RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592965.2

MBD3-211, Transcript of methyl-CpG binding domain protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene MBD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3-211ENST00000592965 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.96■■■■■ 6.87
MBD3-211ENST00000592965 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.93■■■■■ 5.9
MBD3-211ENST00000592965 ABCC9O60706 1549 aa51.39■■■■■ 5.82
MBD3-211ENST00000592965 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.18■■■■■ 5.46
MBD3-211ENST00000592965 NACADO15069 1562 aa48.96■■■■■ 5.43
MBD3-211ENST00000592965 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.54■■■■■ 5.36
MBD3-211ENST00000592965 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.46■■■■■ 5.35
MBD3-211ENST00000592965 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.15■■■■■ 5.3
MBD3-211ENST00000592965 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.11■■■■■ 5.29
MBD3-211ENST00000592965 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.97■■■■■ 5.27
MBD3-211ENST00000592965 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.83■■■■■ 5.25
MBD3-211ENST00000592965 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.8■■■■■ 5.24
MBD3-211ENST00000592965 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.74■■■■■ 5.23
MBD3-211ENST00000592965 SCRIBQ14160 1630 aa47.24■■■■■ 5.15
MBD3-211ENST00000592965 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.22■■■■■ 5.15
MBD3-211ENST00000592965 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.52■■■■■ 5.04
MBD3-211ENST00000592965 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.5■■■■■ 5.04
MBD3-211ENST00000592965 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.28■■■■■ 5
MBD3-211ENST00000592965 NCAPD3P42695 1498 aa45.16■■■■■ 4.82
MBD3-211ENST00000592965 SMARCA4P51532 1647 aa45.15■■■■■ 4.82
MBD3-211ENST00000592965 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.06■■■■■ 4.8
MBD3-211ENST00000592965 SMARCA2P51531 1590 aa45■■■■■ 4.79
MBD3-211ENST00000592965 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.99■■■■■ 4.79
MBD3-211ENST00000592965 HMGXB3Q12766 1538 aa44.91■■■■■ 4.78
MBD3-211ENST00000592965 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.75■■■■■ 4.75
MBD3-211ENST00000592965 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.65■■■■■ 4.74
MBD3-211ENST00000592965 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.64■■■■■ 4.74
MBD3-211ENST00000592965 ERCC6Q03468 1493 aa44.36■■■■■ 4.69
MBD3-211ENST00000592965 NESP48681 1621 aa44.26■■■■■ 4.68
MBD3-211ENST00000592965 CUX2O14529 1486 aa44.21■■■■■ 4.67
MBD3-211ENST00000592965 WIZO95785 1651 aa44.12■■■■■ 4.65
MBD3-211ENST00000592965 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.11■■■■■ 4.65
MBD3-211ENST00000592965 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.85■■■■■ 4.61
MBD3-211ENST00000592965 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.84■■■■■ 4.61
MBD3-211ENST00000592965 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.79■■■■■ 4.6
MBD3-211ENST00000592965 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.78■■■■■ 4.6
MBD3-211ENST00000592965 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.77■■■■■ 4.6
MBD3-211ENST00000592965 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.65■■■■■ 4.58
MBD3-211ENST00000592965 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.64■■■■■ 4.58
MBD3-211ENST00000592965 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.41■■■■■ 4.54
MBD3-211ENST00000592965 CFTRP13569 1480 aa43.38■■■■■ 4.54
MBD3-211ENST00000592965 WDR62O43379 1518 aa43.32■■■■■ 4.53
MBD3-211ENST00000592965 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.31■■■■■ 4.52
MBD3-211ENST00000592965 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.28■■■■■ 4.52
MBD3-211ENST00000592965 PRDM2Q13029 1718 aa43.09■■■■■ 4.49
MBD3-211ENST00000592965 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.08■■■■■ 4.49
MBD3-211ENST00000592965 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.91■■■■■ 4.46
MBD3-211ENST00000592965 TOPBP1Q92547 1522 aa42.52■■■■■ 4.4
MBD3-211ENST00000592965 ABCC8Q09428 1581 aa42.48■■■■■ 4.39
MBD3-211ENST00000592965 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.44■■■■■ 4.38
MBD3-211ENST00000592965 IFT140Q96RY7 1462 aa42.43■■■■■ 4.38
MBD3-211ENST00000592965 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.29■■■■■ 4.36
MBD3-211ENST00000592965 OSCARQ8IYS5 282 aa42.15■■■■■ 4.34
MBD3-211ENST00000592965 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.15■■■■■ 4.34
MBD3-211ENST00000592965 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.14■■■■■ 4.34
MBD3-211ENST00000592965 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.11■■■■■ 4.33
MBD3-211ENST00000592965 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.05■■■■■ 4.32
MBD3-211ENST00000592965 CUX1P39880 1505 aa41.94■■■■■ 4.3
MBD3-211ENST00000592965 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.93■■■■■ 4.33e-9■■■■□ 20.6
MBD3-211ENST00000592965 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.9■■■■■ 4.3
MBD3-211ENST00000592965 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.89■■■■■ 4.3
MBD3-211ENST00000592965 SOGA1O94964 1423 aa41.87■■■■■ 4.29
MBD3-211ENST00000592965 TRIM41Q8WV44 630 aa41.82■■■■■ 4.29
MBD3-211ENST00000592965 WDR97A6NE52 1622 aa41.81■■■■■ 4.28
MBD3-211ENST00000592965 CHD1O14646 1710 aa41.76■■■■■ 4.28
MBD3-211ENST00000592965 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.72■■■■■ 4.27
MBD3-211ENST00000592965 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.65■■■■■ 4.26
MBD3-211ENST00000592965 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.65■■■■■ 4.26
MBD3-211ENST00000592965 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.65■■■■■ 4.26
MBD3-211ENST00000592965 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.56■■■■■ 4.24
MBD3-211ENST00000592965 ARHGEF11O15085 1522 aa41.55■■■■■ 4.24
MBD3-211ENST00000592965 GRIN2BQ13224 1484 aa41.52■■■■■ 4.24
MBD3-211ENST00000592965 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.51■■■■■ 4.24
MBD3-211ENST00000592965 FBLN2P98095 1184 aa41.5■■■■■ 4.23
MBD3-211ENST00000592965 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.47■■■■■ 4.23
MBD3-211ENST00000592965 PBRM1Q86U86 1689 aa41.43■■■■■ 4.22
MBD3-211ENST00000592965 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.42■■■■■ 4.22
MBD3-211ENST00000592965 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.41■■■■■ 4.22
MBD3-211ENST00000592965 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.4■■■■■ 4.22
MBD3-211ENST00000592965 TOP2BQ02880 1626 aa41.4■■■■■ 4.22
MBD3-211ENST00000592965 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.35■■■■■ 4.21
MBD3-211ENST00000592965 SYNJ2O15056 1496 aa41.34■■■■■ 4.21
MBD3-211ENST00000592965 SYNJ1O43426 1573 aa41.33■■■■■ 4.21
MBD3-211ENST00000592965 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.3■■■■■ 4.2
MBD3-211ENST00000592965 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.29■■■■■ 4.2
MBD3-211ENST00000592965 ARAP1Q96P48 1450 aa41.17■■■■■ 4.18
MBD3-211ENST00000592965 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.1■■■■■ 4.17
MBD3-211ENST00000592965 ADAMTS12P58397 1594 aa41.07■■■■■ 4.16
MBD3-211ENST00000592965 GRIN2AQ12879 1464 aa40.99■■■■■ 4.15
MBD3-211ENST00000592965 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.98■■■■■ 4.15
MBD3-211ENST00000592965 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.91■■■■■ 4.14
MBD3-211ENST00000592965 NUP160Q12769 1436 aa40.85■■■■■ 4.13
MBD3-211ENST00000592965 CEP170Q5SW79 1584 aa40.82■■■■■ 4.13
MBD3-211ENST00000592965 SHROOM2Q13796 1616 aa40.67■■■■■ 4.1
MBD3-211ENST00000592965 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.62■■■■■ 4.09
MBD3-211ENST00000592965 KIF27Q86VH2 1401 aa40.56■■■■■ 4.08
MBD3-211ENST00000592965 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.49■■■■■ 4.07
MBD3-211ENST00000592965 CUL7Q14999 1698 aa40.48■■■■■ 4.07
MBD3-211ENST00000592965 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.47■■■■■ 4.07
MBD3-211ENST00000592965 IGF1RP08069 1367 aa40.46■■■■■ 4.07
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