Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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