RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638817.1

PARL-211, Transcript of presenilin associated rhomboid like, humanhuman

TSL 5

Gene PARL, Length 1,534 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARL-211ENST00000638817 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.17■■■■■ 5.78
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PARL-211ENST00000638817 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.64■■■■■ 4.58
PARL-211ENST00000638817 NACADO15069 1562 aa43.38■■■■■ 4.54
PARL-211ENST00000638817 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.99■■■■■ 4.47
PARL-211ENST00000638817 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.87■■■■■ 4.45
PARL-211ENST00000638817 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.76■■■■■ 4.44
PARL-211ENST00000638817 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.66■■■■■ 4.42
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PARL-211ENST00000638817 SCRIBQ14160 1630 aa41.77■■■■■ 4.28
PARL-211ENST00000638817 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.35■■■■■ 4.21
PARL-211ENST00000638817 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.3■■■■■ 4.2
PARL-211ENST00000638817 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.19■■■■■ 4.19
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PARL-211ENST00000638817 SMARCA2P51531 1590 aa39.82■■■■□ 3.96
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PARL-211ENST00000638817 CUX2O14529 1486 aa39.45■■■■□ 3.91
PARL-211ENST00000638817 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.4■■■■□ 3.9
PARL-211ENST00000638817 NESP48681 1621 aa39.3■■■■□ 3.88
PARL-211ENST00000638817 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.24■■■■□ 3.87
PARL-211ENST00000638817 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.13■■■■□ 3.86
PARL-211ENST00000638817 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.96■■■■□ 3.83
PARL-211ENST00000638817 WIZO95785 1651 aa38.94■■■■□ 3.82
PARL-211ENST00000638817 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.87■■■■□ 3.81
PARL-211ENST00000638817 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.85■■■■□ 3.81
PARL-211ENST00000638817 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.79■■■■□ 3.8
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PARL-211ENST00000638817 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.53■■■■□ 3.76
PARL-211ENST00000638817 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.48■■■■□ 3.75
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PARL-211ENST00000638817 CFTRP13569 1480 aa38.39■■■■□ 3.74
PARL-211ENST00000638817 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.38■■■■□ 3.73
PARL-211ENST00000638817 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.34■■■■□ 3.73
PARL-211ENST00000638817 PRDM2Q13029 1718 aa38.08■■■■□ 3.69
PARL-211ENST00000638817 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.02■■■■□ 3.68
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PARL-211ENST00000638817 TOPBP1Q92547 1522 aa37.64■■■■□ 3.62
PARL-211ENST00000638817 IFT140Q96RY7 1462 aa37.63■■■■□ 3.61
PARL-211ENST00000638817 ABCC8Q09428 1581 aa37.61■■■■□ 3.61
PARL-211ENST00000638817 OSCARQ8IYS5 282 aa37.59■■■■□ 3.61
PARL-211ENST00000638817 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.54■■■■□ 3.6
PARL-211ENST00000638817 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.51■■■■□ 3.6
PARL-211ENST00000638817 TRIM41Q8WV44 630 aa37.48■■■■□ 3.59
PARL-211ENST00000638817 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.35■■■■□ 3.57
PARL-211ENST00000638817 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.32■■■■□ 3.56
PARL-211ENST00000638817 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.26■■■■□ 3.55
PARL-211ENST00000638817 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.18■■■■□ 3.54
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PARL-211ENST00000638817 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.12■■■■□ 3.53
PARL-211ENST00000638817 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.12■■■■□ 3.53
PARL-211ENST00000638817 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.08■■■■□ 3.53
PARL-211ENST00000638817 SOGA1O94964 1423 aa37.07■■■■□ 3.53
PARL-211ENST00000638817 CHD1O14646 1710 aa37.06■■■■□ 3.52
PARL-211ENST00000638817 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.03■■■■□ 3.52
PARL-211ENST00000638817 CUX1P39880 1505 aa37.02■■■■□ 3.52
PARL-211ENST00000638817 WDR97A6NE52 1622 aa37.02■■■■□ 3.52
PARL-211ENST00000638817 ARHGEF11O15085 1522 aa37.01■■■■□ 3.52
PARL-211ENST00000638817 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.95■■■■□ 3.51
PARL-211ENST00000638817 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.88■■■■□ 3.49
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PARL-211ENST00000638817 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.82■■■■□ 3.49
PARL-211ENST00000638817 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.77■■■■□ 3.48
PARL-211ENST00000638817 GRIN2BQ13224 1484 aa36.76■■■■□ 3.48
PARL-211ENST00000638817 PBRM1Q86U86 1689 aa36.66■■■■□ 3.46
PARL-211ENST00000638817 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.66■■■■□ 3.46
PARL-211ENST00000638817 ARAP1Q96P48 1450 aa36.66■■■■□ 3.46
PARL-211ENST00000638817 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.65■■■■□ 3.46
PARL-211ENST00000638817 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.65■■■■□ 3.46
PARL-211ENST00000638817 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.64■■■■□ 3.46
PARL-211ENST00000638817 SYNJ1O43426 1573 aa36.64■■■■□ 3.46
PARL-211ENST00000638817 SYNJ2O15056 1496 aa36.63■■■■□ 3.45
PARL-211ENST00000638817 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.63■■■■□ 3.45
PARL-211ENST00000638817 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.59■■■■□ 3.45
PARL-211ENST00000638817 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.51■■■■□ 3.43
PARL-211ENST00000638817 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.49■■■■□ 3.43
PARL-211ENST00000638817 TOP2BQ02880 1626 aa36.49■■■■□ 3.43
PARL-211ENST00000638817 ADAMTS12P58397 1594 aa36.3■■■■□ 3.4
PARL-211ENST00000638817 GRIN2AQ12879 1464 aa36.29■■■■□ 3.4
PARL-211ENST00000638817 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.21■■■■□ 3.39
PARL-211ENST00000638817 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.2■■■■□ 3.39
PARL-211ENST00000638817 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.19■■■■□ 3.38
PARL-211ENST00000638817 NUP160Q12769 1436 aa36.18■■■■□ 3.38
PARL-211ENST00000638817 CEP170Q5SW79 1584 aa36.16■■■■□ 3.38
PARL-211ENST00000638817 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.03■■■■□ 3.36
PARL-211ENST00000638817 SHROOM2Q13796 1616 aa36.03■■■■□ 3.36
PARL-211ENST00000638817 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.79■■■■□ 3.32
PARL-211ENST00000638817 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.78■■■■□ 3.32
PARL-211ENST00000638817 JPH4Q96JJ6 628 aa35.76■■■■□ 3.31
PARL-211ENST00000638817 KIF27Q86VH2 1401 aa35.74■■■■□ 3.31
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