RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443629.5

CERK-202, Transcript of ceramide kinase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CERK, Length 1,760 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERK-202ENST00000443629 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.85■■■■■ 5.89
CERK-202ENST00000443629 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.8■■■■■ 4.92
CERK-202ENST00000443629 ABCC9O60706 1549 aa44.33■■■■■ 4.69
CERK-202ENST00000443629 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.31■■■■■ 4.52
CERK-202ENST00000443629 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.13■■■■■ 4.49
CERK-202ENST00000443629 NACADO15069 1562 aa42.91■■■■■ 4.46
CERK-202ENST00000443629 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.88■■■■■ 4.45
CERK-202ENST00000443629 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.83■■■■■ 4.45
CERK-202ENST00000443629 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.83■■■■■ 4.45
CERK-202ENST00000443629 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.97■■■■■ 4.31
CERK-202ENST00000443629 SCRIBQ14160 1630 aa41.9■■■■■ 4.3
CERK-202ENST00000443629 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.59■■■■■ 4.25
CERK-202ENST00000443629 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.54■■■■■ 4.24
CERK-202ENST00000443629 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.38■■■■■ 4.22
CERK-202ENST00000443629 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.41■■■■■ 4.06
CERK-202ENST00000443629 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.38■■■■■ 4.06
CERK-202ENST00000443629 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.2■■■■■ 4.03
CERK-202ENST00000443629 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.12■■■■■ 4.01
CERK-202ENST00000443629 SMARCA4P51532 1647 aa40.12■■■■■ 4.01
CERK-202ENST00000443629 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.11■■■■■ 4.01
CERK-202ENST00000443629 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.01■■■■■ 4
CERK-202ENST00000443629 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.74■■■■□ 3.95
CERK-202ENST00000443629 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.74■■■■□ 3.95
CERK-202ENST00000443629 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.69■■■■□ 3.94
CERK-202ENST00000443629 SMARCA2P51531 1590 aa39.69■■■■□ 3.94
CERK-202ENST00000443629 WIZO95785 1651 aa39.63■■■■□ 3.93
CERK-202ENST00000443629 NCAPD3P42695 1498 aa39.61■■■■□ 3.93
CERK-202ENST00000443629 HMGXB3Q12766 1538 aa39.46■■■■□ 3.91
CERK-202ENST00000443629 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.43■■■■□ 3.9
CERK-202ENST00000443629 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.21■■■■□ 3.87
CERK-202ENST00000443629 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.17■■■■□ 3.86
CERK-202ENST00000443629 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.74■■■■□ 3.79
CERK-202ENST00000443629 NESP48681 1621 aa38.56■■■■□ 3.76
CERK-202ENST00000443629 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.5■■■■□ 3.75
CERK-202ENST00000443629 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.47■■■■□ 3.75
CERK-202ENST00000443629 CFTRP13569 1480 aa38.4■■■■□ 3.74
CERK-202ENST00000443629 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.17■■■■□ 3.7
CERK-202ENST00000443629 PRDM2Q13029 1718 aa38.17■■■■□ 3.7
CERK-202ENST00000443629 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.12■■■■□ 3.69
CERK-202ENST00000443629 ERCC6Q03468 1493 aa38.11■■■■□ 3.69
CERK-202ENST00000443629 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.06■■■■□ 3.68
CERK-202ENST00000443629 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.94■■■■□ 3.66
CERK-202ENST00000443629 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.81■■■■□ 3.64
CERK-202ENST00000443629 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.76■■■■□ 3.64
CERK-202ENST00000443629 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.67■■■■□ 3.62
CERK-202ENST00000443629 WDR62O43379 1518 aa37.63■■■■□ 3.61
CERK-202ENST00000443629 ABCC8Q09428 1581 aa37.55■■■■□ 3.6
CERK-202ENST00000443629 TOPBP1Q92547 1522 aa37.53■■■■□ 3.6
CERK-202ENST00000443629 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.52■■■■□ 3.6
CERK-202ENST00000443629 CUX1P39880 1505 aa37.49■■■■□ 3.59
CERK-202ENST00000443629 CUX2O14529 1486 aa37.47■■■■□ 3.59
CERK-202ENST00000443629 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.43■■■■□ 3.58
CERK-202ENST00000443629 SYNJ1O43426 1573 aa37.35■■■■□ 3.57
CERK-202ENST00000443629 TOP2BQ02880 1626 aa37.3■■■■□ 3.56
CERK-202ENST00000443629 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.29■■■■□ 3.56
CERK-202ENST00000443629 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.26■■■■□ 3.56
CERK-202ENST00000443629 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.25■■■■□ 3.55
CERK-202ENST00000443629 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.12■■■■□ 3.53
CERK-202ENST00000443629 IFT140Q96RY7 1462 aa37.11■■■■□ 3.53
CERK-202ENST00000443629 SOGA1O94964 1423 aa37.1■■■■□ 3.53
CERK-202ENST00000443629 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.1■■■■□ 3.53
CERK-202ENST00000443629 TRIM41Q8WV44 630 aa36.96■■■■□ 3.51
CERK-202ENST00000443629 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.96■■■■□ 3.51
CERK-202ENST00000443629 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.94■■■■□ 3.5
CERK-202ENST00000443629 WDR97A6NE52 1622 aa36.93■■■■□ 3.5
CERK-202ENST00000443629 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.9■■■■□ 3.5
CERK-202ENST00000443629 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.85■■■■□ 3.49
CERK-202ENST00000443629 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.83■■■■□ 3.49
CERK-202ENST00000443629 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.83■■■■□ 3.49
CERK-202ENST00000443629 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.72■■■■□ 3.47
CERK-202ENST00000443629 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.68■■■■□ 3.46
CERK-202ENST00000443629 PBRM1Q86U86 1689 aa36.6■■■■□ 3.45
CERK-202ENST00000443629 KIF27Q86VH2 1401 aa36.58■■■■□ 3.45
CERK-202ENST00000443629 GRIN2BQ13224 1484 aa36.58■■■■□ 3.45
CERK-202ENST00000443629 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.54■■■■□ 3.44
CERK-202ENST00000443629 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.48■■■■□ 3.43
CERK-202ENST00000443629 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.46■■■■□ 3.43
CERK-202ENST00000443629 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.41■■■■□ 3.42
CERK-202ENST00000443629 IGF1RP08069 1367 aa36.4■■■■□ 3.42
CERK-202ENST00000443629 ADAMTS12P58397 1594 aa36.31■■■■□ 3.4
CERK-202ENST00000443629 SYNJ2O15056 1496 aa36.27■■■■□ 3.4
CERK-202ENST00000443629 CHD1O14646 1710 aa36.27■■■■□ 3.4
CERK-202ENST00000443629 FBLN2P98095 1184 aa36.26■■■■□ 3.4
CERK-202ENST00000443629 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.25■■■■□ 3.39
CERK-202ENST00000443629 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.25■■■■□ 3.39
CERK-202ENST00000443629 EEA1Q15075 1411 aa36.24■■■■□ 3.39
CERK-202ENST00000443629 CUL7Q14999 1698 aa36.23■■■■□ 3.39
CERK-202ENST00000443629 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.22■■■■□ 3.39
CERK-202ENST00000443629 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.19■■■■□ 3.38
CERK-202ENST00000443629 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.17■■■■□ 3.38
CERK-202ENST00000443629 GRIN2AQ12879 1464 aa36.13■■■■□ 3.37
CERK-202ENST00000443629 PRXQ9BXM0 1461 aa36.06■■■■□ 3.36
CERK-202ENST00000443629 OSCARQ8IYS5 282 aa36.05■■■■□ 3.36
CERK-202ENST00000443629 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.03■■■■□ 3.36
CERK-202ENST00000443629 CEP170Q5SW79 1584 aa35.95■■■■□ 3.35
CERK-202ENST00000443629 NUP160Q12769 1436 aa35.94■■■■□ 3.34
CERK-202ENST00000443629 KIF21BO75037 1637 aa35.87■■■■□ 3.33
CERK-202ENST00000443629 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.85■■■■□ 3.33
CERK-202ENST00000443629 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.76■■■■□ 3.32
CERK-202ENST00000443629 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa35.73■■■■□ 3.31
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