RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627394.2

WWOX-218, Transcript of WW domain containing oxidoreductase, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene WWOX, Length 894 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WWOX-218ENST00000627394 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.3■■■■■ 5.96
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WWOX-218ENST00000627394 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.2■■■■■ 4.67
WWOX-218ENST00000627394 NACADO15069 1562 aa44.04■■■■■ 4.64
WWOX-218ENST00000627394 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.67■■■■■ 4.58
WWOX-218ENST00000627394 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.66■■■■■ 4.58
WWOX-218ENST00000627394 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.51■■■■■ 4.56
WWOX-218ENST00000627394 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.3■■■■■ 4.52
WWOX-218ENST00000627394 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.28■■■■■ 4.52
WWOX-218ENST00000627394 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.92■■■■■ 4.46
WWOX-218ENST00000627394 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.91■■■■■ 4.46
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WWOX-218ENST00000627394 SCRIBQ14160 1630 aa42.57■■■■■ 4.41
WWOX-218ENST00000627394 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.45■■■■■ 4.39
WWOX-218ENST00000627394 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.8■■■■■ 4.28
WWOX-218ENST00000627394 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.73■■■■■ 4.27
WWOX-218ENST00000627394 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.48■■■■■ 4.23
WWOX-218ENST00000627394 SMARCA4P51532 1647 aa40.71■■■■■ 4.11
WWOX-218ENST00000627394 NCAPD3P42695 1498 aa40.62■■■■■ 4.09
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WWOX-218ENST00000627394 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.57■■■■■ 4.08
WWOX-218ENST00000627394 SMARCA2P51531 1590 aa40.52■■■■■ 4.08
WWOX-218ENST00000627394 HMGXB3Q12766 1538 aa40.43■■■■■ 4.06
WWOX-218ENST00000627394 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.35■■■■■ 4.05
WWOX-218ENST00000627394 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.29■■■■■ 4.04
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WWOX-218ENST00000627394 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.33■■■■□ 3.89
WWOX-218ENST00000627394 CFTRP13569 1480 aa39.09■■■■□ 3.85
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WWOX-218ENST00000627394 WDR62O43379 1518 aa38.94■■■■□ 3.82
WWOX-218ENST00000627394 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.94■■■■□ 3.82
WWOX-218ENST00000627394 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.89■■■■□ 3.82
WWOX-218ENST00000627394 PRDM2Q13029 1718 aa38.86■■■■□ 3.81
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WWOX-218ENST00000627394 ABCC8Q09428 1581 aa38.24■■■■□ 3.71
WWOX-218ENST00000627394 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.23■■■■□ 3.71
WWOX-218ENST00000627394 IFT140Q96RY7 1462 aa38.15■■■■□ 3.7
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WWOX-218ENST00000627394 WDR97A6NE52 1622 aa37.65■■■■□ 3.62
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WWOX-218ENST00000627394 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.4■■■■□ 3.58
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WWOX-218ENST00000627394 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.37■■■■□ 3.57
WWOX-218ENST00000627394 GRIN2BQ13224 1484 aa37.36■■■■□ 3.57
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WWOX-218ENST00000627394 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.3■■■■□ 3.56
WWOX-218ENST00000627394 TRIM41Q8WV44 630 aa37.26■■■■□ 3.56
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WWOX-218ENST00000627394 ADAMTS12P58397 1594 aa37■■■■□ 3.51
WWOX-218ENST00000627394 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.95■■■■□ 3.5
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WWOX-218ENST00000627394 ARAP1Q96P48 1450 aa36.9■■■■□ 3.5
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WWOX-218ENST00000627394 SHROOM2Q13796 1616 aa36.6■■■■□ 3.45
WWOX-218ENST00000627394 CUL7Q14999 1698 aa36.54■■■■□ 3.44
WWOX-218ENST00000627394 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.53■■■■□ 3.44
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WWOX-218ENST00000627394 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.3■■■■□ 3.4
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