RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639900.1

PARL-213, Transcript of presenilin associated rhomboid like, humanhuman

TSL 5

Gene PARL, Length 1,545 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARL-213ENST00000639900 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.35■■■■■ 6.93
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PARL-213ENST00000639900 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.15■■■■■ 5.46
PARL-213ENST00000639900 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.1■■■■■ 5.45
PARL-213ENST00000639900 NACADO15069 1562 aa48.99■■■■■ 5.43
PARL-213ENST00000639900 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.53■■■■■ 5.36
PARL-213ENST00000639900 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.51■■■■■ 5.36
PARL-213ENST00000639900 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.2■■■■■ 5.31
PARL-213ENST00000639900 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.98■■■■■ 5.27
PARL-213ENST00000639900 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.93■■■■■ 5.26
PARL-213ENST00000639900 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.63■■■■■ 5.21
PARL-213ENST00000639900 SCRIBQ14160 1630 aa47.5■■■■■ 5.19
PARL-213ENST00000639900 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.38■■■■■ 5.18
PARL-213ENST00000639900 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.08■■■■■ 5.13
PARL-213ENST00000639900 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.44■■■■■ 5.02
PARL-213ENST00000639900 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.35■■■■■ 5.01
PARL-213ENST00000639900 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.12■■■■■ 4.97
PARL-213ENST00000639900 SMARCA4P51532 1647 aa45.35■■■■■ 4.85
PARL-213ENST00000639900 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.26■■■■■ 4.84
PARL-213ENST00000639900 NCAPD3P42695 1498 aa45.2■■■■■ 4.83
PARL-213ENST00000639900 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.2■■■■■ 4.83
PARL-213ENST00000639900 SMARCA2P51531 1590 aa45.13■■■■■ 4.82
PARL-213ENST00000639900 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.98■■■■■ 4.79
PARL-213ENST00000639900 HMGXB3Q12766 1538 aa44.94■■■■■ 4.78
PARL-213ENST00000639900 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.86■■■■■ 4.77
PARL-213ENST00000639900 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.85■■■■■ 4.77
PARL-213ENST00000639900 WIZO95785 1651 aa44.49■■■■■ 4.71
PARL-213ENST00000639900 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.35■■■■■ 4.69
PARL-213ENST00000639900 ERCC6Q03468 1493 aa44.28■■■■■ 4.68
PARL-213ENST00000639900 NESP48681 1621 aa44.28■■■■■ 4.68
PARL-213ENST00000639900 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.07■■■■■ 4.65
PARL-213ENST00000639900 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.97■■■■■ 4.63
PARL-213ENST00000639900 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.91■■■■■ 4.62
PARL-213ENST00000639900 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.84■■■■■ 4.61
PARL-213ENST00000639900 CUX2O14529 1486 aa43.84■■■■■ 4.61
PARL-213ENST00000639900 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.71■■■■■ 4.59
PARL-213ENST00000639900 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.61■■■■■ 4.57
PARL-213ENST00000639900 CFTRP13569 1480 aa43.55■■■■■ 4.56
PARL-213ENST00000639900 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.49■■■■■ 4.55
PARL-213ENST00000639900 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.42■■■■■ 4.54
PARL-213ENST00000639900 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.4■■■■■ 4.54
PARL-213ENST00000639900 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.39■■■■■ 4.54
PARL-213ENST00000639900 WDR62O43379 1518 aa43.23■■■■■ 4.51
PARL-213ENST00000639900 PRDM2Q13029 1718 aa43.15■■■■■ 4.5
PARL-213ENST00000639900 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.12■■■■■ 4.49
PARL-213ENST00000639900 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.98■■■■■ 4.47
PARL-213ENST00000639900 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.94■■■■■ 4.46
PARL-213ENST00000639900 TOPBP1Q92547 1522 aa42.67■■■■■ 4.42
PARL-213ENST00000639900 ABCC8Q09428 1581 aa42.64■■■■■ 4.42
PARL-213ENST00000639900 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.58■■■■■ 4.41
PARL-213ENST00000639900 IFT140Q96RY7 1462 aa42.49■■■■■ 4.39
PARL-213ENST00000639900 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.34■■■■■ 4.37
PARL-213ENST00000639900 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.29■■■■■ 4.36
PARL-213ENST00000639900 CUX1P39880 1505 aa42.22■■■■■ 4.35
PARL-213ENST00000639900 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.19■■■■■ 4.34
PARL-213ENST00000639900 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.15■■■■■ 4.34
PARL-213ENST00000639900 SOGA1O94964 1423 aa42.15■■■■■ 4.34
PARL-213ENST00000639900 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.14■■■■■ 4.34
PARL-213ENST00000639900 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.13■■■■■ 4.34
PARL-213ENST00000639900 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.08■■■■■ 4.33
PARL-213ENST00000639900 OSCARQ8IYS5 282 aa42.05■■■■■ 4.32
PARL-213ENST00000639900 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.97■■■■■ 4.31
PARL-213ENST00000639900 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.86■■■■■ 4.29
PARL-213ENST00000639900 WDR97A6NE52 1622 aa41.81■■■■■ 4.28
PARL-213ENST00000639900 TOP2BQ02880 1626 aa41.75■■■■■ 4.27
PARL-213ENST00000639900 FBLN2P98095 1184 aa41.74■■■■■ 4.27
PARL-213ENST00000639900 SYNJ1O43426 1573 aa41.74■■■■■ 4.27
PARL-213ENST00000639900 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.73■■■■■ 4.27
PARL-213ENST00000639900 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.7■■■■■ 4.27
PARL-213ENST00000639900 GRIN2BQ13224 1484 aa41.67■■■■■ 4.26
PARL-213ENST00000639900 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.67■■■■■ 4.26
PARL-213ENST00000639900 CHD1O14646 1710 aa41.67■■■■■ 4.26
PARL-213ENST00000639900 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.64■■■■■ 4.26
PARL-213ENST00000639900 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.58■■■■■ 4.25
PARL-213ENST00000639900 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.54■■■■■ 4.24
PARL-213ENST00000639900 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.54■■■■■ 4.24
PARL-213ENST00000639900 PBRM1Q86U86 1689 aa41.53■■■■■ 4.24
PARL-213ENST00000639900 TRIM41Q8WV44 630 aa41.49■■■■■ 4.23
PARL-213ENST00000639900 SYNJ2O15056 1496 aa41.43■■■■■ 4.22
PARL-213ENST00000639900 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.35■■■■■ 4.21
PARL-213ENST00000639900 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.35■■■■■ 4.21
PARL-213ENST00000639900 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.35■■■■■ 4.21
PARL-213ENST00000639900 ARHGEF11O15085 1522 aa41.31■■■■■ 4.2
PARL-213ENST00000639900 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.19■■■■■ 4.18
PARL-213ENST00000639900 ADAMTS12P58397 1594 aa41.18■■■■■ 4.18
PARL-213ENST00000639900 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.18■■■■■ 4.18
PARL-213ENST00000639900 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.14■■■■■ 4.18
PARL-213ENST00000639900 GRIN2AQ12879 1464 aa41.12■■■■■ 4.17
PARL-213ENST00000639900 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.04■■■■■ 4.16
PARL-213ENST00000639900 KIF27Q86VH2 1401 aa41.02■■■■■ 4.16
PARL-213ENST00000639900 ARAP1Q96P48 1450 aa40.96■■■■■ 4.15
PARL-213ENST00000639900 NUP160Q12769 1436 aa40.93■■■■■ 4.14
PARL-213ENST00000639900 CEP170Q5SW79 1584 aa40.92■■■■■ 4.14
PARL-213ENST00000639900 IGF1RP08069 1367 aa40.87■■■■■ 4.13
PARL-213ENST00000639900 CUL7Q14999 1698 aa40.76■■■■■ 4.11
PARL-213ENST00000639900 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.65■■■■■ 4.1
PARL-213ENST00000639900 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.63■■■■■ 4.09
PARL-213ENST00000639900 SHROOM2Q13796 1616 aa40.63■■■■■ 4.09
PARL-213ENST00000639900 JPH4Q96JJ6 628 aa40.59■■■■■ 4.09
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