Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 DNAJC7-210ENST00000588641 782 ntTSL 36.41□□□□□ -1.384e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.414e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 MRPS28-203ENST00000518371 783 ntTSL 36.04□□□□□ -1.444e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 DHX15-206ENST00000510645 470 ntTSL 55.98□□□□□ -1.454e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 DLEU1-221ENST00000479420 612 ntTSL 55.83□□□□□ -1.484e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 PUM1-220ENST00000529846 683 ntTSL 35.27□□□□□ -1.574e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 PUM1-216ENST00000525997 650 ntTSL 35.18□□□□□ -1.584e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 DHX15-205ENST00000508368 415 ntTSL 24.63□□□□□ -1.674e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 DHX15-208ENST00000512903 2071 ntTSL 23.96□□□□□ -1.784e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 DHX15-204ENST00000508032 3028 ntTSL 1 (best)3.6□□□□□ -1.834e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 PUM1-219ENST00000527498 652 ntTSL 33.52□□□□□ -1.854e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 TMEM230-203ENST00000379276 306 ntTSL 33□□□□□ -1.934e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 CCNB1IP1-211ENST00000555348 505 ntTSL 42.71□□□□□ -1.984e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 CCNB1IP1-207ENST00000553291 392 ntTSL 31.94□□□□□ -2.14e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.479e-9■■□□□ 12
ILF3Q12906 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.079e-9■■□□□ 12
ILF3Q12906 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.069e-9■■□□□ 12
ILF3Q12906 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.329e-9■■□□□ 12
ILF3Q12906 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.032e-15■■□□□ 12
ILF3Q12906 MAP2K5-212ENST00000560591 1457 ntTSL 35.36□□□□□ -1.552e-15■■□□□ 12
ILF3Q12906 MTHFD2-202ENST00000409601 1865 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.474e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 MTHFD2-204ENST00000462026 599 ntTSL 511.17□□□□□ -0.624e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 MTHFD2-201ENST00000394053 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.734e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 NUP54-203ENST00000504173 314 ntTSL 39.87□□□□□ -0.834e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 MTHFD2-203ENST00000409804 1757 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -14e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 MTHFD2-205ENST00000470592 1396 ntTSL 28.35□□□□□ -1.074e-6■■□□□ 12
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ILF3Q12906 MTHFD2-206ENST00000477455 696 ntTSL 37.37□□□□□ -1.234e-6■■□□□ 12
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ILF3Q12906 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.178e-9■■□□□ 12
ILF3Q12906 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.268e-9■■□□□ 12
ILF3Q12906 PPIL2-201ENST00000335025 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.548e-9■■□□□ 12
ILF3Q12906 PPIL2-204ENST00000417788 4213 ntTSL 29.72□□□□□ -0.858e-9■■□□□ 12
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ILF3Q12906 STAT5B-203ENST00000468312 1799 ntTSL 1 (best)22.23■■□□□ 1.152e-6■■□□□ 12
ILF3Q12906 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.383e-9■■□□□ 12
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ILF3Q12906 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.582e-6■■□□□ 12
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ILF3Q12906 SNHG16-201ENST00000448136 3607 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.967e-7■■□□□ 11.9
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ILF3Q12906 SNHG16-206ENST00000587838 884 ntTSL 35□□□□□ -1.617e-7■■□□□ 11.9
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ILF3Q12906 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.021e-22■■□□□ 11.9
ILF3Q12906 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.281e-22■■□□□ 11.9
ILF3Q12906 GABPB1-AS1-203ENST00000558593 507 ntTSL 56.29□□□□□ -1.43e-7■■□□□ 11.9
ILF3Q12906 CERK-202ENST00000443629 1760 ntTSL 1 (best)21.39■■□□□ 1.018e-8■■□□□ 11.9
ILF3Q12906 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.078e-8■■□□□ 11.9
ILF3Q12906 ZFR-201ENST00000265069 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.331e-7■■□□□ 11.9
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ILF3Q12906 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.064e-7■■□□□ 11.9
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ILF3Q12906 SEPT9-213ENST00000586433 569 ntTSL 412.13□□□□□ -0.474e-7■■□□□ 11.9
ILF3Q12906 SEPT9-238ENST00000591472 555 ntTSL 411.82□□□□□ -0.524e-7■■□□□ 11.9
ILF3Q12906 SEPT9-239ENST00000591704 749 ntTSL 211.68□□□□□ -0.544e-7■■□□□ 11.9
ILF3Q12906 SEPT9-235ENST00000591020 582 ntTSL 410.99□□□□□ -0.654e-7■■□□□ 11.9
ILF3Q12906 SEPT9-234ENST00000590938 611 ntTSL 410.16□□□□□ -0.784e-7■■□□□ 11.9
ILF3Q12906 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.072e-11■■□□□ 11.9
ILF3Q12906 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.832e-11■■□□□ 11.9
ILF3Q12906 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.422e-11■■□□□ 11.9
ILF3Q12906 SSBP4-203ENST00000593641 900 ntTSL 522.67■■□□□ 1.222e-11■■□□□ 11.9
ILF3Q12906 ST3GAL2-203ENST00000561708 581 ntTSL 417.07■□□□□ 0.324e-7■■□□□ 11.9
ILF3Q12906 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.224e-7■■□□□ 11.9
ILF3Q12906 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.352e-7■■□□□ 11.9
ILF3Q12906 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.162e-7■■□□□ 11.9
ILF3Q12906 AC004980.1-202ENST00000450661 962 ntTSL 1 (best)23.84■■□□□ 1.416e-7■■□□□ 11.9
ILF3Q12906 AC004980.1-203ENST00000423084 748 ntTSL 322.76■■□□□ 1.236e-7■■□□□ 11.9
ILF3Q12906 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.796e-7■■□□□ 11.9
ILF3Q12906 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.472e-9■■□□□ 11.9
ILF3Q12906 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.572e-9■■□□□ 11.9
ILF3Q12906 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.632e-9■■□□□ 11.9
ILF3Q12906 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.632e-9■■□□□ 11.9
ILF3Q12906 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.72e-9■■□□□ 11.9
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