533782 TRIM41Q8WV44 630 aa44.93■■■■■ 4.78
FRMD8-209ENST00000533782 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.92■■■■■ 4.78
FRMD8-209ENST00000533782 CFTRP13569 1480 aa44.85■■■■■ 4.77
FRMD8-209ENST00000533782 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.79■■■■■ 4.76
FRMD8-209ENST00000533782 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.71■■■■■ 4.75
FRMD8-209ENST00000533782 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.6■■■■■ 4.73
FRMD8-209ENST00000533782 OSCARQ8IYS5 282 aa44.52■■■■■ 4.72
FRMD8-209ENST00000533782 PRDM2Q13029 1718 aa44.4■■■■■ 4.7
FRMD8-209ENST00000533782 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.22■■■■■ 4.67
FRMD8-209ENST00000533782 IFT140Q96RY7 1462 aa44.12■■■■■ 4.65
FRMD8-209ENST00000533782 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.12■■■■■ 4.65
FRMD8-209ENST00000533782 TOPBP1Q92547 1522 aa44.04■■■■■ 4.64
FRMD8-209ENST00000533782 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44■■■■■ 4.63
FRMD8-209ENST00000533782 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44■■■■■ 4.63
FRMD8-209ENST00000533782 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44■■■■■ 4.63
FRMD8-209ENST00000533782 ABCC8Q09428 1581 aa43.9■■■■■ 4.62
FRMD8-209ENST00000533782 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.84■■■■■ 4.61
FRMD8-209ENST00000533782 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.84■■■■■ 4.61
FRMD8-209ENST00000533782 ARHGEF11O15085 1522 aa43.81■■■■■ 4.6
FRMD8-209ENST00000533782 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.7■■■■■ 4.59
FRMD8-209ENST00000533782 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.67■■■■■ 4.584e-9■■■■■ 32.9
FRMD8-209ENST00000533782 CHD1O14646 1710 aa43.63■■■■■ 4.58
FRMD8-209ENST00000533782 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.56■■■■■ 4.56
FRMD8-209ENST00000533782 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.52■■■■■ 4.56
FRMD8-209ENST00000533782 FBLN2P98095 1184 aa43.45■■■■■ 4.55
FRMD8-209ENST00000533782 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.43■■■■■ 4.54
FRMD8-209ENST00000533782 SOGA1O94964 1423 aa43.36■■■■■ 4.53
FRMD8-209ENST00000533782 ARAP1Q96P48 1450 aa43.35■■■■■ 4.53
FRMD8-209ENST00000533782 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.33■■■■■ 4.53
FRMD8-209ENST00000533782 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.24■■■■■ 4.51
FRMD8-209ENST00000533782 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.19■■■■■ 4.51
FRMD8-209ENST00000533782 WDR97A6NE52 1622 aa43.19■■■■■ 4.5
FRMD8-209ENST00000533782 TRHP20396 242 aaPredicted RBP43.15■■■■■ 4.5
FRMD8-209ENST00000533782 CUX1P39880 1505 aa43.15■■■■■ 4.5
FRMD8-209ENST00000533782 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.09■■■■■ 4.49
FRMD8-209ENST00000533782 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.06■■■■■ 4.48
FRMD8-209ENST00000533782 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.06■■■■■ 4.48
FRMD8-209ENST00000533782 GRIN2BQ13224 1484 aa43.01■■■■■ 4.48
FRMD8-209ENST00000533782 SYNJ1O43426 1573 aa43.01■■■■■ 4.48
FRMD8-209ENST00000533782 SYNJ2O15056 1496 aa42.93■■■■■ 4.46
FRMD8-209ENST00000533782 PBRM1Q86U86 1689 aa42.86■■■■■ 4.45
FRMD8-209ENST00000533782 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.82■■■■■ 4.45
FRMD8-209ENST00000533782 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.71■■■■■ 4.43
FRMD8-209ENST00000533782 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.7■■■■■ 4.43
FRMD8-209ENST00000533782 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.51■■■■■ 4.4
FRMD8-209ENST00000533782 GRIN2AQ12879 1464 aa42.47■■■■■ 4.39
FRMD8-209ENST00000533782 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.45■■■■■ 4.39
FRMD8-209ENST00000533782 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.42■■■■■ 4.38
FRMD8-209ENST00000533782 ADAMTS12P58397 1594 aa42.4■■■■■ 4.38
FRMD8-209ENST00000533782 CEP170Q5SW79 1584 aa42.35■■■■■ 4.37
FRMD8-209ENST00000533782 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.35■■■■■ 4.37
FRMD8-209ENST00000533782 NUP160Q12769 1436 aa42.35■■■■■ 4.37
FRMD8-209ENST00000533782 TOP2BQ02880 1626 aa42.33■■■■■ 4.37
FRMD8-209ENST00000533782 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.25■■■■■ 4.35
FRMD8-209ENST00000533782 SHROOM2Q13796 1616 aa42.22■■■■■ 4.35
FRMD8-209ENST00000533782 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP42.18■■■■■ 4.34
FRMD8-209ENST00000533782 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.16■■■■■ 4.34
FRMD8-209ENST00000533782 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.97■■■■■ 4.31
FRMD8-209ENST00000533782 JPH4Q96JJ6 628 aa41.92■■■■■ 4.3
FRMD8-209ENST00000533782 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.9■■■■■ 4.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms