RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421484.5

PARL-205, Transcript of presenilin associated rhomboid like, humanhuman

TSL 5

Gene PARL, Length 1,347 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARL-205ENST00000421484 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.85■■■■■ 7.33
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PARL-205ENST00000421484 ABCC9O60706 1549 aa52.83■■■■■ 6.05
PARL-205ENST00000421484 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.01■■■■■ 5.76
PARL-205ENST00000421484 NACADO15069 1562 aa50.96■■■■■ 5.75
PARL-205ENST00000421484 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.82■■■■■ 5.73
PARL-205ENST00000421484 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.7■■■■■ 5.71
PARL-205ENST00000421484 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.7■■■■■ 5.71
PARL-205ENST00000421484 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.45■■■■■ 5.67
PARL-205ENST00000421484 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.68■■■■■ 5.54
PARL-205ENST00000421484 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.33■■■■■ 5.49
PARL-205ENST00000421484 SCRIBQ14160 1630 aa49.31■■■■■ 5.48
PARL-205ENST00000421484 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.27■■■■■ 5.48
PARL-205ENST00000421484 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.05■■■■■ 5.44
PARL-205ENST00000421484 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.63■■■■■ 5.38
PARL-205ENST00000421484 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.06■■■■■ 5.28
PARL-205ENST00000421484 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.84■■■■■ 5.25
PARL-205ENST00000421484 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.55■■■■■ 5.2
PARL-205ENST00000421484 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.25■■■■■ 5.15
PARL-205ENST00000421484 SMARCA4P51532 1647 aa47.22■■■■■ 5.15
PARL-205ENST00000421484 SMARCA2P51531 1590 aa47■■■■■ 5.12
PARL-205ENST00000421484 NCAPD3P42695 1498 aa46.96■■■■■ 5.11
PARL-205ENST00000421484 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.94■■■■■ 5.1
PARL-205ENST00000421484 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.81■■■■■ 5.08
PARL-205ENST00000421484 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.8■■■■■ 5.08
PARL-205ENST00000421484 HMGXB3Q12766 1538 aa46.77■■■■■ 5.08
PARL-205ENST00000421484 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.62■■■■■ 5.05
PARL-205ENST00000421484 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.32■■■■■ 5.01
PARL-205ENST00000421484 WIZO95785 1651 aa46.31■■■■■ 5
PARL-205ENST00000421484 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.93■■■■■ 4.94
PARL-205ENST00000421484 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.77■■■■■ 4.92
PARL-205ENST00000421484 ERCC6Q03468 1493 aa45.68■■■■■ 4.9
PARL-205ENST00000421484 NESP48681 1621 aa45.66■■■■■ 4.9
PARL-205ENST00000421484 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.6■■■■■ 4.89
PARL-205ENST00000421484 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.49■■■■■ 4.87
PARL-205ENST00000421484 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.32■■■■■ 4.84
PARL-205ENST00000421484 CFTRP13569 1480 aa45.32■■■■■ 4.84
PARL-205ENST00000421484 CUX2O14529 1486 aa45.22■■■■■ 4.83
PARL-205ENST00000421484 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.21■■■■■ 4.83
PARL-205ENST00000421484 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.16■■■■■ 4.82
PARL-205ENST00000421484 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.06■■■■■ 4.8
PARL-205ENST00000421484 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.05■■■■■ 4.8
PARL-205ENST00000421484 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.04■■■■■ 4.8
PARL-205ENST00000421484 PRDM2Q13029 1718 aa45.04■■■■■ 4.8
PARL-205ENST00000421484 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.96■■■■■ 4.79
PARL-205ENST00000421484 WDR62O43379 1518 aa44.79■■■■■ 4.76
PARL-205ENST00000421484 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.66■■■■■ 4.74
PARL-205ENST00000421484 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.52■■■■■ 4.72
PARL-205ENST00000421484 ABCC8Q09428 1581 aa44.5■■■■■ 4.71
PARL-205ENST00000421484 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.32■■■■■ 4.68
PARL-205ENST00000421484 TOPBP1Q92547 1522 aa44.31■■■■■ 4.68
PARL-205ENST00000421484 IFT140Q96RY7 1462 aa44.11■■■■■ 4.65
PARL-205ENST00000421484 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.94■■■■■ 4.62
PARL-205ENST00000421484 CUX1P39880 1505 aa43.93■■■■■ 4.62
PARL-205ENST00000421484 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.83■■■■■ 4.61
PARL-205ENST00000421484 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.81■■■■■ 4.6
PARL-205ENST00000421484 SOGA1O94964 1423 aa43.79■■■■■ 4.6
PARL-205ENST00000421484 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.75■■■■■ 4.59
PARL-205ENST00000421484 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.73■■■■■ 4.59
PARL-205ENST00000421484 WDR97A6NE52 1622 aa43.67■■■■■ 4.58
PARL-205ENST00000421484 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.67■■■■■ 4.58
PARL-205ENST00000421484 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.66■■■■■ 4.58
PARL-205ENST00000421484 TOP2BQ02880 1626 aa43.65■■■■■ 4.58
PARL-205ENST00000421484 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.64■■■■■ 4.58
PARL-205ENST00000421484 SYNJ1O43426 1573 aa43.54■■■■■ 4.56
PARL-205ENST00000421484 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.53■■■■■ 4.56
PARL-205ENST00000421484 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.46■■■■■ 4.55
PARL-205ENST00000421484 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.46■■■■■ 4.55
PARL-205ENST00000421484 OSCARQ8IYS5 282 aa43.33■■■■■ 4.53
PARL-205ENST00000421484 GRIN2BQ13224 1484 aa43.32■■■■■ 4.53
PARL-205ENST00000421484 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.29■■■■■ 4.52
PARL-205ENST00000421484 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.25■■■■■ 4.51
PARL-205ENST00000421484 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.23■■■■■ 4.51
PARL-205ENST00000421484 PBRM1Q86U86 1689 aa43.19■■■■■ 4.5
PARL-205ENST00000421484 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.18■■■■■ 4.5
PARL-205ENST00000421484 CHD1O14646 1710 aa43.09■■■■■ 4.49
PARL-205ENST00000421484 FBLN2P98095 1184 aa43.08■■■■■ 4.49
PARL-205ENST00000421484 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.03■■■■■ 4.48
PARL-205ENST00000421484 SYNJ2O15056 1496 aa43.03■■■■■ 4.48
PARL-205ENST00000421484 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.99■■■■■ 4.47
PARL-205ENST00000421484 KIF27Q86VH2 1401 aa42.9■■■■■ 4.46
PARL-205ENST00000421484 ADAMTS12P58397 1594 aa42.84■■■■■ 4.45
PARL-205ENST00000421484 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.83■■■■■ 4.45
PARL-205ENST00000421484 TRIM41Q8WV44 630 aa42.76■■■■■ 4.44
PARL-205ENST00000421484 GRIN2AQ12879 1464 aa42.72■■■■■ 4.43
PARL-205ENST00000421484 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.63■■■■■ 4.42
PARL-205ENST00000421484 CUL7Q14999 1698 aa42.62■■■■■ 4.41
PARL-205ENST00000421484 IGF1RP08069 1367 aa42.6■■■■■ 4.41
PARL-205ENST00000421484 ARHGEF11O15085 1522 aa42.54■■■■■ 4.4
PARL-205ENST00000421484 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.53■■■■■ 4.4
PARL-205ENST00000421484 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.53■■■■■ 4.4
PARL-205ENST00000421484 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.53■■■■■ 4.4
PARL-205ENST00000421484 NUP160Q12769 1436 aa42.52■■■■■ 4.4
PARL-205ENST00000421484 CEP170Q5SW79 1584 aa42.44■■■■■ 4.38
PARL-205ENST00000421484 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.41■■■■■ 4.38
PARL-205ENST00000421484 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.26■■■■■ 4.36
PARL-205ENST00000421484 SHROOM2Q13796 1616 aa42.2■■■■■ 4.35
PARL-205ENST00000421484 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.19■■■■■ 4.34
PARL-205ENST00000421484 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.16■■■■■ 4.34
PARL-205ENST00000421484 EEA1Q15075 1411 aa42.16■■■■■ 4.34
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