Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 PDXK-211ENST00000468392 1094 ntTSL 219.23■□□□□ 0.672e-8■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 PDXK-203ENST00000343528 1101 ntTSL 1 (best)17.25■□□□□ 0.352e-8■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 HNRNPR-213ENST00000641107 646 nt17.28■□□□□ 0.369e-7■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 HNRNPR-210ENST00000478691 7646 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.129e-7■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.079e-8■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 UBA52-212ENST00000599256 927 ntTSL 228.37■■■□□ 2.139e-36■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 UBA52-211ENST00000598814 550 ntTSL 1 (best)19.31■□□□□ 0.689e-36■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.273e-31■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 PCNA-201ENST00000379143 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.163e-31■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 UBE2J2-210ENST00000464036 1256 ntTSL 328.08■■■□□ 2.096e-7■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.076e-7■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 UBE2J2-208ENST00000450390 2455 ntTSL 524.24■■□□□ 1.476e-7■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.336e-7■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.36e-7■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.286e-7■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 DAPK3-205ENST00000595279 2058 ntTSL 222.49■■□□□ 1.196e-7■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 STRN4-222ENST00000601869 2240 nt20.81■□□□□ 0.922e-6■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.96e-7■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.822e-6■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 STRN4-208ENST00000594581 2692 ntTSL 219.51■□□□□ 0.712e-6■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.692e-6■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.478e-8■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.458e-8■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.248e-8■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 ANAPC15-207ENST00000538117 580 ntTSL 416.34■□□□□ 0.218e-8■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.188e-8■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 ANAPC15-203ENST00000502597 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.088e-8■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 ANAPC15-201ENST00000227618 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 08e-8■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 ANAPC15-216ENST00000545680 872 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.288e-8■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 NASP-202ENST00000351223 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.483e-15■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 NASP-209ENST00000472408 541 ntTSL 211.97□□□□□ -0.493e-15■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 ANAPC15-211ENST00000542531 812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.588e-8■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 DCTN6-201ENST00000221114 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.693e-15■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 ANAPC15-213ENST00000543050 807 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.818e-8■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 NASP-221ENST00000531612 938 ntAPPRIS ALT2 TSL 59.47□□□□□ -0.893e-15■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 NASP-201ENST00000350030 3207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.923e-15■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 NASP-224ENST00000537798 3097 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.943e-15■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 NASP-203ENST00000372052 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.033e-15■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 NASP-218ENST00000530073 2740 ntTSL 28.61□□□□□ -1.033e-15■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 NASP-223ENST00000534450 632 ntTSL 28.3□□□□□ -1.083e-15■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 DCTN6-204ENST00000522141 820 ntTSL 38.15□□□□□ -1.13e-15■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 NASP-210ENST00000481782 3659 ntTSL 27.87□□□□□ -1.153e-15■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.228e-8■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 DCTN6-206ENST00000523666 878 ntTSL 56.82□□□□□ -1.323e-15■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 TALDO1-207ENST00000532202 270 ntTSL 312.68□□□□□ -0.381e-11■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 PSMD3-202ENST00000415039 1598 ntTSL 224.09■■□□□ 1.456e-49■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.661e-6■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.371e-6■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.081e-6■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.621e-6■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 TRAPPC3-205ENST00000462715 2428 ntTSL 212.66□□□□□ -0.381e-6■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 RPS8-208ENST00000497035 694 ntTSL 317.2■□□□□ 0.344e-50■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.083e-10■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 SCFD1-201ENST00000311943 2016 ntTSL 214.22□□□□□ -0.133e-10■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 SCFD1-206ENST00000484733 2308 ntTSL 514.02□□□□□ -0.163e-10■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 SCFD1-220ENST00000556486 974 ntTSL 212.32□□□□□ -0.443e-10■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 SCFD1-202ENST00000396629 2021 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.723e-10■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 SCFD1-222ENST00000556768 1829 ntTSL 1 (best)8.87□□□□□ -0.993e-10■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 SCFD1-211ENST00000554437 688 ntTSL 37.39□□□□□ -1.233e-10■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 SCFD1-209ENST00000553280 574 ntTSL 27.08□□□□□ -1.283e-10■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.573e-10■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 SCFD1-218ENST00000556256 428 ntTSL 24.94□□□□□ -1.623e-10■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 SCFD1-204ENST00000463622 1943 ntTSL 24.31□□□□□ -1.723e-10■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 ZNF770-201ENST00000356321 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.089e-8■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 HSPA9-201ENST00000297185 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.572e-13■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 HSPA9-202ENST00000501917 275 ntTSL 33.76□□□□□ -1.812e-13■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 MBD3-211ENST00000592965 568 ntTSL 428.28■■■□□ 2.125e-7■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 MBD3-204ENST00000585967 583 ntTSL 420.84■□□□□ 0.935e-7■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 MAF1-204ENST00000532522 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.032e-10■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.726e-10■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 EDF1-201ENST00000224073 640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.046e-10■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.64e-7■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.184e-7■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.634e-7■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.434e-7■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.091e-6■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.239e-7■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.099e-7■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.069e-7■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.069e-7■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.169e-8■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 CTSH-215ENST00000534237 691 ntTSL 313.3□□□□□ -0.289e-8■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.962e-8■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.52e-8■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.932e-8■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 TOP1MT-213ENST00000521193 1960 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.052e-8■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 AES-211ENST00000592330 275 ntTSL 54.77□□□□□ -1.652e-9■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.532e-17■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 COX6B1-202ENST00000392201 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.792e-17■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 COX6B1-203ENST00000590618 290 ntTSL 38.26□□□□□ -1.092e-17■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 CD52-202ENST00000470468 381 ntTSL 34.1□□□□□ -1.759e-21■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 DNAJC4-205ENST00000536006 693 ntTSL 317.51■□□□□ 0.394e-7■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.23e-9■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.013e-9■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.623e-9■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.443e-9■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.263e-9■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.073e-9■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.74e-11■■■□□ 16.3
PABPC4Q13310 ARID1A-212ENST00000636219 7058 ntAPPRIS ALT2 TSL 512.01□□□□□ -0.494e-11■■■□□ 16.3
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