RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464036.5

UBE2J2-210, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 J2, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2J2, Length 1,256 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J2-210ENST00000464036 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.47■■■■■ 6.79
UBE2J2-210ENST00000464036 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.16■■■■■ 5.78
UBE2J2-210ENST00000464036 ABCC9O60706 1549 aa50.2■■■■■ 5.63
UBE2J2-210ENST00000464036 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.19■■■■■ 5.31
UBE2J2-210ENST00000464036 NACADO15069 1562 aa48.09■■■■■ 5.29
UBE2J2-210ENST00000464036 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.03■■■■■ 5.28
UBE2J2-210ENST00000464036 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.85■■■■■ 5.25
UBE2J2-210ENST00000464036 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.75■■■■■ 5.23
UBE2J2-210ENST00000464036 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.51■■■■■ 5.2
UBE2J2-210ENST00000464036 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.2■■■■■ 5.15
UBE2J2-210ENST00000464036 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.87■■■■■ 5.09
UBE2J2-210ENST00000464036 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.81■■■■■ 5.08
UBE2J2-210ENST00000464036 SCRIBQ14160 1630 aa46.71■■■■■ 5.07
UBE2J2-210ENST00000464036 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.21■■■■■ 4.99
UBE2J2-210ENST00000464036 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.19■■■■■ 4.98
UBE2J2-210ENST00000464036 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.54■■■■■ 4.88
UBE2J2-210ENST00000464036 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.41■■■■■ 4.86
UBE2J2-210ENST00000464036 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.08■■■■■ 4.81
UBE2J2-210ENST00000464036 SMARCA4P51532 1647 aa44.64■■■■■ 4.74
UBE2J2-210ENST00000464036 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.53■■■■■ 4.72
UBE2J2-210ENST00000464036 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.4■■■■■ 4.7
UBE2J2-210ENST00000464036 NCAPD3P42695 1498 aa44.38■■■■■ 4.69
UBE2J2-210ENST00000464036 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.33■■■■■ 4.69
UBE2J2-210ENST00000464036 SMARCA2P51531 1590 aa44.32■■■■■ 4.69
UBE2J2-210ENST00000464036 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.18■■■■■ 4.66
UBE2J2-210ENST00000464036 HMGXB3Q12766 1538 aa44.16■■■■■ 4.66
UBE2J2-210ENST00000464036 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.02■■■■■ 4.64
UBE2J2-210ENST00000464036 WIZO95785 1651 aa43.87■■■■■ 4.61
UBE2J2-210ENST00000464036 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.74■■■■■ 4.59
UBE2J2-210ENST00000464036 NESP48681 1621 aa43.43■■■■■ 4.54
UBE2J2-210ENST00000464036 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.34■■■■■ 4.53
UBE2J2-210ENST00000464036 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.24■■■■■ 4.51
UBE2J2-210ENST00000464036 ERCC6Q03468 1493 aa43.22■■■■■ 4.51
UBE2J2-210ENST00000464036 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.07■■■■■ 4.49
UBE2J2-210ENST00000464036 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.93■■■■■ 4.46
UBE2J2-210ENST00000464036 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.91■■■■■ 4.46
UBE2J2-210ENST00000464036 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.84■■■■■ 4.45
UBE2J2-210ENST00000464036 CUX2O14529 1486 aa42.81■■■■■ 4.44
UBE2J2-210ENST00000464036 CFTRP13569 1480 aa42.81■■■■■ 4.44
UBE2J2-210ENST00000464036 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.8■■■■■ 4.44
UBE2J2-210ENST00000464036 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.61■■■■■ 4.41
UBE2J2-210ENST00000464036 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.55■■■■■ 4.4
UBE2J2-210ENST00000464036 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.53■■■■■ 4.4
UBE2J2-210ENST00000464036 PRDM2Q13029 1718 aa42.52■■■■■ 4.4
UBE2J2-210ENST00000464036 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.52■■■■■ 4.4
UBE2J2-210ENST00000464036 WDR62O43379 1518 aa42.41■■■■■ 4.38
UBE2J2-210ENST00000464036 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.23■■■■■ 4.35
UBE2J2-210ENST00000464036 TOPBP1Q92547 1522 aa41.93■■■■■ 4.3
UBE2J2-210ENST00000464036 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.86■■■■■ 4.29
UBE2J2-210ENST00000464036 ABCC8Q09428 1581 aa41.84■■■■■ 4.29
UBE2J2-210ENST00000464036 IFT140Q96RY7 1462 aa41.66■■■■■ 4.26
UBE2J2-210ENST00000464036 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.64■■■■■ 4.26
UBE2J2-210ENST00000464036 CUX1P39880 1505 aa41.59■■■■■ 4.25
UBE2J2-210ENST00000464036 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.56■■■■■ 4.24
UBE2J2-210ENST00000464036 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.54■■■■■ 4.24
UBE2J2-210ENST00000464036 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.5■■■■■ 4.23
UBE2J2-210ENST00000464036 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.45■■■■■ 4.23
UBE2J2-210ENST00000464036 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.41■■■■■ 4.22
UBE2J2-210ENST00000464036 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.37■■■■■ 4.21
UBE2J2-210ENST00000464036 SOGA1O94964 1423 aa41.35■■■■■ 4.21
UBE2J2-210ENST00000464036 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.27■■■■■ 4.27e-8■■■■□ 21.9
UBE2J2-210ENST00000464036 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.22■■■■■ 4.191e-6■■■■■ 58.5
UBE2J2-210ENST00000464036 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.2■■■■■ 4.19
UBE2J2-210ENST00000464036 SYNJ1O43426 1573 aa41.2■■■■■ 4.19
UBE2J2-210ENST00000464036 TOP2BQ02880 1626 aa41.18■■■■■ 4.18
UBE2J2-210ENST00000464036 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.16■■■■■ 4.18
UBE2J2-210ENST00000464036 WDR97A6NE52 1622 aa41.16■■■■■ 4.18
UBE2J2-210ENST00000464036 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.02■■■■■ 4.16
UBE2J2-210ENST00000464036 OSCARQ8IYS5 282 aa40.99■■■■■ 4.15
UBE2J2-210ENST00000464036 CHD1O14646 1710 aa40.9■■■■■ 4.14
UBE2J2-210ENST00000464036 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.9■■■■■ 4.14
UBE2J2-210ENST00000464036 GRIN2BQ13224 1484 aa40.89■■■■■ 4.14
UBE2J2-210ENST00000464036 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.89■■■■■ 4.14
UBE2J2-210ENST00000464036 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.89■■■■■ 4.14
UBE2J2-210ENST00000464036 PBRM1Q86U86 1689 aa40.88■■■■■ 4.13
UBE2J2-210ENST00000464036 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.79■■■■■ 4.12
UBE2J2-210ENST00000464036 FBLN2P98095 1184 aa40.75■■■■■ 4.11
UBE2J2-210ENST00000464036 SYNJ2O15056 1496 aa40.64■■■■■ 4.1
UBE2J2-210ENST00000464036 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.61■■■■■ 4.09
UBE2J2-210ENST00000464036 ADAMTS12P58397 1594 aa40.52■■■■■ 4.08
UBE2J2-210ENST00000464036 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.52■■■■■ 4.08
UBE2J2-210ENST00000464036 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.45■■■■■ 4.07
UBE2J2-210ENST00000464036 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.45■■■■■ 4.07
UBE2J2-210ENST00000464036 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.45■■■■■ 4.07
UBE2J2-210ENST00000464036 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.43■■■■■ 4.06
UBE2J2-210ENST00000464036 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.4■■■■■ 4.06
UBE2J2-210ENST00000464036 ARHGEF11O15085 1522 aa40.39■■■■■ 4.06
UBE2J2-210ENST00000464036 GRIN2AQ12879 1464 aa40.38■■■■■ 4.05
UBE2J2-210ENST00000464036 KIF27Q86VH2 1401 aa40.34■■■■■ 4.05
UBE2J2-210ENST00000464036 TRIM41Q8WV44 630 aa40.25■■■■■ 4.03
UBE2J2-210ENST00000464036 CEP170Q5SW79 1584 aa40.23■■■■■ 4.03
UBE2J2-210ENST00000464036 IGF1RP08069 1367 aa40.23■■■■■ 4.03
UBE2J2-210ENST00000464036 NUP160Q12769 1436 aa40.21■■■■■ 4.03
UBE2J2-210ENST00000464036 CUL7Q14999 1698 aa40.14■■■■■ 4.02
UBE2J2-210ENST00000464036 ARAP1Q96P48 1450 aa40.08■■■■■ 4.01
UBE2J2-210ENST00000464036 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.05■■■■■ 4
UBE2J2-210ENST00000464036 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.98■■■■□ 3.99
UBE2J2-210ENST00000464036 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.97■■■■□ 3.99
UBE2J2-210ENST00000464036 SHROOM2Q13796 1616 aa39.94■■■■□ 3.99
UBE2J2-210ENST00000464036 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.91■■■■□ 3.98
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