RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526201.1

FRMD8-205, Transcript of FERM domain containing 8, humanhuman

TSL 5

Gene FRMD8, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD8-205ENST00000526201 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.19■■■■■ 6.59
FRMD8-205ENST00000526201 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.03■■■■■ 5.6
FRMD8-205ENST00000526201 ABCC9O60706 1549 aa49.23■■■■■ 5.47
FRMD8-205ENST00000526201 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.21■■■■■ 5.15
FRMD8-205ENST00000526201 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.15■■■■■ 5.14
FRMD8-205ENST00000526201 NACADO15069 1562 aa47.1■■■■■ 5.13
FRMD8-205ENST00000526201 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.74■■■■■ 5.07
FRMD8-205ENST00000526201 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.69■■■■■ 5.06
FRMD8-205ENST00000526201 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.43■■■■■ 5.02
FRMD8-205ENST00000526201 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.23■■■■■ 4.99
FRMD8-205ENST00000526201 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46■■■■■ 4.95
FRMD8-205ENST00000526201 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.81■■■■■ 4.92
FRMD8-205ENST00000526201 SCRIBQ14160 1630 aa45.69■■■■■ 4.9
FRMD8-205ENST00000526201 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.42■■■■■ 4.86
FRMD8-205ENST00000526201 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.2■■■■■ 4.83
FRMD8-205ENST00000526201 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.6■■■■■ 4.73
FRMD8-205ENST00000526201 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.51■■■■■ 4.72
FRMD8-205ENST00000526201 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.23■■■■■ 4.67
FRMD8-205ENST00000526201 SMARCA4P51532 1647 aa43.65■■■■■ 4.58
FRMD8-205ENST00000526201 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.54■■■■■ 4.56
FRMD8-205ENST00000526201 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.47■■■■■ 4.55
FRMD8-205ENST00000526201 NCAPD3P42695 1498 aa43.46■■■■■ 4.55
FRMD8-205ENST00000526201 SMARCA2P51531 1590 aa43.39■■■■■ 4.54
FRMD8-205ENST00000526201 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.33■■■■■ 4.53
FRMD8-205ENST00000526201 HMGXB3Q12766 1538 aa43.2■■■■■ 4.51
FRMD8-205ENST00000526201 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.19■■■■■ 4.5
FRMD8-205ENST00000526201 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.1■■■■■ 4.49
FRMD8-205ENST00000526201 WIZO95785 1651 aa42.88■■■■■ 4.45
FRMD8-205ENST00000526201 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.73■■■■■ 4.43
FRMD8-205ENST00000526201 NESP48681 1621 aa42.54■■■■■ 4.4
FRMD8-205ENST00000526201 ERCC6Q03468 1493 aa42.43■■■■■ 4.38
FRMD8-205ENST00000526201 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.35■■■■■ 4.37
FRMD8-205ENST00000526201 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.35■■■■■ 4.37
FRMD8-205ENST00000526201 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.2■■■■■ 4.35
FRMD8-205ENST00000526201 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.08■■■■■ 4.33
FRMD8-205ENST00000526201 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.04■■■■■ 4.32
FRMD8-205ENST00000526201 CUX2O14529 1486 aa42.01■■■■■ 4.32
FRMD8-205ENST00000526201 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.9■■■■■ 4.3
FRMD8-205ENST00000526201 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.89■■■■■ 4.3
FRMD8-205ENST00000526201 CFTRP13569 1480 aa41.89■■■■■ 4.3
FRMD8-205ENST00000526201 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.72■■■■■ 4.27
FRMD8-205ENST00000526201 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.68■■■■■ 4.26
FRMD8-205ENST00000526201 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.66■■■■■ 4.26
FRMD8-205ENST00000526201 PRDM2Q13029 1718 aa41.61■■■■■ 4.25
FRMD8-205ENST00000526201 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.58■■■■■ 4.25
FRMD8-205ENST00000526201 WDR62O43379 1518 aa41.52■■■■■ 4.24
FRMD8-205ENST00000526201 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.32■■■■■ 4.2
FRMD8-205ENST00000526201 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.04■■■■■ 4.16
FRMD8-205ENST00000526201 TOPBP1Q92547 1522 aa41.03■■■■■ 4.16
FRMD8-205ENST00000526201 ABCC8Q09428 1581 aa40.99■■■■■ 4.15
FRMD8-205ENST00000526201 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.95■■■■■ 4.15
FRMD8-205ENST00000526201 IFT140Q96RY7 1462 aa40.81■■■■■ 4.12
FRMD8-205ENST00000526201 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.67■■■■■ 4.1
FRMD8-205ENST00000526201 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
FRMD8-205ENST00000526201 CUX1P39880 1505 aa40.65■■■■■ 4.1
FRMD8-205ENST00000526201 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.6■■■■■ 4.09
FRMD8-205ENST00000526201 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.54■■■■■ 4.08
FRMD8-205ENST00000526201 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.53■■■■■ 4.08
FRMD8-205ENST00000526201 SOGA1O94964 1423 aa40.51■■■■■ 4.08
FRMD8-205ENST00000526201 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.48■■■■■ 4.07
FRMD8-205ENST00000526201 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.44■■■■■ 4.064e-9■■■■■ 32.9
FRMD8-205ENST00000526201 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.33■■■■■ 4.05
FRMD8-205ENST00000526201 OSCARQ8IYS5 282 aa40.3■■■■■ 4.04
FRMD8-205ENST00000526201 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.3■■■■■ 4.04
FRMD8-205ENST00000526201 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.24■■■■■ 4.03
FRMD8-205ENST00000526201 TOP2BQ02880 1626 aa40.23■■■■■ 4.03
FRMD8-205ENST00000526201 SYNJ1O43426 1573 aa40.23■■■■■ 4.03
FRMD8-205ENST00000526201 WDR97A6NE52 1622 aa40.21■■■■■ 4.03
FRMD8-205ENST00000526201 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.11■■■■■ 4.01
FRMD8-205ENST00000526201 CHD1O14646 1710 aa40.08■■■■■ 4.01
FRMD8-205ENST00000526201 GRIN2BQ13224 1484 aa40.04■■■■■ 4
FRMD8-205ENST00000526201 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.03■■■■■ 4
FRMD8-205ENST00000526201 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.03■■■■■ 4
FRMD8-205ENST00000526201 FBLN2P98095 1184 aa40.03■■■■■ 4
FRMD8-205ENST00000526201 PBRM1Q86U86 1689 aa39.99■■■■□ 3.99
FRMD8-205ENST00000526201 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.98■■■■□ 3.99
FRMD8-205ENST00000526201 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.94■■■■□ 3.98
FRMD8-205ENST00000526201 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.86■■■■□ 3.97
FRMD8-205ENST00000526201 SYNJ2O15056 1496 aa39.8■■■■□ 3.96
FRMD8-205ENST00000526201 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.67■■■■□ 3.94
FRMD8-205ENST00000526201 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.67■■■■□ 3.94
FRMD8-205ENST00000526201 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.67■■■■□ 3.94
FRMD8-205ENST00000526201 TRIM41Q8WV44 630 aa39.66■■■■□ 3.94
FRMD8-205ENST00000526201 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.63■■■■□ 3.93
FRMD8-205ENST00000526201 ADAMTS12P58397 1594 aa39.62■■■■□ 3.93
FRMD8-205ENST00000526201 ARHGEF11O15085 1522 aa39.61■■■■□ 3.93
FRMD8-205ENST00000526201 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.57■■■■□ 3.93
FRMD8-205ENST00000526201 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.55■■■■□ 3.92
FRMD8-205ENST00000526201 GRIN2AQ12879 1464 aa39.53■■■■□ 3.92
FRMD8-205ENST00000526201 KIF27Q86VH2 1401 aa39.48■■■■□ 3.91
FRMD8-205ENST00000526201 IGF1RP08069 1367 aa39.36■■■■□ 3.89
FRMD8-205ENST00000526201 CEP170Q5SW79 1584 aa39.36■■■■□ 3.89
FRMD8-205ENST00000526201 NUP160Q12769 1436 aa39.35■■■■□ 3.89
FRMD8-205ENST00000526201 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.33■■■■□ 3.89
FRMD8-205ENST00000526201 ARAP1Q96P48 1450 aa39.29■■■■□ 3.88
FRMD8-205ENST00000526201 CUL7Q14999 1698 aa39.24■■■■□ 3.87
FRMD8-205ENST00000526201 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.13■■■■□ 3.85
FRMD8-205ENST00000526201 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.11■■■■□ 3.85
FRMD8-205ENST00000526201 SHROOM2Q13796 1616 aa39.08■■■■□ 3.85
FRMD8-205ENST00000526201 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.06■■■■□ 3.84
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